前往澎湖
1.搭飛機
若選擇搭飛機前往澎湖，則有立榮、華信、遠東的航空公司可以選擇，而您可以根據您的居住地來選擇最近的地點搭乘飛機，一般來說有台北松山機場、台中、嘉義及台南機場等可供選擇，以上會有直達澎湖馬公機場的班次，抵達澎湖後再轉乘公車或交通船前往您想要到的島嶼或地方，票價會隨季節不同而有變化。
2.搭船
一般來說，可以從嘉義或高雄兩個地點乘船搭往澎湖，而有海天星航運及台華輪兩家公司供您選擇，而船班會抵達澎湖馬公位於臨海路上的港口。
前往吉貝
普遍會選擇搭交通船的方式，一般在赤崁北海遊客中心出發，航程約15分鐘，該地有公營交通船及民營快艇，分別是白沙之星、吉貝之星以及民營的金八達/瑞泰真美/名揚/新北海等。票價150~200元不等，依是否為居民的身分別而有差異，船班可能依當天的天氣而有所改變，建議去之前仍逕自向服務台詢問為佳。