Ο πεπτιδικός δεσμός αναπτύσσεται μεταξύ δύο διαδοχικών αμινοξέων με μια αντίδραση συμπύκνωσης (αφαίρεση ενός μορίου νερού) μεταξύ της καρβοξυλομάδας του ενός αμινοξέος και της αμινομάδας του επόμενου. Αποτέλεσμα αυτής της ένωσης είναι ένα διπεπτίδιο.

Ισχύει ότι πεπτιδικοί δεσμοί = αμινοξέα - 1.