一級結構:由特定胺基酸序列形成,稱為多肽鏈﹝peptide﹞,其序列可長可短。
二級結構:經由氫鍵形成a-helix和B-pleated sheet連接多條多肽鏈。
三級結構:數條多肽鏈藉由凡得瓦力、雙硫鍵、疏水性作用力相互連接,可為有功能的小分子蛋白質。
四級結構:數個三級結構相護聚合鍵接,成為具有完整功能的大分子蛋白質。
距離參數:為影響距離的因子