z20210404-WIV1xRaTG13_CN

蝙蝠RaTG13太好了、好得难以置信。

直言简评，2021-04-04.

https://sites.google.com/site/zhiyanleback/2021-1/z20210404-wiv1xratg13_cn

英文版：

https://sites.google.com/site/zhiyanleback/2021-1/z20210404-wiv1xratg13

https://zhiyanleback.blogspot.com/p/ratg13-is-too-good-to-be-true.html

世卫组织关于SARS-2起源的中国调查报告表明RaTG13是自然界的SARS-2起源。他们的结论基于：1]：RaTG13具有96.2％的相似度，这是在单基因比对水平上完成的； 2]：只有一个氨基酸或蛋白的差异，这是在蛋白质比对水平上完成的。

那个结论可能并不正确。原因：在密码子水平上的相似同源及其分析被完全忽略，而这可能导致不同的结论。让我们举个例子，我们有两个具有相同Am-Acid但密码子不同的基因组序列：

它们在氨基酸或蛋白水平上的相似度为100％，在单个基因比对水平上为56％。见下：

然而，它们在密码子级别上的相似度为0％，而且，它们的结构不同：

哪个正确？在我看，密码子水平比对是正确的。缘故很简单：当病毒和ACE2运行时，它们在密码子水平互动发生作用。给定样本可能具有相同的氨基酸或蛋白，但不同密码子意味着结构和能量可能大不相同。这一点，二进制图像密码子表和巴基球系统可以很好地解释。

密码子水平考察分析的必要。

让我们在密码子水平来看看相关新冠病毒样本（NIH GenBank ID）：

•NC_045512：WH-01，基本样品，是从中国武汉医院的一名患者中收集的。

•MN996532：蝙蝠RaTG13，据说是SARS-2的最可能起源。

•KF367457：WIV1，SARS类型新冠病毒，实验室人工嵌合体系列中的第一个。

•NC_028824，蝙蝠-2012，天然蝙蝠，中国云南，2012年收集。

•NC_030886，蝙蝠2014年。天然蝙蝠，中国云南采集，2014年。

若说RaTG13是2013年采集的自然蝙蝠，那么，它的表现应该与两种天然蝙蝠样品Bat-2012和Bat-2014相同或非常接近。

在全系列密码子水平上，与基本样本WH-01（NC_045512）比对，RaTG13得分为184、WIV1得分为190。这是它们的出现频率和分布的比对：

Table 01:

结果：WIV1具有总差异[-54]和平均差异[-14]，而RaTG13具有[-206]和[-53]的差异。 Bat-2012和Bat-2014的差异更大。

显然，WIV1是最接近基础样本的，这意味着它的SARS-2起源的可能性明显大于RaTG13，而后者的表现与天然蝙蝠样本有明显不同。

RaTG13：太好了而不能作为新冠病毒的病源。

根据PRC-PLA医生陈薇（中国杰出的的病毒学科学家和新冠疫苗研发者），该指标密码子及其遗传频率和分布非常重要，缘故：它直接表明了亲和力、稳定性和突变状态及趋势之间的相似性或差异，尤其是基因C和G的数量和分布。

S基因是SARS-2与人体相互作用的关键因素。让我们借用陈薇博士的说明、在密码子水平做一些考察研究。以下是所采集样本之间的相似之处。

Fig. 01:

确实，正如陈薇博士所说的那样，基因C和G及其数量和分布都起着重要作用，特别是在密码子3 BP基因中（注意：基因A和T的频率为0。）。

与基本样本NC_045512做三个基础基因综合平均比对，WIV1的相似比率为0.9866，RaTG13的为0.9969。与天然蝙蝠（Bat-2012和Bat-2014）相比，后者的比例为0.8892，而另一种的比例为1.0134，明显超出作为SARS-2起源的范围。可说，样本RaTG13与天然蝙蝠非常不同（难说其来自自然）。

此外，以下是密码子水平的比对结果：

Table 02:

样本RaTG13得分为693，其它得分为87至96。这差距实在太大，无法相信RaTG13来自自然。然而，在实验室人工条件下，很容易达到甚至超过693得分。使用NIH-BLAST搜索RaTG13的所有可能同源相似度，结果没有天然蝙蝠，而是三类：合成构建体，克隆和疫苗，都是实验室人为的产品。

总之，在搜索SARS-2来源时，密码子水平的指标应在考虑之内。在这个水平，结论与世界卫生组织报告中所说的可能完全不同。或说，样本RaTG13太完美了，难以置信它是天然蝙蝠SARS-2的来源，相反，它很可能是实验室产品。就各个指标而言，特别是在密码子水平上，WIV1与基本样本NC_044512的关系最密切，即WIV1才是最可能的SARS-2的起源。

参考：来自军医疫苗专利的信息。

Message from PLA Vaccine Patent. 2021-03-15.

https://sites.google.com/site/zhiyanleback/2021-1/z20210315-patent-message-en