生物多樣性包括社區綠網系統、表土保存技術、生態水池水
域、邊坡 / 圍籬設計和多孔隙環境所造就的小生物棲息環境。本校採用跳島概念，希望鳥類、昆蟲類等能從三峽山區，越過馬路後，到北大特區行道樹、台北大學綠地等休憩，在跨越馬路進入校園。
由於建校時校長、主任到老師的規劃良善，因此環境綠化量非常豐富，生物慢慢呈現多樣性的風貌。