7. Identificación por Biología Molecular
Contenidos: Extracción de ácidos nucleicos de células fúngicas y bacterianas. Amplificación de regiones barcode del DNA microbiano mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Detección de amplicones específicos por electroforesis en gel de agarosa. Secuenciación y comparación de secuencias en las bases de datos para identificación de género y especie.
Fundamento: El diagnóstico molecular se basa principalmente en dos grandes pilares: la hibridación de los ácidos nucleicos y los métodos de amplificación de los mismos.
Objetivos concretos:
- Utilizar un sistema comercial para lisar células fúngicas y bacterianas y extraer el ácido desoxirribonucleico (ADN) de ambas.
- Aplicar la técnica de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para amplificar regiones del ADN que contienen secuencias identificativas de la especie.
- Comparar las secuencias obtenidas con las presentes en las bases de datos en busca del mayor grado de coincidencia, para obtener la identificación de la especie.
Realización práctica:
Cada mesa dispone de una levadura (práctica VI) y una bacteria problema (práctica VIII). Las mesas pares utilizarán la levadura y las impares la bacteria correspondiente.
Microorganismos: Bacteria, Hongo, Virus, ….
Secuenciación del amplicón
Comparación de secuencias con las bases de datos