Rus ЯR

Четверг, 15 Апреля 2010

Новые хитрушки секвенирования генома

Секвенирование используется для отслеживать изменения иммунной системы с течением времени, для оценки экспрессии генов и анализа трансляции белка.

По Эмили Сингер

Теперь, быстро и недорого последовательности легко доступны, ученые применяют его в ряд творческих путей. Подробная информация о некоторых из этих усилий, возникла на конференции по биологии сети на этой неделе в широкий института в Кембридже, штат Массачусетс.

Георг Чёрч, директор Проект персональный геном (PGP)* и пионером технологий в области геномики в Гарварде, использует для отслеживания последовательности "одноиммунный след" - как изменения систем человека иммунной с течением времени. В сотрудничестве с Рош, его команда проводит анализ антител у людей до и после прививки для гриппа и гепатита B. "У нас есть два года данных о вакцинах от волонтеров PGP, сказал он на конференции. "Мы видим интересные результаты отражают вакцины мы использовали".

Стивен Тернер , основатель и главный технический директор Гражданских Бионаук (Pacific Biosciences)**, обсудили в последовательности машину своей компании, планируется начать отгрузки в первом получателей в ближайшие несколько недель. В сотрудничестве с "Нью-Йорк Департамент здравоохранения, ученые использовали технологию для анализа штаммов гриппа у отдельных больных в течение H1N1 вспышки. "Мы могли бы перейти от добычи от пациента к напечатанному доклад в руках эпидемиолог примерно в девять часов", говорит Тернер. методы анализа Быстрый поможет общественных усилий системы здравоохранения.

Тернер также описаны два новых приложений для машин Гражданских биологических наук последовательности: обнаружение структуры метилирования белка и отслеживание трансляции. Метилирования является одной из ключевых мер в быстро развивающейся области эпигенетика, в широком смысле в качестве молекулярных изменений, которые влияют на экспрессию генов, но не сама последовательность ДНК. Именно эти изменения, которые позволят генетически идентичных клеток развиваться в обоих клеток мозга и клеток крови и были связаны с обучения, наркомании, рака и ожирения среди множества других состояний. Метилирования является механизмом для изменения экспрессии генов, включение и выключение определенных генов. Технологий Гражданских биологических наук читает последовательность ДНК, обнаруживая добавлением одной базы на отдельные молекулы ДНК. Ученые обнаружили, что время, которое требуется для этой базы будет добавил зависит от того, молекула метилированную в этой позиции, позволяет обнаружить паттерны метилирования в реальном времени.

Во втором применения новых, разработанных в сотрудничестве с Джо Puglisi в Стэнфордском университете, ученые адаптировали технология секвенирования наблюдать рибосомы - молекулярной машины, которая переводит РНК в белках. Исследования были опубликованы сегодня в журнале " Природа***. Первоначально техника {ЯR: ZMW****} будет использоваться для изучения процесса трансляции. Но Тернер сказал однажды может быть использован для изучения с объектом воздействия наркотиков, например, посредством изучения конкретных наркотиков изменены трансляции, не являющихся объектом белков.

Оба Чёрч и Тернер обратились к следующему этапу для геномики технологий; портативное устройство анализа последовательностей. Чёрч предсказал демонстрации устройства в течение ближайших двух лет, оседая на Ион Torrent в качестве наиболее вероятного лидера. Тернер предсказал, что следующее поколение Гражданских биологических наук машина последовательности могла быть.