Los módulos principales están divididos en las principales tareas que conlleva la realización de una simulación. Dentro de cada apartado encontraremos las opciones para poder configurar cada uno de ellos. VDBLab está pensado para trabajar de manera no destructiva, esto implica que en cualquier momento podemos volver a entrar a un modulo ya configurado y cambiar parámetros si fuese necesario sin necesidad de volver a empezar desde el principio. No es obligatorio utilizar todos los módulos disponibles en tu simulación, solo los que la propia simulación necesite por sus características.