Biji umumnya dapat dibedakan menjadi bagian-bagian berikut:
c. Inti biji atau isi biji (nucleus seminis)
Pada dasarnya, struktur biji tidak jauh berbeda dengan struktur bakal biji. Namun, bagian-bagian yang sama asalnya diberi nama yang berbeda setelah mengalami perkembangan. Seperti integumen pada bakal biji berubah menjadi kulit biji (spermodermis) ketika bakal biji berkembang menjadi biji.