작품 내 남자 주인공
내성적이고 조용하며 자립심이 강한 성격이고 정의감이 뛰어나다. 공부, 연구 등 지식을 탐구하는 활동을 좋아한다. 고등학생 수준을 뛰어넘은 지식을 가지고 있으며 AI, 인터넷 등에 전문가를 웃도는 수준의 지식을 가지고 있다. 이를 사용하여 정부와의 전면전에서 데이터베이스 삭제라는 중요한 임무를 맡게 된다.
마코토는 에이온에서 제작한 마법 AI의 첫 사용자이다. 해당 기체의 명칭은 마코토의 고유 코드 A0018-ACT이며, 마코토는 에이토 라는 이름을 지어주었다. 원래는 정부의 AI를 구매하고 싶었으나, 형편이 좋지 못해 구매할 수 없었다. 에이온에서 첫 마법 AI를 제작하여 이를 상용화하기 전 테스트를 담당할 대상자를 뽑고 있었는데, 그 조건이 이전까지 'AI 기체를 사용해본 적이 없는 자'였고, 마코토는 약간의 기대를 가지며 지원해 선정된다.
성격 때문에 친구가 없다. 때문에 외로움을 많이 탔는데, 에이토가 생긴 뒤로는 에이토를 친구이자 가족처럼 대하며 이전보다 대화도 원활하게 할 수 있게 됐다. 표현력도 많이 늘었으며 자신의 의견을 주장할 수 있는 정도로 성장한다. 이후에도 마코토만이 가능한 임무를 맡게 되며 책임감이나 자신감도 많은 성장을 이루게 된다.
마코토는 아버지에 대한 기억이 거의 없는데, 이는 일방적으로 마코토를 싫어했던 아버지와의 관계와 더불어 마코토가 어릴 때 업무로 집에 잘 들어오지 않았고, 업무 중에 사망했다는 소식만 전달 받았기 때문이다.