International Symposium on Mathematical Modeling in Virology and Epidemiology

January 29-31, 2013

Hokkaido University, Sapporo, Japan

The focus of the symposium is directed to develop mathematical models to understand the infection processes of viruses in a host in the face of immune defense, as well as its spread in a host population. Particular attention will be paid for integrating the theories with the experimental and epidemiological data.

Topic1:Modeling intracellular viral replication and host competency

Topic2:Forecasting antigenic change of influenza virus

Topic3:Modeling HIV infection in humanized mice

Topic4:Modeling immune regulation, affinity maturation, and molecular mimicry

Topic5:Multiscale structured modeling to estimate epidemiological parameters of human infectious diseases

Speakers include

Hiroshi Nishiura (Hong Kong U)

Yoshiuki Suzuki (Nagoya City U)

Shuhei Miyashita (JST)

Teruaki Watabe (Kochi U)

Koichi Saeki (RIKEN)

Kimihito Ito (Hokkaido U)

Shingo Iwami (Kyushu U)

Akira Sasaki (Sokendai)

Hiroshi Haeno (Harvard U)

Keiichiro Tokita (Osaka U)

Shinji Nakaoka (RIKEN)

Kenta Yashima (Meiji U)

Kei Sato (Kyoto U)

Chief Organizer

Akira Sasaki, Ph D

Professor of Mathematical Biology

Faculty of Evolutionary Studies of Biosystems

Graduate University for Advanced Studies

Hayama, Kanagawa, 240-0193, Japan

sasaki_akira@soken.ac.jp

+81-46-858-1537

プログラム

研究集会「ウイルス感染と宿主防御の数理モデルの新展開」

日程: 2013 年 1 月 29 日(火)13:00 ~1 月 31 日(木)12:30

開催場所: 〒001-0021 札幌市北区北 21 条西 10 丁目

北海道大学創成科学研究機構5階大会議室

アクセス: http://www.cris.hokudai.ac.jp/cris/location-access/

世話人 : 佐々木顕(総研大・先導研)

岩見真吾(九大・理・数理生物)

伊藤公人(北大・人獣共通感染症リサーチセンター)

------ 1日目 1 月 29 日(火) プログラム ------

13:00-13:20:受付

13:20-13:30:開会あいさつ

13:30-14:00 Track forecasting of the coevolution process of virus and host immunity

Akira Sasaki (Graduate University for Advanced Studies)

ウイルスと宿主免疫の共進化過程の進路予報

佐々木顕 (総研大)

14:00-14:30 Predicting the antigenic change of influenza A viruses through data assimilation

Kimihito Ito (Hokkaido University)

データ同化によるインフルエンザウイルスの抗原変異予測

伊藤公人 (北大)

14:30-15:00 Coffee Break

15:00-15:30 Evolution of complementary nucleotides in 5’ and 3’ untranslated regions of influenza A virus genomic segments

Yoshiyuki Suzuki (Nagoya City University)

インフルエンザ A 型ウイルスゲノム分節の 5'ならびに 3'非翻訳領域における相補的塩基の進化)

鈴木善幸 (名市大)

15:30-16:00 The evolution of cancer and viruses in the body

Hiroshi Haeno (Kyushu University)

がんとウイルスの生体内での進化

波江野洋 (九大)

16:00-16:30 Coffee Break

16:30-17:00 Consideration of TCR cross-reactivity and role of regulatory T cells

Koichi Saeki (RIKEN)

T 細胞の抗原特性と制御性 T 細胞の役割

佐伯晃一(理研)

17:00-17:30 Stochastic simulations for T cell differentiation and proliferation dynamics

Shinji Nakaoka (RIKEN)

T 細胞の分化・増殖ダイナミクスの確率シミュレーション

中岡慎治(理研)

19:00- 懇親会1

----- 2 日目 1 月 30 日(水) プログラム -----

9:30-10:00 Spatio-temporal fluctuation of selection pressure on the influenza

hemagglutinin protein based on the hierarchical Bayesian model

Teruaki Watabe (Kochi University)

階層ベイズモデルを用いた選択圧の時空間揺らぎ検出とインフルエンザヘマグルチニンへの適用

渡部輝明(高知大)

10:00-10:30 Characterization of amino acid substitutions on influenza virus surface proteins: A computational structural biology approach

Manabu Igarashi (Hokkaido University)

計算科学的手法を用いたインフルエンザウイルス蛋白質の解析

五十嵐学(北大)

10:30-11:00 Coffee Break

11:00-11:30 Novel trials for the investigation of viral replication dynamics using humanized mouse model: past and future

Kei Sato (Kyoto University

ヒト化マウスモデルを用いたウイルス複製ダイナミクスの解明:これまでの研究とこれからの研究

佐藤佳(京大)

11:30-12:00 Function of Vpu among HIV-1 human-to-human spread

Shingo Iwami (Kyushu University)

HIV-1 伝播における Vpu 機能の探索-多階層的アプローチ-

岩見真吾(九大)

12:00-13:30 Lunch Break

13:30-14:00 Quantification of Vpu function in humanized mouse based on mathematical modeling

Hiroki Ikeda (Kyushu University)

数理モデルを用いたヒト化マウス生体内における Vpu 機能の定量的解析

池田裕宜(九大)

14:00-14:30 Mechanism-based analysis of drug combination effect on hepatitis C virus replication in Huh-7 cells

Yoshiki Koizumi (Kyushu University)

抗ウィルス剤の薬効評価系確立に向けた理論構築

小泉吉輝(九大)

14:30-15:00 Coffee Break

15:00-15:30 Quantifying the transmission dynamics using biomarker

Hiroshi Nishiura (The University of Hong Kong)

バイオマーカーを利用した疫学動態の定量化

西浦博(香港大)

15:30-16:00 Epidemic process over the commute network in metropolitan area

Kenta Yashima (Meiji University)

大都市圏の交通流動に乗った感染症流行過程

八島健太(明治大)

16:00-16:30 Coffee Break

16:30-17:30 CZC 設備見学ツアー

19:00- 懇親会 2

----- 3日目 1 月 31 日(木) プログラム -----

10:00-10:30 A mathematical model of molecular mimicry and autoimmune disease

Masuda Megumi (Osaka University)

分子擬態と自己免疫疾患の数理モデル

増田愛(阪大)

10:30-11:00 Evaluation of the antigenicity of influenza virus using an in silica immune-response model

Keisuke Ueno (Hokkaido University)

In silico 免疫応答モデルによるインフルエンザウイルスの抗原性評価

上野恵介(北大)

11:00-11:30 Appropriate MOI for viruses

Shuhei Miyashita (National Institute of Agrobiological Sciences)

ウイルスにとって適切な MOI (multiplicity of infection)

宮下脩平(生物研)

11:30 閉会