Yu Uchiumi
Yu Uchiumi, Postdoctoral researcher
Yu Uchiumi（内海 邑）came to SOKENDAI in 2018 as a postdoctoral researcher.
E-mail: uchiumi_yu[at]soken.ac.jp
Research interests
I'm interested in evolution of mutualistic symbiosis.
Recently I've been trying to the following problems.
Evolution of sanction, partner choice and self-abortion
Evolution towards symbiogenesis
Education
Apr. 2013 – Mar. 2018
Department of Evolutionary Studies of Biosystems, SOKENDAI (The Graduate University for Advanced Studies)
総合研究大学院大学 生命共生体進化学専攻
Apr. 2009 – Mar. 2013
College of Biological Sciences, The University of Tsukuba
筑波大学 生物学類
Apr. 2006 – Mar. 2009
Chiba Prefectural Higashi-Katsushika High School
千葉県立東葛飾高等学校
Employment
Dec. 2018 – present
School of Advanced Sciences, SOKENDAI: Post-doctoral researcher
総合研究大学院大学先導科学研究科 特別研究員
Apr. 2018 – Nov. 2018
Meiji Institute for Advanced Study of Mathematical Sciences, Meiji University: Post-doctoral fellow
明治大学先端数理科学インスティテュート 研究推進員（ポスト・ドクター）
Apr. 2015 – Mar. 2018
Japan Society for the Promotion of Science: JSPS Research Fellow（DC1）
日本学術振興会特別研究員（DC1）
Jun. 2014 – Jan. 2015
Jun. 2013 – Jan. 2014
School of Advanced Sciences, SOKENDAI: Research Assistant
総合研究大学院大学先導科学研究科 リサーチ・アシスタント
Apr. 2011 – Mar. 2013
物質材料研究機構電子顕微鏡ステーション 研究業務員
Publications
Uchiumi, Y*. & Sasaki, A. "Evolution of division of labour in mutualistic symbiosis." Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, (2020), 287, 20200669, doi:10.1098/rspb.2020.0669
Uchiumi, Y*., Ohtsuki, H. & Sasaki, A. "Evolution of self-limited cell division of symbionts." Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, (2019), 286, 20182238, doi:10.1098/rspb.2018.2238
Uchiumi, Y*., Ohtsuki, H. & Sasaki, A. "Evolutionary emergence and maintenance of horizontally transmitted mutualism that do not rely on the supply of standing variation in symbiont quality." Journal of Evolutionary Biology, (2017), 30, 2211-2221, doi:10.1111/jeb.13187
Awards
ポスター発表 優秀賞（2018 年 3 月; 第 65 回日本生態学会大会）
Poster Award (September, 2016; The 2016 (26th) annual meeting of The Japanese Society for Mathematical Biology)
Symposia Organized
別所和博, 内海邑, 小林和也, 安岡法子, 和田哲: "性が駆動する進化と生態：ゲノムから群集まで"（自由集会 W21）第 65 回日本生態学会大会, 札幌コンベンションセンター, 北海道. 2018 年 3 月 14 日 - 18 日
Organizer: The SOKENDAI Life Science Retreat 2016
Presentations
International Conferences and Workshops
*Yu Uchiumi:
"Evolutionary maintenance of horizontally transmitted mutualism without frequent mutations" (Oral, Invited)
Recent Progresses in Mathematical Theories for Biological Phenomena, Utop Ubless Hotel, Jeju, Korea, October 31 – November 3, 2018.
*Yu Uchiumi, Hisashi Ohtsuki, Akira Sasaki:
"Coevolution of horizontally transmitted mutualism" (Oral, Minisymposium M23 “Recent progress in evolutionary theory: Coevolution, diversity, and networks")
2018 Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology & the Japanese Society for Mathematical Biology, The University of Sydney, Sydney, Australia, July 8 – 12, 2018.
*Yu Uchiumi, Hisashi Ohtsuki, Akira Sasaki:
"Evolution of vertical transmission through self-restrained cell division of symbionts" (Poster 23 in symposium 31 "Evolution across the mutualist-parasite continuum")
The 2017 Congress of the European Society for Evolutionary Biology, MartiniPlaza, Groningen, Netherlands. August 20-25, 2017.
*Yu Uchiumi, Hisashi Ohtsuki, Akira Sasaki:
"Evolution of vertical transmission through self-restrained cell division of symbionts" (Poster)
Modelling Biological Evolution 2017: Developing Novel Approaches, University of Leicester, Leicester, UK. April 4-7, 2017.
*Yu Uchiumi, Hisashi Ohtsuki, Akira Sasaki:
"Evolution of vertical transmission of symbionts by reducing the rate of cell division" (Poster P23)
The 13th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis, Kyoto Prefectural University, Kyoto, Japan. September 10-14, 2016.
*Yu Uchiumi, Hisashi Ohtsuki, Akira Sasaki:
"Hosts end up destabilizing horizontally transmitted mutualism by resampling new symbionts after discrimination" (Oral session: CT-12-PM-05 Evolution 2)
10th European Conference on Mathematical & Theoretical Biology and SMB Annual Meeting, University of Nottingham, Nottingham, UK. July 11-15, 2016.
*Yu Uchiumi, Hisashi Ohtsuki, Akira Sasaki:
"Comparison of evolutionary dynamics between two types of host-sanction against cheating symbionts"（Poster P71）
2nd International Symposium & 4th Annual Research Meeting on Matryoshka-type Evolution of Eukaryotic Cells, University of Tsukuba, Ibaraki, Japan. September 30 - October 2, 2015.
*Yu Uchiumi, Hisashi Ohtsuki, Akira Sasaki:
"Evolutionary arm races in recognition signals of symbiotic partners: mutualists vs. parasites"（Oral O5-5）
2015 Joint Meeting of JSMB and CJK Colloquium on Mathematical Biology, Doshisha University, Kyoto, Japan. August 26 - 29, 2015.
*Yu Uchiumi, Akira Sasaki, Hisashi Ohtsuki:
"Host-symbiont coevolution in mutualisms enforced by sanction"（Poster PS39）
Joint Annual Meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology and the Society for Mathematical Biology, Osaka International Convention Center, Osaka, Japan. July 28 - August 1, 2014.
Japanese Conferences and Workshops
*内海邑:
"細胞内共生者における分裂自粛の進化と毒性の進化"（口頭発表）
研究集会「数理生物学の歩みとこれからの展望」, ビジョンセンター横浜, 神奈川. 2019 年 9 月 28 日
*内海邑, 佐々木顕:
"相利共生系における分業の進化"（口頭発表 O-07）
第 29 回日本数理生物学会大会, 東京工業大学, 東京. 2019 年 9 月 14 日 – 16 日
*Uchiumi, Y.:
"Evolutionary emergence and maintenance of mutualistic symbiosis"（口頭発表）
第 29 回CMMA月例セミナー, 明治大学, 東京. 2018 年 11 月 21 日
*内海邑:
"相利共生系の成立と進化的維持"（口頭発表）
第61回つくば進化生態学セミナー, 筑波大学, 茨城. 2018 年 10 月 26 日
*Uchiumi, Y.:
"Evolution of symbionts to limit their own cell division for reproductive synchrony with the host"（口頭発表）
MIMS Café Seminar, Meiji University, Tokyo, July 20, 2018
*Uchiumi, Y.:
"Evolutionary emergence and maintenance of discrimination in mutualistic symbiosis"（口頭発表）
Applied Analysis Tutorial Seminar at Nakano, Meiji University, Tokyo, Japan, May 30, 2018
*内海邑, 大槻久, 佐々木顕:
"共生による宿主のニッチシフトが共生者の伝達様式の進化におよぼす影響"（ポスター発表 P2-100）
第 65 回日本生態学会大会, 札幌コンベンションセンター, 北海道. 2018 年 3 月 14 日 - 18 日
*内海邑, 別所和博, 佐々木顕:
"種子植物の胚乳形成におけるゲノムコンフリクト"（口頭発表 W21-1, 自由集会 "性が駆動する進化と生態：ゲノムから群集まで" W21）
第 65 回日本生態学会大会, 札幌コンベンションセンター, 北海道. 2018 年 3 月 14 日 - 18 日
*内海邑, 大槻久, 佐々木顕:
"共生による宿主のニッチシフトが共生者の伝達様式の進化におよぼす影響"（口頭発表 T04）
第 50 回日本原生生物学会大会 第 1 回日本共生生物学会大会, 筑波大学, 茨城. 2017 年 11 月 17 日 - 19 日
*内海邑, 別所和博, 佐々木顕:
"ゲノムコンフリクトが引き起こす胚乳の倍数性と重複受精の進化"（口頭発表 O-02）
第 27 回日本数理生物学会年会, 北海道大学, 北海道. 2017 年 10 月 6 日 - 8 日
*内海邑, 大槻久, 佐々木顕:
"共生者分裂率をめぐる宿主と細胞内共生者の共進化"（口頭発表 B15）
第 41 回日本藻類学会大会, 高知大学, 高知. 2017 年 3 月 23 日 - 25 日
*内海邑, 大槻久, 佐々木顕:
"共生者分裂率をめぐる宿主と細胞内共生者の共進化"（ポスター発表 P1-A-013）
第 64 回日本生態学会大会, 早稲田大学, 東京. 2017 年 3 月 14 日 - 18 日
*Yu Uchiumi, Hisashi Ohtsuki, Akira Sasaki:
"Evolution of vertical transmission of symbionts by reducing the rate of cell division" (Poster)
The SOKENDAI Life Science Retreat 2016, Hotel Kuwarubi, Yamanashi. October 24-25, 2016.
*Yu Uchiumi, Hisashi Ohtsuki, Akira Sasaki:
"Resampling after discrimination destabilizes mutualism" (Oral 8B2-S12-3, Mini-symposia "Horizon of mutualism studies" 8B2-S12)
The 2016 (26th) annual meeting of The Japanese Society for Mathematical Biology, Kyushu University, Kyushu. September 7-9, 2016.
*Yu Uchiumi, Hisashi Ohtsuki, Akira Sasaki:
"Evolution of vertical transmission of symbionts by reducing the rate of cell division" (Poster P-20)
The 2016 (26th) annual meeting of The Japanese Society for Mathematical Biology, Kyushu University, Kyushu. September 7-9, 2016.
*内海邑, 大槻久, 佐々木顕:
"細胞内共生者は増殖を自粛するか"（ポスター発表 P1-163）
第 63 回日本生態学会大会, 仙台国際センター, 宮城. 2016 年 3 月 20日 - 24 日
内海邑, *佐々木顕:
"共生シグナルの複雑さと特異性の進化"（口頭発表 J3-25）
第 63 回日本生態学会大会, 仙台国際センター, 宮城. 2016 年 3 月 20日 - 24 日
*内海邑, 大槻久, 佐々木顕:
"共生相手を認識するための暗号の複雑さの進化"（ポスター PA1-169）
第 62 回日本生態学会大会, 鹿児島大学, 鹿児島. 2015 年 3 月 18 日 - 22 日
*内海邑, 大槻久, 佐々木顕:
"相利共生系での制裁の進化における多様性の役割"（口頭発表）
ゲーム理論ワークショップ 2015, 京都大学, 京都. 2015 年 3 月 6 日 - 7 日
*Yu Uchiumi, Akira Sasaki, Hisashi Ohtsuki:
"Host-Symbiont Coevolution in Mutualisms Enforced by Sanction"（Poster B-10）
The 11th SOKENDAI Life Science Retreat, Yamaha Resort Tsumagoi, Shizuoka, Japan. October 16 - 17, 2014
*内海邑, 佐々木顕:
"水平伝播によって共生相手を更新する双利共生系の維持機構"（ポスター PA2-015）
第 61 回日本生態学会大会, 広島国際会議場, 広島. 2014 年 3 月 14 日 - 18 日
Yu Uchiumi, *Yukihiko Toquenaga, Yuko Numajiri, Natsuko I. Kondo:
"Host species barrier against Wolbachia infection"（ポスター PA3-019）
第 61 回日本生態学会大会, 広島国際会議場, 広島. 2014 年 3 月 14 日 - 18 日
*内海邑:
"Wolbachia は種の壁を超えられるか"（口頭発表, 自由集会 "生態学者的分子手法と Bayesian で紐解く WolbachiaI の世界" W10）
第 61 回日本生態学会大会, 広島国際会議場, 広島. 2014 年 3 月 14 日 - 18 日
*内海邑, 佐々木顕:
"ミトコンドリアの片親遺伝の進化: メタ個体群モデルによる検討"（口頭発表 O-59）
第 23 回日本数理生物学会大会, 静岡大学, 静岡. 2013 年 9 月 11 日 - 13 日
*Yu Uchiumi, Morihiko Tomatsuri, Yukihiko Toquenaga:
"Infanticide revisited: when defending is mightier than killing"（ポスター P1-176）
第 60 回日本生態学会, 静岡県コンベンションセンター, 静岡. 2013 年 3 月 5 日 - 9 日
*内海邑, 町田龍一郎:
"完全変態類の各目間における蛹の比較解剖学的研究"（ポスター）
筑波大学先導的研究者体験プログラム平成 22 年度第一回研究発表会, 筑波大学, 茨城. 2010 年 8 月 31 日