2012
佐々木顕 (2012) 伝染病と流行. 岩波講座計算科学６計算と社会. pp123-169. 岩波書店
佐々木顕 (2012) ゾウムシの矛とツバキの盾の軍拡競争. 進化 生命のたどる道. カール・ジンマー著. pp239-295. 岩波書店
山道真人・印南秀樹（in press）始めよう！エコゲノミクス（７）今後のエコゲノミクス研究の展望. 日本生態学会誌. 日本生態学会
2011
山道真人（2011）迅速な進化と表現型可塑性が個体群動態に及ぼす影響. 数理解析研究所講究録. vol.1751 pp. 140-147. 京都大学数理解析研究所
山道真人・印南秀樹（2011）始めよう！エコゲノミクス（６）自然選択の検出（その２）. 日本生態学会誌. vol.61.2号 pp. 237-249. 日本生態学会
2010
佐々木顕 (2010) 軍拡競争・共進化・種分化．「行動・進化」の数理生物学．日本数理生物学会編．pp129-154．共立出版
山道真人・印南秀樹（2010）始めよう！エコゲノミクス（５）自然選択の検出（その１）. 日本生態学会誌. vol.60.2号 pp. 293-302. 日本生態学会
山道真人・印南秀樹（2010）始めよう！エコゲノミクス（４）集団内変異データが語る過去：解析手法と理論的背景（その２）. 日本生態学会誌. vol.60.1号pp. 137-148. 日本生態学会
2009
佐々木顕 (2009) 群集生態モデルと進化動態：資源分割理論を例に. 大串隆之・近藤倫生・吉田丈人 (編), 群集生態学２—進化生物学からせまる, pp. 243-262. 京都大学出版会
鈴木清樹（2009）疫学モデルを用いた病害の動態解析と防除対策. 植物防疫. vol.63.10号pp. 614-618. 日本植物防疫協会
山道真人・印南秀樹（2009）始めよう！エコゲノミクス（３）集団内変異データが語る過去：解析手法と理論的背景（その１）. 日本生態学会誌. vol.59.3号pp. 339-349. 日本生態学会
山道真人・角谷拓（2009）マルコフ連鎖モンテカルロ（MCMC）法を用いたシミュレーションモデルのパラメータ推定：ベイジアンキャリブレーション 入門. 日本生態学会誌. vol.59.2号pp. 207-216. 日本生態学会
山道真人・印南秀樹（2009）始めよう！エコゲノミクス（２）ゲノムワイド関連マッピング. 日本生態学会誌. vol.59.1号pp. 105-113. 日本生態学会
2008
佐々木顕 (2008) 病原体の進化と疫学動態. 稲葉寿 (編), 感染症の数理モデル, pp. 268-304. 培風館
佐々木顕 (2008) 毒性の進化と「小さな世界」. 青山秀明・相馬亘・藤原義久 (編), ネットワーク科学への招待, pp. 50-55.サイエンス社
山道真人・印南秀樹（2008）始めよう！エコゲノミクス（１）局所適応と形質の分化. 日本生態学会誌. vol.58.3号 pp. 241-247. 日本生態学会
山道真人（2008）階層ベイズとその反応拡散モデルへの応用. 日本数理生物学会ニュースレター. vol.56. pp. 10-15. 日本数理生物学会
2007
佐々木顕・東樹宏和・井磧直行 (2007) ヤブツバキとシギゾウムシの軍拡競走. 日本生態学会誌 56 174-182.
佐々木顕 (2007) 毒性の進化と「小さな世界」. 数理科学 525 78-83.
山道真人（2007）市民参加型の長期的な調査から階層ベイズを用いてわかること. バードリサーチニュース. vol.4.12号 pp. 2. NPO法人バードリサーチ