МКФ

мнение простое - нельзя удалять не разобравшись...

МКФ по лекции Федорова Д.Г. 12/10/2009

Но кто такой Федоров Д.Г. - см. ниже - (друг Паши Аврамова)

МЕТОД КВАНТОВО-ХИМИЧЕСКИХ ФРАГМЕНТОВ ДЛЯ РАСЧЕТА БОЛЬШИХ СИСТЕМ.

Проведение расчетов дают:

1. Полная энергия (энтальпия реакции)

2. Градиент (оптимизация геометрии)

3. Гессианы (ИК спектры, гармонические частоты, энтропия, свободная энергия)

4. Дипольный и др. моменты.

5. Заряд на атомах.

6. Молекулярные орбитали (правила Гоффмана).

7. Орбитальные энергии (потенциал ионизации, фотоспектры, плотность состояний)

8. Энергия возбужденных состояний (спектры)

Системы, состоящие из большого числа атомов (например, белки) разбиваются на фрагменты, над которыми и производятся расчеты. Фрагмент (например, содержащий 2 атома углерода) делят на 2 части, правую и левую, накладывают дополнительные условия (перераспределение разряда во фрагменте; электронная плотность; учет соседних фрагментов, взаимодействий с ними и т.д.). Для большей точности расчета фрагменты объединяют в пары, тримеры и т.д., чтобы учесть виды взаимодействий (связей) между фрагментами (в мономере количество электронов, участвующих в связи, фиксировано).

Также были проведены расчеты на кристаллических системах (например, цеолиты, которые получают заменой атома кремния в оксиде на атом алюминия). Энергия возбужденного состояния хромофора в отсутствие мономеров/димеров максимальная. При введении в систему хромофор-мономер, хромофор-димер – энергия энергия возбуждения уменьшается.

Почему люди (пока) не болеют птичьим гриппом.

На поверхности нормальных клеток имеются сахариды, с которыми взаимодействуют вирусные белки, в случае попадания в организм. Белок, входящий в вирус гриппа (которым болеет человек) отличается от белка, входящего в вирус гриппа птицы на одну аминокислоту. Методом квантово-химической фрагментации было рассчитано, что энергия взаимодействия вирусного белка птицы с поверхностными сахаридами клетки отличается от энергии взаимодействия вирусного белка человека с теми же сахаридами.

http://icm.institute.sfu-kras.ru/node/87

Открытая лекция Фёдорова Дмитрия Георгиевича

30.09.2009

6 октября 2009 г. (вторник) состоится открытая лекция PhD, ведущего научного сотрудника Research Institute for Computational Sciences, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (Япония) Фёдорова Дмитрия Георгиевича.

Д.Г. Фёдоров – член Японского химического общества, автор более 50 работ в ведущих мировых изданиях и 8 монографий, посвящённых исследованию новейших материалов и развитию метода квантово-химических фрагментов.

Дмитрий Георгиевич с 1994 г. работал в университете штата Айова (США), в 1999-2002 являлся научным сотрудником Токийского университета (Япония), с 2002 г. по настоящее время работает в научно-исследовательских институтах Японии.

Фёдоров прочитает цикл открытых лекций и проведет семинар для специалистов, аспирантов и магистров, консультации для специалистов.

Расписание занятий:

Лекция «Теоретические основы и некоторые приложения метода квантово-химических фрагментов»

Семинар для специалистов, аспирантов, магистров, студентов старших курсов «Расчеты больших молекулярных систем программой FACIO на примере нанокластеров и биологических молекул»

Лекции «Метод квантово-химических фрагментов для расчетов больших систем», «Учеба и научная работа зарубежом и культурные особенности»