http://elementy.ru/genbio/resume?artid=246

Журнал общей биологии. Резюме статей

Том 70, 2009. № 4, июль-август, Стр. 296–315

ДНК-штрихкодирование видов животных и растений - способ их молекулярной идентификации и изучения биоразнообразия

B. С. Шнеер

Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН

197376 Санкт-Петербург, ул. проф. Попова, 2

e-mail: Shneyer@VS11044.spb.edu

Поступила в редакцию 21.11.2007 г.

ДНК-штрихкодирование было недавно предложено как метод видовой идентификации эукариот с помощью последовательности стандартного короткого фрагмента ДНК. Современные технологии позволяют секвенировать последовательность, выделив ДНК из крошечного фрагмента любой ткани организма на любой стадии онтогенеза, часто не повреждая его. В качестве стандартного участка для большинства групп животных была предложена вариабельная 5'-половина митохондриального гена COl, для грибов и растений участок еще не выбран. Программа "Штрихкод жизни" предполагает создание библиотеки штрихкодов для всех видов на Земле, что позволит осуществлять отнесение особей к известным видам и обнаружение новых и криптических видов или, по крайней мере, их предварительное распознавание. Это имеет большое значение для описания мирового биоразнообразия, особенно в случае малоизученных таксономических групп и сред обитания. Программа предполагает также создание новой специальной электронной базы данных со строгими правилами для вводимой таксономической информации об образце и месте его хранения и стандартами секвенирования и ввода в базу последовательностей. В обзоре также рассмотрены критические замечания оппонентов ДНК-штрихкодирования, ограничения и факторы, которые нужно учитывать, области практического применения. Многочисленные работы, выполненные в последние годы на разных группах животных, подтвердили возможность и перспективность ДНК-штрихкодирования. Однако его эффективность зависит от наличия полной и точной референтной базы с учетом внутривидовой индивидуальной и географической изменчивости, поэтому оно может быть более успешным в сочетании с разносторонним таксономическим анализом изучаемых групп.

См подробнее http://elementy.ru/genbio/synopsis?artid=246

http://elementy.ru/genbio/resume/8

Журнал общей биологии. Резюме статей

Том 67, 2006. № 2, март-апрель, Стр. 83–106

Классическая и неклассическая систематика: где проходит граница?

И. Я. Павлинов

Зоологический музей МГУ

125009 Москва, ул. Б. Никитская, 6

e-mail: igor_pavlinov@zmmu.msu.ru

Поступила в редакцию 10.11.2005 г.

Все научные построения являются моделями,

представляющими определенные аспекты... реальности.

Л. фон Берталланфи.

В свете тенденций развития науки в XX столетии кратко рассмотрено современное состояние биологической систематики. Кратко охарактеризованы различия между классической и неклассической наукой и на этой основе показана возможность интерпретации разных таксономических школ как представителей классической и неклассической систематики.

Последняя подразумевает: необходимость онтологического обоснования классификационных подходов и классификаций («формальные» классификации неактуальны, поскольку бессодержательны); включение в это обоснование содержательных, предпочтительно каузальных моделей, задающих начальные условия классифицирования (аксиомы и презумпции об исследуемом разнообразии); множественность такого рода моделей, каждая из которых соответствует определенному аспекту таксономического разнообразия; неустранимое присутствие личностного знания в классификациях (противопоставление «объективных» и «субъективных» классификаций относительно); совместимость метода классифицирования с требованиями базовой модели («нейтральные» методы не гарантируют получения биологически осмысленной классификации); трактовку классификации как гипотезы о некотором аспекте или фрагменте таксономического разнообразия (что обязывает при разработке классификаций следовать определенным правилам выдвижения и тестирования гипотез); правомочность разработки разных классификаций, отражающих разные аспекты данного фрагмента таксономического разнообразия (метафизический и таксономический плюрализм).

Последнее делает неактуальным поиск «единственно возможной» Естественной (в любой ее трактовке) или справочной системы. С этой точки зрения претензия всякого подхода быть «лучшим» в систематике является контрпродуктивным. Вместо этого задачей неклассической систематики следует считать разработку некоторого спектра взаимодополнительных классификаций, в совокупности описывающих многоаспектное таксономическое разнообразие. Их взаимная интерпретация и поиск корректных способов объединения в общую картину таксономического разнообразия являются ключевыми проблемами развития неклассической систематики.

http://elementy.ru/genbio/resume?artid=98

Журнал общей биологии. Резюме статей

Том 68, 2007. № 2, Март-Апрель, Стр. 126–148

Доместикация злаков Старого Света: поиск новых подходов для решения старой проблемы

Н. П. Гончаров, С. А. Глушков, В. К. Шумный

Институт цитологии и генетики СО РАН

630090 Новосибирск, пр. акад. Лаврентьева, 10

e-mail: gonch@bionet.nsc.ru

Поступила в редакцию 03. 05. 2006 г.

Теория центров происхождения культурных растений Н. И. Вавилова до сих пор является методической основой для изучения процессов, происходящих при доместикации растений. В совокупности с новейшими археологическими, ботаническими и молекулярно-генетическими данными она дала возможность определить наиболее вероятные районы введения в культуру основных возделываемых видов растений. Поиск механизмов возникновения морфологических изменений в ходе доместикации является одной из старейших проблем эволюционной биологии. Привлечение новейших молекулярно-биологических методов для ее решения дает ключ к пониманию этих механизмов и позволяет выполнить реконструкцию возможного сценария вовлечения в селекцию признаков, отличающих дикорастущие формы от доместицированных. Предполагается, что явные физиологические и морфологические отличия, имевшие важное значение для древнего земледельца, возникли вследствие качественных и/или количественных изменений локусов, регулирующих программы развития растения. Данная гипотеза позволяет не только выявить механизм появления у возделываемых растений определенных признаков в ходе доместикации и связать направление отбора с характером генетического контроля таких признаков, но и наметить конкретные пути для дальнейшего детального изучения эволюции, протекавшей при вовлечении в культуру диких растений.

http://elementy.ru/genbio/resume?artid=50

Журнал общей биологии. Резюме статей

Том 65, 2004. № 2, Март-Апрель, Стр. 116–135

Эпигенетические и синергические формы наследования репродуктивных признаков у покрытосеменных растений

С. И. Малецкий

Институт цитологии и генетики СО РАН

630090 Новосибирск, пр. Лаврентьева, 10

e-mail: stas@bionet.nsc.ru

Поступила в редакцию 28.02.2003 г

В статье рассмотрены три типа наследственной памяти (структурная, клеточная и сигнальная), реализуемые на разных уровнях организации биологических структур. Трем типам наследственной памяти соответствуют три типа репродукции - самоудвоение, дробление и воспроизводство. В качестве примеров описано наследование наиболее существенных репродуктивных признаков растений - диморфизм растений в популяциях по полу цветков, моно-, ди- и тристилия цветков, одно- и двуродительский способы семенной репродукции. Все рассматриваемые признаки относятся к группе суперпризнаков и контролируются не отдельными генами, а генными ансамблями (субпрограммы генома). Обсуждается связь трех типов размножения (репликация, дробление, воспроизводство) и трех типов наследственной памяти (структурной, клеточной и сигнальной). Рассмотрена также роль полиплоидии (авто- и эндополиплоидии) в регуляции репродуктивных признаков. С позиции теории информации, рост уровня плоидности клеток ведет к увеличению неопределенности экспрессии генов и генных ансамблей, что создает новый тип изменчивости у растений - эпигенетическую изменчивость. Смена репродуктивных стратегий у растений не требует структурных генетических изменений в геноме, а регулируется через изменения состояний генов и генных ансамблей. Репродуктивные признаки растений, несмотря на сложную их структуру, наследуются в ряду смежных поколений как дискретные менделеевские признаки - по моно-, ди- или тригибридной схемам.

Эпигенетические и синергические формы наследования репродуктивных признаков у покрытосеменных растений