Nés au IVe siècle avec le christianisme, les hôpitaux de Rouen se structurent autour de la cathédrale avec l'Hôtel-Dieu. 

Pour contrer la lèpre puis la peste (1348), Rouen bâtit des maladreries et, au XVIIe siècle, un « Lieu de Santé » isolé pour purifier l'air des malades.

Après la peste, l'Hôtel-Dieu est transféré en 1758 au Lieu de Santé, site moderne unifiant chirurgie et pharmacie. 

En 1681, l’Hôpital général est fondé pour le renfermement des pauvres. Il s'agrandit jusqu'en 1785 avec de nouveaux bâtiments et d’imposantes chapelles.

Au XIXe siècle, l'Hôtel-Dieu lutte contre le choléra. 

L'Hôpital général achève son architecture classique et diversifie ses services. 

La psychiatrie émerge avec les asiles de Saint-Yon et Quatremares. 

Parallèlement, l’école de médecine se structure dans l’enclave Sainte-Marie.

Au XXe siècle, les découvertes de Pasteur et les avancées technologiques modernisent radicalement les soins. La réforme de 1958 instaure le CHU. 

L'Hôtel-Dieu ferme définitivement en 1995 pour devenir la préfecture, tandis que l'Hôpital Charles Nicolle s'étend massivement pour devenir le cœur hospitalier universitaire rouennais.