Para comprobar nuestra hipótesis establecemos los siguientes objetivos:
Estudiar la actividad de la microbiota tipo perifiton que actúa en la marisma del Lagares.
Determinar los microorganismos más importantes que nos pueden servir como bioindicadores.
Evaluar la funcionalidad del ecosistema “Marisma del Lagares” según la rapidez de degradación de la materia orgánica (M.O.).
Comprobar si hay zonas de la marisma con distinta funcionalidad.
Además, como en cualquier trabajo científico, otro de los objetivos fundamentales es la divulgación de nuestro trabajo para que cualquiera que así lo desee pueda acceder a esta fuente de datos y conocimiento.
Proponer sistemas de vigilancia y control de la actividad microbiana, especialmente de bacterias, nematodos y diatomeas de la marisma.