2020年1月よりスタートした「教育デザインプロジェクト」は、聖学院教育憲章の実現に向けて、駒込キャンパス３校（聖学院小学校、女子聖学院中高、聖学院中高）の教育活動を共有化することを目的として設置されました。６回の会議を経て、小中高12年間を通じた「SDGs・ESD教育」「英語・グローバル教育」「ICT活用教育」を柱にすることが決まりました。2021年度には教育デザイン開発センターを立ち上げ、それぞれの教育をユニットに分けてメンバーを構成し、教育シナジーを産むための検討が進められました。