Loodusainete omavaheline lõiming ning nende lõimumine teiste ainevaldkondadega toimub kolmel tasandil:
1. Õpilastele esitatakse ülesandeid, kus probleemipüstitus lähtub põllumajanduses, metsanduses, majanduses või mõnes teises valdkonnas esinevast igapäevasest situatsioonist ning lahendamisel tuleb õpilastel rakendada eri loodusainetes omandatud teadmisi ja oskusi.
2. Mitmete teemade käsitlemisel palutakse õpilastel koostada eritüübilisi mõistekaarte, mis integreerivad füüsika, keemia, bioloogia ja geograafia teadmisi ja oskusi. Lisaks sellele seostakse mõnes mõistekaardis loodusained ka matemaatika ja insenerteaduslike aspektidega, hõlmates sellega kõiki STEM-aineid ning nendega seonduvaid majandusvaldkondi.
3. Kutseharidusõppeasutuste jaoks on kombineeritud sisukimbud, mis lõimivad loodusainete erinevad teemad ühtseks tervikuks. Ülesannete koostamisel on lähtutud eri majandusharudega seotud probleemülesannetest, mille lahendamisel tuleb õpilastel kasutada nii loodus- kui ka STEM-ainete teadmisi ja oskusi. Seejuures leiavad taolised ülesanded rakendamist ka üldhariduskoolides.