Laurent Gautier est professeur de linguistique allemande et appliquée à l'UFR Langues & Communication de l'Université de Bourgogne. Il est, depuis mars 2020, vice-président de l'Université de Bourgogne délégué à la valorisation de la recherche.

Il est par ailleurs directeur du laboratoire de recherche Centre Interlangues Texte Image Langage (EA4182) et directeur-adjoint de la Maison des Sciences de l'Homme de Dijon (USR uB CNRS 3516). Il coordonne par ailleurs le Lab Multilingualism de l'Université Européenne ForThem, lauréate de l'appel 2019 et regroupant les Universités Dijon, Jyväskylä (Finlande), Mayence (Allemagne), Opole (Pologne), Palerme (Italie), Riga (Lettonie), Séville (Espagne).

De 2015 à 2018, il a présidé le jury de l'agrégation externe d'allemand et est, depuis décembre 2018, membre nommé du Internationaler Wissenschaftlicher Rat du Leibniz Institut für Deutsche Sprache. Par ailleurs, il a été de 2016 à 2020 délégué scientifique au Département d'Evaluation des Formations au Hcéres.