1.IQ-TREE2 をダウンロード
2. C ドライブに解凍
3.Power shell で作業フォルダに移動
cd C:\iqtree\bin3
4../iqtree2.exe -s whole.phy -p whole_AICc4_partitioned.partition -m MFP -b 1000 -T AUTO
赤字部分を修正して実行
-B はUltrafast bootstrap、-b はnon-parametric standard bootstrap