Membros do LBBC

Tecnologista:

Nicole Scherer, PhD.  Bióloga de silício. Começou sua formação em ciências biológicas na Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS) e estudou por um ano na Universidade de Stuttgart (Alemanha). Finalizou o bacharelado com a Dra. Loreta Brandão de Freitas no Departamento de Genética da UFRGS, onde aprendeu técnicas de biologia molecular para estudar a evolução das passifloras na bancada molhada. No mestrado em Genética e Biologia Molecular sob orientação do Dr. Francisco Mauro Salzano, começou seus estudos em evolução molecular das proteínas relacionadas à patogênese em plantas. A pesquisa do mestrado já foi realizada totalmente in silico, utilizando dados de bases públicas. Sentindo a necessidade de aprimorar-se em bioinformática, voltou à Alemanha para realizar seu doutorado com o Dr. Arndt von Haeseler, na Heinrich Heine Universität Düsseldorf. Em 2011 ingressou no INCA para integrar a equipe do Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional. Hoje oferece apoio técnico e científico a projetos desenvolvidos na instituição e em instituições parceiras e é responsável pela gestão do cluster HPC da plataforma multiusuário de bioinformática do INCA. Participa de eventos para divulgação, ensino e fortalecimento da bioinformática no Brasil. Ministra cursos de programação para bioinformática e é membro da diretoria da Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional (AB3C), que organiza o X-Meeting, maior conferência de bioinformática do país.

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    • email: nscherer@inca.gov.br

    • tel: +55 21 3207-6546

• Cristóvão Antunes de Lanna, PhD. Recém Doutor junto ao Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional e o Programa de Carcinogênese Molecular, ambos do Instituto Nacional de Câncer. Possui graduação em Biomedicina pela Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro (2013), mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica) no Instituto Carlos Chagas Filho (IBCCF), da Universidade Federal do Rio de Janeiro (2016), e doutorado em Oncologia com ênfase em Análise de Dados pelo INCA (2023). Possui experiência em análises clínicas aplicadas a animais de laboratório, biologia molecular, genômica e transcriptômica. Atualmente desenvolve a análise in silico de dados de diferentes ômicas (genômica, transcriptômica, epigenômica) para a identificação de novos alvos terapêuticos em diferentes tumores e linhagens de células derivadas de tumores primários.

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• Leandro Santos, PhD. Doutor e mestre em Ciências Biológicas (Biofísica) pelo Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho (IBCCF) na Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ). Especialização em Biologia Forense pela Universidade Castelo Branco (UCB)/Bioforense e Graduado em Biomedicina pela Universidade Severino Sombra (USS/RJ). Pós-doutorado pelo Laboratório de Biologia Molecular de Vírus (IBCCF/UFRJ) e pelo Laboratoire de Pharmacologie Cellulaire (IBMM - Montpellier/França). Possui experiência em análises ômicas através de ferramentas de bioinformática, filogenia, genômica comparativa, bem como, modelagem e dinâmica molecular. Experiência também em técnicas de manipulação genética de microorganismos, biologia molecular e bioquímica, especialmente sequenciamentos Sanger e NGS. Atualmente, pós-doutorando no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC) do Instituto Nacional de Câncer (INCA) onde vem desenvolvendo um projeto de caracterização e determinação de função das diferentes subpopulações de macrófagos na relação com doenças pró-inflamatórias, especialmente o câncer. Este projeto utiliza dados públicos de sequenciamento de célula (scRNA-seq) no intuito da criação de um atlas de macrófagos associados a tumores sólidos. 

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• Nayara Tessarollo, PhD. Doutora em Biotecnologia pela Universidade Federal do Espírito Santo (2017) (período sanduíche em Johns Hopkins University, Baltimore, USA). Mestre em Ciências da Saúde com ênfase em Biologia Celular e Molecular pelo Centro de Pesquisa René Rachou-FIOCRUZ/MG (2013). Bacharel em Bioquímica pela Universidade Federal de Viçosa (2010). Pós doutorado em Oncologia pelo Instituto do Câncer do Estado de São Paulo (ICESP). Atualmente é pós doutoranda no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC) do Instituto Nacional do Câncer (INCA), desenvolvendo o projeto de caracterização em alta resolução do transcriptoma de subpopulações do microambiente tumoral de câncer de ovário e seu impacto no desfecho clínico e resistência a terapia. Possui experiência na área de terapia gênica,  bioquímica, biologia molecular e celular, imunologia. 

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• Gabriel Fonseca, BSc. Bacharel em Ciências Biológicas pela Universidade Federal Fluminense (UFF), com ênfase em saúde e oncologia. Foi aluno de Iniciação Científica (IC) em laboratórios de Neurobiologia da UFF estudando estrutura e função dos receptores endocanabinoides e sua modulação pelos seus neurotransmissores endógenos e exógenos e também foi aluno de IC no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC-INCA/RJ), onde atualmente é aluno de aperfeiçoamento I participando de um projeto cujo o objetivo é investigar o papel do fator de transcrição ZNF429 na regulação de vias celulares em câncer de pâncreas.

  • • Link para o Lattes: http://lattes.cnpq.br/2132058819644177

    • Linkedin: Gabriel (Gabriel Fonseca) Fernando Costa Da Fonseca | LinkedIn 

• • Cristiane Esteves Teixeira. Bióloga, graduada pela Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro (UNIRIO). Possuo experiência em montagem e análise genômica. Possui aperfeiçoamento em bioinformática pelo Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional do Instituto Nacional do Câncer (LBBC-INCA/RJ), mestre em Oncologia com ênfase em Análise de Dados (LBBC-INCA/RJ). Atualmente está atuando no aperfeiçoamento II em colaboração com o Laboratório de Big Data e Análise Preditiva da Universidade de São Paulo (LABDAPS - USP). O projeto de mestrado envolve predição de prognóstico e identificação de biomarcadores em tumores de ovário usando técnicas de machine learning a partir de dados multiômicos (RNA-seq, miRNA-seq, mutações e epigenética).

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• Jéssica Gonçalves Vieira da Cruz, MSc. Aluna de Aperfeiçoamento II do Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional do Instituto Nacional do Câncer. Graduação em Biomedicina com ênfase em Pesquisa Científica pela Universidade Federal Fluminense (UFF - Brasil) com período sanduíche na University of Hull, Reino Unido. Tem experiência laboratorial em Microbiologia geral e aplicada, utilização da técnica de PCR (reação em cadeia da polimerase), Western Blotting, ensaios de uptake de Ca++, transformação bacteriana e transfecção de células em cultura para expressão de proteínas mutadas. Fez Aperfeiçoamento I e Mestrado em nosso laboratório, agregando dados ômicos (RNA-seq, ChIP-seq, metilação, proteômica) e clínicos a fim de entender como a função de ZNF429 e a regulação de seus potenciais alvos impacta a sobrevida de pacientes com adenocarcinoma seroso de alto grau de ovário. 

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• Lucas Aleixo Leal. Graduando em Biomedicina pela Universidade Federal de Pernambuco (UFPE) onde desenvolveu pesquisas utilizando o C.elegans como modelo experimental para estudos toxicológicos, além de ter trabalhado com bioinformática estrutural para realizar prospecção de novos fármacos voltados a terapêutica de doenças neurodegenerativas. Atualmente é aluno de iniciação científica pelo LBBC e realiza estudos utilizando dados de single-cell, a fim de elucidar o papel dos macrófagos associados ao tumor no desfecho clínico de pacientes com melanoma.

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    • Linkedin: https://www.linkedin.com/in/lucas-aleixo-b1a3141b4/

    • Orcid: https://orcid.org/0000-0003-0684-1022

    • Email: lucas.aleixoleal17@gmail.com

• Pedro Videira.  Graduando em biologia com ênfase em Biotecnologia, pela Universidade Estadual do Rio de Janeiro (UERJ).Atualmente no LBBC está aprendendo métodos de análises de bioinformática na tecnologia de spatial transcriptomics para seu projeto, sob orientação da Dr.Mariana Boroni e co-orientação do Cristóvão Antunes de Lanna sobre o contexto espacial das interações dos macrófagos com células imunes. Com isso, verificar alterações entre dados de diferentes estadiamentos e resistência a terapias. 

• • • Link para lattes: http://lattes.cnpq.br/6424380990004157 

    • Email: pedrovp161@gmail.com 

• Layse Gomes.  Graduanda em Ciências Biológicas pela Universidade Federal Fluminense com ênfase em saúde. Durante sua graduação já fez parte de projetos de extensão e iniciações científicas envolvendo biologia estrutural. Atualmente é aluna de iniciação científica no LBBC e vem desenvolvendo suas habilidades em ferramentas de bioinformática para análises com dados de scRNA-seq (single-cell RNA-seq) e estuda a diversidade de fenótipos dos macófagos tecido residentes (RTMs) através da associação de padrões de expressão gênica de genes codificantes e lncRNAs sob orientação do Dr. Leandro Santos e co-orientação da Dra. Mariana Boroni.

• • • Email: laysegomes1600@gmail.com   

• Marco Antônio Pretti, MSc. Técnico em biotecnologia pelo Instituto Federal do Rio de Janeiro (IFRJ - Brasil) e graduado em Farmácia pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ - Brasil) com graduação sanduíche na Université de Bordeaux, France. Possui experiência em biologia molecular, cultivo celular, terapia gênica e sistema de transfecção e transdução celular. Desenvolveu uma análise imunológica in silico em dados de sequenciamento de nova geração como parte de seu projeto de mestrado no Instituto Nacional de Câncer (INCA - Brasil). Passou um ano fazendo doutorado sanduíche na França colaborando com o Instituto Gustave Roussy e o Instituto Curie no âmbito do seu projeto de doutorado e durante esse periodo descreveu as reatividades cruzadas de linfócitos T utilizando a carga eletrostática da molécula de HLA que interage com os linócitos T CD8, e assim defendeu sua tese de doutorado intitulada "Avaliação da patencial reatividade cruzada de receptores de c´lulas T para epítopos tumorais".

  • • Link para o Lattes:  http://lattes.cnpq.br/3857079614636425 

• Brena Duraes Rangel dos Santos. Graduanda em Biomedicina pelo Instituto Brasileiro de Medicina de Reabilitação,foi aluna de iniciação científica no Instituto Nacional do Câncer (INCA) no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC).

• Daniel Andrade Moreira, PhD. Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Federal do Rio Grande do Norte (2008), mestrado em Ciências (Biofísica) pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2012) e doutorado em Ciências pelo Programa de Pós-graduação em Biologia Computacional e Sistemas do Instituto Oswaldo Cruz - FIOCRUZ. Possui prática com várias técnicas de biologia molecular. Tem experiência na área de genética, biologia molecular, transcriptômica, genômica, bioinformática e programação (R, Perl e Shell script). Atuou em projetos de montagem e anotação de transcriptomas e genomas mitocondriais, com enfâse nas áreas de evolução e sistemática molecular (análises filogenéticas). Foi bolsista de pós-doutorado no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (Instituto Nacional de Câncer), atuou analisando dados provenientes de sequenciadores de alto desempenho com intuito de caracterizar de forma abrangente os eventos moleculares em diversos tipos tumorais. Atualmente trabalha na Plataforma de Bioinformática (RPT04A), inserida na Rede de Plataformas Tecnológicas da Fiocruz.

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• Palloma Porto Almeida, MSc. Bacharel em Biotecnologia pela Universidade Federal da Bahia (UFBA) e Mestre em Biologia Celular e Estrutural pela Universidade Federal de Viçosa (UFV). Possui experiência em biologia celular teórica e experimental, bioterismo, citometria de fluxo, histopatologia, purificação de proteínas nativas e recombinantes, e divulgação científica. Atualmente é discente de Aperfeiçoamento II no Instituto Nacional do Câncer (INCA) no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional, analisando dados de single-cell RNA-sequencing para a identificação de subpopulações de macrofágos no microambiente tumoral de melanoma e associação destas subpopulações com a progressão da doença, resposta a terapia e prognóstico.  

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