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LÍDER DO GRUPO:
Mariana Boroni, PhD. Pesquisadora adjunto do Instituto Nacional de Câncer, chefe do Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional e coordenadora da plataforma multiusuário de bioinformática. Possui graduação e mestrado em Bioquímica pela Universidade Federal de Viçosa, doutorado em Bioinformática pela Universidade Federal de Minas Gerais (com período sanduíche no NIH - National Institute of Healthy, Bethesda, Estados Unidos) e experiência profissional em bioinformática (pós-doutorado) na Ludwig Maximilians Universität München, Alemanha. Com mais de 10 anos de experiência, vem atuando na área de Bioinformática, Biologia Molecular e Bioquímica, com ênfase em análise de dados de sequenciamento massivo de DNA, como genômica, epigenômica e transcriptômica e desenvolve pesquisas no campo da genômica funcional aplicadas à oncologia.
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e-mail: mariana.boroni@inca.gov.br
tel: +55 21 3207-6550
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Tecnologista:
Nicole Scherer, PhD. Bióloga de silício. Começou sua formação em ciências biológicas na Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS) e estudou por um ano na Universidade de Stuttgart (Alemanha). Finalizou o bacharelado com a Dra. Loreta Brandão de Freitas no Departamento de Genética da UFRGS, onde aprendeu técnicas de biologia molecular para estudar a evolução das passifloras na bancada molhada. No mestrado em Genética e Biologia Molecular sob orientação do Dr. Francisco Mauro Salzano, começou seus estudos em evolução molecular das proteínas relacionadas à patogênese em plantas. A pesquisa do mestrado já foi realizada totalmente in silico, utilizando dados de bases públicas. Sentindo a necessidade de aprimorar-se em bioinformática, voltou à Alemanha para realizar seu doutorado com o Dr. Arndt von Haeseler, na Heinrich Heine Universität Düsseldorf. Em 2011 ingressou no INCA para integrar a equipe do Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional. Hoje oferece apoio técnico e científico a projetos desenvolvidos na instituição e em instituições parceiras e é responsável pela gestão do cluster HPC da plataforma multiusuário de bioinformática do INCA. Participa de eventos para divulgação, ensino e fortalecimento da bioinformática no Brasil. Ministra cursos de programação para bioinformática e é membro da diretoria da Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional (AB3C), que organiza o X-Meeting, maior conferência de bioinformática do país.
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Membros atuais
Pós-Doutorandos
Leandro Santos, PhD. Doutor e mestre em Ciências Biológicas (Biofísica) pelo Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho (IBCCF) na Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ). Especialização em Biologia Forense pela Universidade Castelo Branco (UCB)/Bioforense e Graduado em Biomedicina pela Universidade Severino Sombra (USS/RJ). Pós-doutorado pelo Laboratório de Biologia Molecular de Vírus (IBCCF/UFRJ) e pelo Laboratoire de Pharmacologie Cellulaire (IBMM - Montpellier/França). Possui experiência em análises ômicas através de ferramentas de bioinformática, filogenia, genômica comparativa, bem como, modelagem e dinâmica molecular. Experiência também em técnicas de manipulação genética de microorganismos, biologia molecular e bioquímica, especialmente sequenciamentos Sanger e NGS. Atualmente, pós-doutorando no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC) do Instituto Nacional de Câncer (INCA) onde vem desenvolvendo um projeto de caracterização e determinação de função das diferentes subpopulações de macrófagos na relação com doenças pró-inflamatórias, especialmente o câncer. Este projeto utiliza dados públicos de sequenciamento de célula (scRNA-seq) no intuito da criação de um atlas de macrófagos associados a tumores sólidos.
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Nayara Toledo, PhD. Doutora e mestre em Bioinformática pela Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG). Possui graduação em Ciências Biológicas (Bacharel com ênfase em biotecnologia e saúde) pela UFMG. Possui experiência em biologia molecular e na área de transcriptômica, focando em análises de splicing alternativo. Atualmente é residente pós-doutoral no laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC) do Instituto Nacional do Câncer (INCA), atuando na área de Bioinformática e Biologia Molecular, cujo projeto busca compreender o mecanismo da regulação gênica mediada pelo gene ZNF429 em tumores de ovário e como essa regulação afeta vias envolvidas na progressão tumoral.
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Nayara Tessarollo, PhD. Doutora em Biotecnologia pela Universidade Federal do Espírito Santo (2017) (período sanduíche em Johns Hopkins University, Baltimore, USA). Mestre em Ciências da Saúde com ênfase em Biologia Celular e Molecular pelo Centro de Pesquisa René Rachou-FIOCRUZ/MG (2013). Bacharel em Bioquímica pela Universidade Federal de Viçosa (2010). Pós doutorado em Oncologia pelo Instituto do Câncer do Estado de São Paulo (ICESP). Atualmente é pós doutoranda no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC) do Instituto Nacional do Câncer (INCA), desenvolvendo o projeto de caracterização em alta resolução do transcriptoma de subpopulações do microambiente tumoral de câncer de ovário e seu impacto no desfecho clínico e resistência a terapia. Possui experiência na área de terapia gênica, bioquímica, biologia molecular e celular, imunologia.
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Alessandra Serain PhD. Doutora em Ciências pela Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP, 2020) (período sanduíche no Istituto di Ricerche Farmacologiche Mario Negri, Milão, Itália). Bacharel em Farmácia pela Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP, 2014). Pós doutorado em Bioquímica e Tecnologias Bioluminescentes pela Universidade Federal de São Carlos (Ufscar). Possui experiência em química de produtos naturais, estudos de bioprospecção com cultura de células tumorais, desenvolvimento de métodos analíticos para quantificação de quimioterápicos em amostras de plasma e tumor sólido utilizando espectrometria de massa, aplicação de bioluminescência em novos sistemas tecnológicos de biosensores. Atualmente é Pós doutoranda no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC) do Instituto Nacional do Câncer (INCA), desenvolvendo pesquisas com tumor de ovário e resistência a terapias através do conhecimento de subpopulações do microambiente tumoral e análises de snRNA-Seq e transcriptômica espacial.
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Doutorandos
Cristiane Esteves Teixeira. Bióloga, formada pela Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro (UNIRIO). Possui experiência em biologia molecular, montagem e análise genômica, assim como, em aplicação de técnicas de inteligência artificial na biologia do câncer. Mestre em Oncologia com ênfase em Análises de dados no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional do Instituto Nacional do Câncer (LBBC-INCA/RJ). Atualmente, está cursando o doutorado em Oncologia com ênfase em Análises de Dados no mesmo laboratório. Em colaboração com o Laboratório de Big Data e Análise Preditiva da Universidade de São Paulo (LABDAPS - USP), desenvolve projetos de pesquisa que visam prever prognósticos e identificar biomarcadores utilizando técnicas de machine learning a partir de dados multiômicos (RNA-seq, miRNA-seq e DNA-seq), com foco principal em tumores de ovário.
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Gabriela Rapozo Guimarães. Graduada em Biomedicina com habilitação em Análises Clínicas pela Universidade Federal Fluminense (UFF), onde adiquiriu experiência em virologia e HPV durante três anos de Iniciação Científica no Laboratório de Diagnótico Virológico da UFF. Foi aluna de aperfeiçoamento no Laboratório de Bionformática e Biologia Computacional (LBBC), onde atualmente é mestranda sob a orientação da Dra. Mariana Boroni e co-orientação do Dr. Marcelo Mori (UNICAMP). O projeto tem o objetivo de correlacionar o impacto do envelhecimento de macrófagos no câncer de mama triplo negativo com o prognóstico através da transcriptômica espacial e de células únicas.
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Michelle Paredes Escobar. Bacharel em Engenharia em Biotecnologia pela Universidade das Forças Armadas - Equador (UFA-ESPE) e possui um Mestrado em Biologia Computacional pela Pontifícia Universidade Católica do Equador. Durante sua formação acadêmica, fez parte do grupo de pesquisa em Nanobiologia e Nanomedicina, participando de projetos focados no estudo da resistência antimicrobiana em bactérias clinicamente relevantes através do uso de tecnologias de NGS e Machine Learning. Seu projeto de mestrado concentrou-se na análise de dados de RNA-seq em câncer de próstata. Além disso, trabalhou como parte do pessoal técnico no Hospital Oncológico Julio Villacreses Colmont SOLCA Manabí no Equador, com foco no diagnóstico molecular de neoplasias mieloproliferativas. Atualmente, é doutoranda em Oncologia e seu projeto se concentra na caracterização de variantes genéticas associadas à resposta ao tratamento em câncer de ovário.
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Mestrandos
Glenerson Batista, BSc. Bacharel em Ciências Biológicas, com ênfase em Biologia Celular e Saúde, graduado com honra Cum Laude pela Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF). Durante o período de 2018 a 2022, desenvolveu atividades de Iniciação Científica com bolsa FAPERJ/UENF no Laboratório de Biologia Celular e Tecidual, focando na identificação de padrões de expressão e atividade de Bombas Iônicas em tumores humanos associados a infecções por HPV. Utilizando abordagens que envolviam ensaios em linhagens celulares, imunofluorescência e bioinformática, visando avaliar o potencial dessas bombas como biomarcadores. Além disso, foi aluno de Aperfeiçoamento I no Programa de Bolsa e Formação em Pesquisa Oncológica no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional no Instituto Nacional de Câncer (INCA/RJ), onde explorou o mecanismo de regulação gênica pelo fator de transcrição ZNF429 em vias de tumores de ovário. Atualmente, é mestrando no Programa de Pós-Graduação stricto sensu em Oncologia (PPGO), também no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional, no INCA, com foco na avaliação da expressão gênica em Câncer de Ovário Seroso de Alto Grau e seu impacto na resistência a terapias.
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Gabriel Fonseca, BSc. Bacharel em Ciências Biológicas pela Universidade Federal Fluminense (UFF), com ênfase em saúde e oncologia. Foi aluno de Iniciação Científica (IC) em um laboratório de Neurobiologia da UFF, onde estudou a estrutura e função dos receptores endocanabinoides e sua modulação pelos neurotransmissores endógenos e exógenos. Também foi aluno de IC no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC-INCA/RJ), trabalhando em uma linha de pesquisa voltada para a identificação de biomarcadores, que se tornou seu projeto de aperfeiçoamento I. O objetivo desse projeto é investigar o papel do fator de transcrição ZNF429 na regulação de vias celulares no câncer de pâncreas e ovário. Atualmente, é aluno de Mestrado, desenvolvendo um projeto que visa avaliar a expressão diferencial de isoformas derivadas de splicing alternativo a partir de dados de single-cell RNA-seq de amostras de pacientes com câncer de ovário seroso de alto grau.
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Linkedin: Gabriel (Gabriel Fonseca) Fernando Costa Da Fonseca | LinkedIn
Laís Costa, BSc. Bacharel em Biomedicina pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2023). Iniciou sua trajetória científica no Laboratório de Imunofisiologia do Instituto de BIofísica Carlos Chagas Filho, buscando compreender os mecanismos responsivos dos macrófagos - no contexto da ativação da sinalização purinérgica - frente à infecção por Leishmania amazonensis, sendo bolsista FAPERJ. Logo, possui experiência em imunologia com ênfase na imunofisiologia da imunidade inata. Atualmente, é aluna de mestrado do Programa de Pós-Graduação em Oncologia, investigando a heterogeneidade do microambiente tumoral em pacientes com câncer de ovário seroso de alto grau, a partir da transcriptômica espacial.
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Aperfeiçoamento I
Helena Zancanaro. Graduada em Farmácia pela Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC), com um semestre de intercâmbio na Universidade de Münster em 2023 (Mar-Ago). Em 2024 (Jan-Fev) foi contemplada com uma bolsa do DAAD para estudar alemão na Universidade de Mannheim. Foi bolsista de Iniciação Científica (IC) (2021-2024) no Laboratório de Farmacologia e Bioquímica do Câncer (LabCancer) e trabalhou em projetos relacionados à via antioxidante e resistência terapêutica em câncer de pulmão (NSCLC) e em estudos relacionados ao perfil inflamatório do câncer de mama (TNBC). Possui experiência em técnicas de biologia molecular e cultura celular. Atualmente está desenvolvendo seu projeto de Aperfeçoamento I intitulado “Caracterização das redes de interação entre circRNA-mirRNA-mRNA em tumores de ovário com diferentes perfis de microambiente tumoral”.
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Rafaela Barros, BSc. Graduada em Ciências Biológicas (licenciatura) pela Universidade do Estado de Minas Gerais (UEMG-Ubá), intercâmbio na Universidade de Ciências do Porto FCUP/PT (2021-2022). Iniciação Científica (IC) em Neurociências na temática "Astrócitos como alvo para a proteína de mielina inibitória Nogo-A no desenvolvimento e doença do SNC", foi bolsista, do Programa Institucional de Bolsas de Iniciação à Docência (PIBID), realizou projeto de extensão "Relato do docente uma trajetória de gente como agente", estagiária no laboratório de biologia da UEMG. Além disso, desenvolve projetos e pesquisa de conclusão de curso com a temática “Biomarcadores epigenéticos para identificação de fluidos corporais na genética forense”.
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Aperfeiçoamento II
Vitor Paiva, MSc. Bacharel em Biomedicina pelo Centro Universitário IBMR, especialista em Business Intelligence, Marketing Digital e Estratégia Data Driven pela PUCRS e Mestre em Oncologia pelo Instituto Nacional de Câncer. Atualmente cursando o Aperfeiçoamento II e seu projeto visa avaliar a associação entre variantes e o perfil de expressão gênica em células tumorais a partir da análise do sequenciamento de RNA de núcleos individuais de pacientes com câncer de ovário seroso de alto grau.
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Victor Hugo Garcia de Oliveira Bacharel em Ciências Biológicas pela Universidade do Oeste Paulista - UNOESTE. Mestre pelo Programa de Pós-Graduação em Meio Ambiente e Desenvolvimento Regional. Pós-Graduado Lato Sensu em Biologia Molecular Aplicada à Bioinformática - Universidade Tecnológica Federal do Paraná - UTFPR. Durante a graduação foi bolsista de iniciação científica da Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP). Possui experiência na área de genética geral, genética molecular e bioinformática. Atualmente cursando o Aperfeiçoamento II no LBBC INCA, com projeto relacionado à análise de expressão gênica de casos de carcinossarcoma de endométrio.
Linkedin: www.linkedin.com/in/2b3556222
Iniciação Científica
Andressa Fagundes. Graduanda em Biofísica com ênfase em Bioinformática e Biofísica Molecular, pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ).Atualmente no LBBC está aprendendo métodos experimentais de bancada e de bioinformática para seu projeto, sob orientação da Dr.Nayara Tessarollo e co-orientação da Dr.Mariana Boroni sobre o papel de macrófagos na progressão de câncer de ovário, advindos de trabalhos do grupo de scRNA-seq.
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Linkedin: https://www.linkedin.com/in/andressa-fagundes-6592b7141/
Geovanna Barroso de Farias. Graduanda em Biomedicina pelo Instituto Brasileiro de Medicina e Reabilitação (IBMR). Atualmente realiza iniciação científica voluntária no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC) no INCA, onde desenvolve um projeto envolvendo a criação de um modelo preditivo utilizando técnicas de machine learning para o estudo de miRNAs associados ao prognóstico no câncer de ovário seroso de alto grau (HGSC), sob orientação da Mariana Boroni e co-orientação de Cristiane Esteves Teixeira.
Linkedin: www.linkedin.com/in/geovannabfarias
Email: geovannab.farias@gmail.com
Pedro Videira. Graduando em biologia com ênfase em Biotecnologia, pela Universidade Estadual do Rio de Janeiro (UERJ).Atualmente no LBBC está aprendendo métodos de análises de bioinformática na tecnologia de spatial transcriptomics para seu projeto, sob orientação da Dr.Mariana Boroni e co-orientação do Cristóvão Antunes de Lanna sobre o contexto espacial das interações dos macrófagos com células imunes. Com isso, verificar alterações entre dados de diferentes estadiamentos e resistência a terapias.
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Email: pedrovp161@gmail.com
Coorientações
Ana Carolina Pires, MSc. Bacharel em Biotecnologia (2019) e mestre em Ciências, com ênfase em Microbiologia (2023), ambos pela UFRJ. Desenvolveu sua dissertação de mestrado durante a pandemia, utilizando scRNA-seq para analisar dados públicos de células broncoalveolares de pacientes com COVID-19. Paralelamente, participou de projetos de metabolômica na mesma linha de pesquisa. Atualmente, cursa o Aperfeiçoamento II, sob orientação da Dra. Mariana Emerenciano, no Laboratório de Genética das Leucemias Agudas (GenLab) do INCA, onde desenvolve projeto focado no sistema imunológico em leucemia linfoblástica aguda, utilizando dados de single-cell RNA-seq de pacientes pediátricos. Conta com a coorientação da Dra. Mariana Boroni para desenvolver expertise em bioinformática.
Email: acpiresesilva@gmail.com
Bianca Braga Frade, Msc. Doutoranda pelo Programa de Ciências Morfológicas, da Universidade Federal do Rio de Janeiro (PCM/UFRJ). É orientada pela professora Dra. Danielle Bonfim (ICB/UFRJ) e coorientada pela Dra. Mariana Boroni (INCA). Mestre (2023) em Ciências Biológicas (Biofísica), pelo Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho (IBCCF/UFRJ). Bacharel (2021) em Ciências Biológicas: Modalidade Médica, com habilitação em Ciência e Tecnologia, pelo Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/UFRJ). Técnica (2014) em Administração de Empresas, pelo Instituto Superior de Educação do Rio de Janeiro, da Fundação de Apoio à Escola Técnica (ISERJ/FAETEC). Foi Diretora Presidente (2018) da Empresa Júnior Antônio Paes de Carvalho (APC/ICB/UFRJ). Atua no Laboratório de Células-Tronco e Regeneração Óssea (LabCeR/ICB/UFRJ) e no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC/INCA) estudando os processos que envolvem a Regeneração de Fraturas, o Envelhecimento e o Sistema Imunológico. É professora substituta do Programa de Graduação em Anatomia (PGA/ICB/UFRJ).
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Email: bb.frade@hotmail.com
Lucas Aleixo Leal. Graduado em Biomedicina pela Universidade Federal de Pernambuco (UFPE) onde desenvolveu pesquisas utilizando o C. elegans como modelo experimental para estudos toxicológicos, além de ter trabalhado com bioinformática estrutural para realizar prospecção de novos fármacos voltados a terapêutica de doenças neurodegenerativas. Foi aluno de iniciação científica pelo LBBC e realiza estudos utilizando dados de single-cell, a fim de elucidar o papel dos macrófagos associados ao tumor no desfecho clínico de pacientes com melanoma. Atualmente é aluno de mestrado.
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Linkedin: https://www.linkedin.com/in/lucas-aleixo-b1a3141b4/
Email: lucas.aleixoleal17@gmail.com
Colaboradores externos
Cristóvão Antunes de Lanna, PhD. Foi recém Doutor junto ao Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional e o Programa de Carcinogênese Molecular, ambos do Instituto Nacional de Câncer. Possui graduação em Biomedicina pela Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro (2013), mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica) no Instituto Carlos Chagas Filho (IBCCF), da Universidade Federal do Rio de Janeiro (2016), e doutorado em Oncologia com ênfase em Análise de Dados pelo INCA (2023). Possui experiência em análises clínicas aplicadas a animais de laboratório, biologia molecular, genômica e transcriptômica. Atualmente desenvolve a análise in silico de dados de diferentes ômicas (genômica, transcriptômica, epigenômica) para a identificação de novos alvos terapêuticos em diferentes tumores e linhagens de células derivadas de tumores primários.
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Willker Menezes da Rocha, PhD. Bacharel em Biomedicina pela Universidade Federal Fluminense (UFF, 2011), com ênfase em Virologia e Biologia Molecular. Mestre (2014) e doutor (2019) em Microbiologia e Parasitologia Aplicadas pela UFF, com ênfase em oncoviroses e cânceres ginecológicos. Pós-doutorado pelo Núcleo de Pesquisa em Virologia (PPGMPA – UFF, 2022). Docente do ensino superior (UNESA), e técnico do Departamento de Saúde Coletiva Veterinária e Saúde Pública – UFF. Possui experiência em biologia molecular e diagnóstico virológico, análises bioquímicas, análise microbiológica de produtos de origem animal, bioinformática, e em técnicas de inteligência artificial e Machine Learning aplicados à biologia. Atualmente é pós-doutorando voluntário do Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC) do Instituto Nacional do Câncer (INCA), trabalhando em pesquisas envolvendo cânceres ginecológicos e análises de dados transcriptômicos.
Rômulo Galvani, PhD. Biomédico pela Universidade Federal do Rio de Janeiro. Possui Mestrado em Atenção ao Câncer (INCA-RJ) e doutorado em Imunologia (UFRJ). Fez Pós-doutoramento em um projeto de Tolerância Oral mediada por Linfócitos B no Laboratório de Pesquisa sobre o Timo na Fiocruz. Possui experiência em Bioinformatica e é colaborador do Laboratorio de Bioinformatica e Biologia Computacional no INCA-RJ. Foi em missão por 3 meses no Instituto Karolinska onde trabalhou no Laboratório da pesquisadora Lisa Westerberg com Bioinformática e Imunologia.
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Membros egressos
Layse Gomes. Graduanda em Ciências Biológicas pela Universidade Federal Fluminense com ênfase em saúde. Durante sua graduação já fez parte de projetos de extensão e iniciações científicas envolvendo biologia estrutural. Foi aluna de iniciação científica no LBBC e vem desenvolvendo suas habilidades em ferramentas de bioinformática para análises com dados de scRNA-seq (single-cell RNA-seq) e estuda a diversidade de fenótipos dos macófagos tecido residentes (RTMs) através da associação de padrões de expressão gênica de genes codificantes e lncRNAs sob orientação do Dr. Leandro Santos e co-orientação da Dra. Mariana Boroni.
Email: laysegomes1600@gmail.com
Tamires Caixeta Alves, PhD. Doutora em Genética e Bioquímica pela UFU (2024), em parceria com o Núcleo de Ensino e Pesquisa do Instituto Mario Penna. Graduada (2016) e mestre (2019) em Biotecnologia pela Universidade Federal de Uberlândia - campus Patos de Minas. Foi pós-doutoranda no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC) do Instituto Nacional do Câncer (INCA). Tem forte vivência na área de Biologia Molecular e Bioinformática, com experiência de análise de dados de sequenciamento de nova geração. Atualmente desenvolve pesquisa voltada para o estudo de melanomas.
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E-mail: tamires.alves@ensino.inca.gov.br
ORCID: 0000-0002-1507-2811
Maria Fernanda Ribeiro Dias, PhD. Foi pesquisadora DTI no projeto Genomas Brasil - INCA, atuando em pesquisas relacionadas à Biologia Computacional, Bioinformática e Biotecnologia. Atuou como pós-doutoranda na Universidade de Auburn - USA (2022-2023), utilizando métodos computacionais na investigação de interações entre macromoléculas de organismos infecciosos. Possui doutorado em Biotecnologia pelo INMETRO (2018), Mestrado em Modelagem Computacional com ênfase em bioinformática pelo Laboratório Nacional de Computação Científica (2014) e graduação em Licenciatura em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (2010). Foi professora de Biologia da rede estadual do Espírito Santo (SEDU-ES). Atuou como técnica pedagógica na Superintendência Regional de Educação de Vila Velha - ES (SREVV-ES), compondo o Comitê de Monitoramento e Assessoramento das Avaliações Externas do Estado do Espírito Santo (COMAES) e pesquisando Educação e Sistema de Gestão Educacional.
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Elvismary Molina de Armas, PhD em Ciências Informática na área de Banco de Dados e Bioinformática, na PUC-Rio (2019). Mestre em Informática Aplicada na Universidade de Ciências Informáticas de Cuba (UCI) e possui graduação em Engenharia Informática pela mesma universidade. Atualmente está vinculada ao Laboratório de Bioinformática e Bancos de Dados (BioBD) da PUC-Rio e é pós doutoranda no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC) do Instituto Nacional do Câncer (INCA). Possui experiência no desenvolvimento de software para bioinformática e gerenciamento de informações biomédicas. Como foco atual tem o desenvolvimento de fluxos de trabalho científicos, especificamente para chamadas de variantes genéticas seguindo as melhores práticas do estado da arte, assim como desenvolvimento de algoritmos e estruturas de dados para dar suporte a tarefas de bioinformática como montagem de novo.
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Caroline P. Poubel, PhD. Doutora junto ao Grupo de Onco-Hematologia Molecular e ao Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional, ambos no Instituto Nacional de Câncer (INCA). Possui Bacharel em Biomedicina com ênfase em análises clínicas pela Universidade Federal Fluminense (UFF), além de ser mestre e doutora em Oncologia pelo INCA. Tem experiência na área de Biologia Molecular, atuando principalmente em estudos de alterações genéticas e epigenéticas na etiologia das leucemias agudas. Nos últimos cinco anos, tornou-se especialista em bioinformática, trabalhando com dados ômicos utilizando programação em R e Bash. Atualmente, sua linha de pesquisa tem como foco o estudo de RNAs enhancers (eRNAs) na regulação da transcrição gênica através da análise de dados provenientes de ChIP-seq e RNA-seq. Atualmente participa de um projeto na IARC.
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Link para o Linkedin: www.linkedin.com/in/caroline-poubel
Jéssica Gonçalves Vieira da Cruz, MSc. Foi aluna de Aperfeiçoamento II do Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional do Instituto Nacional do Câncer. Graduação em Biomedicina com ênfase em Pesquisa Científica pela Universidade Federal Fluminense (UFF - Brasil) com período sanduíche na University of Hull, Reino Unido. Tem experiência laboratorial em Microbiologia geral e aplicada, utilização da técnica de PCR (reação em cadeia da polimerase), Western Blotting, ensaios de uptake de Ca++, transformação bacteriana e transfecção de células em cultura para expressão de proteínas mutadas. Fez Aperfeiçoamento I e Mestrado em nosso laboratório, agregando dados ômicos (RNA-seq, ChIP-seq, metilação, proteômica) e clínicos a fim de entender como a função de ZNF429 e a regulação de seus potenciais alvos impacta a sobrevida de pacientes com adenocarcinoma seroso de alto grau de ovário.
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Marco Antônio Pretti, MSc. Técnico em biotecnologia pelo Instituto Federal do Rio de Janeiro (IFRJ - Brasil) e graduado em Farmácia pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ - Brasil) com graduação sanduíche na Université de Bordeaux, France. Possui experiência em biologia molecular, cultivo celular, terapia gênica e sistema de transfecção e transdução celular. Desenvolveu uma análise imunológica in silico em dados de sequenciamento de nova geração como parte de seu projeto de mestrado no Instituto Nacional de Câncer (INCA - Brasil). Passou um ano fazendo doutorado sanduíche na França colaborando com o Instituto Gustave Roussy e o Instituto Curie no âmbito do seu projeto de doutorado e durante esse periodo descreveu as reatividades cruzadas de linfócitos T utilizando a carga eletrostática da molécula de HLA que interage com os linócitos T CD8, e assim defendeu sua tese de doutorado intitulada "Avaliação da patencial reatividade cruzada de receptores de células T para epítopos tumorais".
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Giovanna R. Maklouf, MSc. Graduada em Biotecnologia pela Universidade Federal do Amazonas (UFAM). Desenvolveu, como projeto de mestrado, a caracterização do microambiente tumoral do câncer de ovário, integrando transcriptômica de single-cell e bulk para investigar o impacto de diferentes subpopulações nos desfechos das pacientes. Atualmente, é estudante de doutorado no Laboratório de Genômica e bioEnergia (LGE) na Universidade Estadual de Campinas (Unicamp), onde trabalha com prospecção high-throughput de fenótipos industriais em coleções de isolados de leveduras e engenharia de cepas de interesse bioenergético. A prospecção inclui análise de diversos dados (genômica, transcriptômica, QTL), parte dessas habilidades devidas ao aprendizado durante o mestrado no LBBC.
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Brena Duraes Rangel dos Santos. Graduanda em Biomedicina pelo Instituto Brasileiro de Medicina de Reabilitação,foi aluna de iniciação científica no Instituto Nacional do Câncer (INCA) no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (LBBC).
Natasha Andressa Nogueira Jorge, PhD. Pós-doutoranda do Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional do Instituto Nacional de Câncer. Possui doutorado e mestrado em Biologia Computacional e de Sistemas pela Fundação Oswaldo Cruz e graduação em Biomedicina pela Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro. Nos últimos três anos, realizou um estágio de 9 meses em Cambridge University, trabalhando com microRNA RNA-Seq em diferentes tipos celulares sanguíneos, publicou dois artigos e co-orientou uma aluna de Iniciação Científica. Atua principalmente nos seguintes temas: RNAs não codificadores, sequenciamento de alta vazão, bioinformática, riboswitches e transcriptoma.
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Daniel Andrade Moreira, PhD. Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Federal do Rio Grande do Norte (2008), mestrado em Ciências (Biofísica) pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2012) e doutorado em Ciências pelo Programa de Pós-graduação em Biologia Computacional e Sistemas do Instituto Oswaldo Cruz - FIOCRUZ. Possui prática com várias técnicas de biologia molecular. Tem experiência na área de genética, biologia molecular, transcriptômica, genômica, bioinformática e programação (R, Perl e Shell script). Atuou em projetos de montagem e anotação de transcriptomas e genomas mitocondriais, com enfâse nas áreas de evolução e sistemática molecular (análises filogenéticas). Foi bolsista de pós-doutorado no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (Instituto Nacional de Câncer), atuou analisando dados provenientes de sequenciadores de alto desempenho com intuito de caracterizar de forma abrangente os eventos moleculares em diversos tipos tumorais. Atualmente trabalha na Plataforma de Bioinformática (RPT04A), inserida na Rede de Plataformas Tecnológicas da Fiocruz.
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Guilherme Duarte de Moraes. Técnico em programação pelo instituto de tecnologia ORT e graduando no bacharelado de Ciências Biológicas com ênfase em ecologia pela Universidade Veiga de Almeida (UVA). Atualmente está fazendo IC no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional do Instituto Nacional de Câncer desenvolvendo técnicas de machine learning para identificação de lncRNAs com potencial de serem biomarcadores de prognóstico em melanoma metastático.
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Palloma Porto Almeida, MSc. Bacharel em Biotecnologia pela Universidade Federal da Bahia (UFBA) e Mestre em Biologia Celular e Estrutural pela Universidade Federal de Viçosa (UFV). Possui experiência em biologia celular teórica e experimental, bioterismo, citometria de fluxo, histopatologia, purificação de proteínas nativas e recombinantes, e divulgação científica. Atualmente é discente de Aperfeiçoamento II no Instituto Nacional do Câncer (INCA) no Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional, analisando dados de single-cell RNA-sequencing para a identificação de subpopulações de macrofágos no microambiente tumoral de melanoma e associação destas subpopulações com a progressão da doença, resposta a terapia e prognóstico.
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