研究設備及器材

材料:

2X Power Masterix 110µL 、ddH2O 300µL、1.5mL Eppendorf 2個、瓊脂凝膠凍、核酸標誌(DNA 1kb ladder)、電泳分析儀、移液管

樣本(鴨的DNA):

北京鴨(Pekin)、番鴨(Mule)、土番鴨(Muscovy) 各5µL 

引子:

CHD primer (forward)、CHD primer (reverse)、CAUD006 primer (forward)、CAUD006 primer (reverse) 各5µL 

研究原理

(一) 聚合酶連鎖反應(PCR)

一種在試管中放大DNA片段的技術。

PCR的流程包括三個主要步驟：

1. DNA變性（Denaturation）：將PCR反應混合液加熱至高溫（約94-98°C），破壞氫鍵使DNA雙股解旋成單股，即分離成兩條單股DNA。

2. 引子黏接（Annealing）：將反應溫度降低至50-65°C，使引子（primer）與目標DNA序列的特定區域互補配對。

3. 引子延伸（Extension）：將溫度升高至72°C，加入DNA聚合酶，使其在較高的溫度下進行DNA合成。DNA聚合酶以引子作為起始點，沿著目標序列進行DNA合成，製造出一個新的DNA鏈。

上述三步驟組成一PCR循環。每個循環會產生兩倍的DNA片段。每個循環以指數級增加DNA的數量。

(二) 引子(primer)

在分子生物學中使用的短DNA或RNA序列，與目標序列的特定區域完全互補配對，用於指定DNA/RNA複製的起始點。

通過與目標序列互補配對，引物將定向結合到目標序列上

(三) 微衛星DNA（microsatellite DNA）

由重複的短DNA序列組成，具2至6個核苷酸的重複單元。具高度變異性，即其長度在個體和種內不同品系之間可有很大的差異。此特性使得微衛星DNA可用以研究種內不同品系間的遺傳差異或族群遺傳的探討的工具。

當使用微衛星DNA進行遺傳差異或族群遺傳的研究時，分析不同個體或族群中特定微衛星位點的DNA序列或長度變異。這些變異可以用來比較不同個體之間的遺傳差異，並建立物種間的親緣關係。

研究方法

1.在小瓶子裡加入如圖二所示的試劑及樣品

2.將藥品放入裝有瓊膠凝脂的盒子如上圖配置

觀察其電泳結果

從上圖得知，不論是CHD組或是CAUD組，分離出的DNA片段北京鴨與番鴨的相同，故親緣關係較近

由上圖多餘的DNA片段呈現位置可知有受到相當的汙染，故對於此實驗結果有一定程度的影響，

經歷此次經驗，下次進行實驗時要銘記在心，更加注意實驗細節及衛生。