El CEIB UNMSM está conformado por todos los estudiantes de Ingeniería Biomédica UNMSM. Por lo tanto, tiene diferentes grupos de representación que cumplen funciones específicas.
Es el órgano supremo de la asociación y está constituida por todos los asociados es presidida y convocada por el Presidente de la Junta Directiva o por quienes haga sus veces de manera ordinaria se reunirá dos veces al año.
Es un órgano de dirección, ejecución y administración responsable de la buena marcha institucional de la asociación, sus funciones se ejercen en un período anual.
Es un órgano de la asociación que convoca a los representantes de los estudiantes de cada promoción (bases estudiantiles) con la Junta Directiva.
Es un órgano máximo en materia electoral, es autónomo en lo administrativo y económico.
Son grupos de trabajos dirigidos por la Junta Directiva. Actualmente, son 7 comités en los cuáles pueden participar todos los estudiantes.