La base 2019 se organizó inicialmente en 5 comités: CODA, CRECO, CODI, COR y CIR, con el objetivo de formar una base organizada de estudiantes que se orienten a lograr el desarrollo de la carrera.
Posteriormente, a partir de los comités, se creó el CEIB-UNMSM conformada por una presidencia, dos vicepresidencias y diez direcciones. Haciendo oficial su conformación en una Asamblea General de Estudiantes el 18 de Abril del 2021 con participación de la Base 2019 y 2020.
El 11 de Marzo del 2022, el CEIB-UNMSM recibió la aprobación como organización estudiantil en Consejo de Facultad de la FIEE.
El acta de constitución del CEIB-UNMSM se da en la Primera Asamblea General de Estudiantes de Ingeniería Biomédica UNMSM.
El Estatuto describe los cargos y funciones del Centro de Estudiantes de Ingeniería Biomédica UNMSM.