PyVE - Philantomba monticola polyomavirus 1

Philantomba monticola polyomavirus 1

Philantomba.pdf

VP2

ATGGGAGCCATAATTTCATCCCTCGTGGAAATGATTGCCTTAGCTACAGAAATCAGTGCTGCCTCGGGATTAACAATTGAAGCTCTACTTACTGGAGAAGCTTTGGGAGCATTAGAAGCTGAAGTTTTTTCTTTAATGTCAATTGAAGGCCTCTCAGGAATTGAAGCATTAGCTCAGCTGGGCTGGACTGCAGAACAATTTTCAAATTTAGCCTTTATAGCCTCTACTTTTTCAGATGTGGTAGGATACGGAGTATTCTTCCAGACTACATCCGGATTGGCTAGTCTAATCTCTGTGGGACTAAGGTTAGGACTGGATGTTGCTTCAGTTAATAGAAACCAGACTGAACAAACCTTATTGGCCATATTTGGGGAAGTTTCCAAACTAATTCCTATAAATATATCCTATCATCTAAATCCATTAAAATGGGAGGAAAGTTTAAAAACTAACTGCCCTAAGGATTTAGAAAATATTCCCATAGAAATGAGACATATAATTGGAGTTTTAATGCAAAACAGCCGGTGGGTTATACAATCCAGTCCTACCACAGATCCACAAAAAGAGAGTGGAGATATTGTTGAGTTTCAGCCACCTCCTGGGGGAGCTAACCAACCTGCAACTCCTGACTGGATGCTTCCTTTAATTTTAAGGTTAAATGGCGCCTCCAAAGAAAAGAGTTCGCTGTGTAGCTGA

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VP1

ATGGCGCCTCCAAAGAAAAGAGTTCGCTGTGTAGCTGAAAAGGTTAAATGCCCACCTACCCAGAAGCCCAAAACATGTCCCGTCGCTGCTCCTGTTCCCAAACTGCTTATAAAGGGAGGAGTAGAAGTGCTTAATGTAGAAACAGGCCCAGATGCTTACACAGAAATTGAGCTTTTCCTTAATCCCAGAATGGGATTTAATAATCCCAAAGGAGACAAAAGTACCTGGTATGGATGGAGTGAAGTAATTCATCATGGAGATGGCAATGAACAAAACCTCCTAAGTAGCCAATTACCTCAATATAGCTGTGCAAGAGTTCAACTCCCCTTGCTTAATGAAGACATGACATGTAACACACTAAGAATGTGGGAGGCTGTCTCTTGTAAAACAGAGGTTGTTGGGATAGGTTCCTTAATTGACATCCATATTCCAGAAGCCAAACATGCTGAAACATATGGAATAACATACCCAGTACAAGGCCTTAATTACCACATGTTTGCAGTTGGCGGGGAACCTCTAGATCTCCAAGGTATTGAAATGAATGGAGACACCCTGTATGCTGTGGGCAATCCCAGACTAACTGTGCATCCAAATGACATAACAAATTTTCCAGTGAAGGATAAACACCAGCTTCAAGGCCTTATTCCCAAGGCGAAAGCTAAGCTAGATAAAGATGGCTTTTATCCTGTGGAGGAATGGAGCCCTGATCCTAGCAGAAATGAAAACAGTAGATATTTTGGATCTTTTGTAGGAGGAATATCTAGTCCTCCTACTCTCCAATTTACCAACAGTGTGACCACAGTATTGCTAGATGAAAATGGAGTAGGCCCTCTTTGTAAAGGAGATGGCCTTTTTGTGTCTTGTGCAGATATTTGTGGCATAATGATTAAAAATGATAATGGAGGAGCTAGATTTAGAGGTCTTCCTCGCTACTTTAAGGTAACCTTAAGGAAAAGAGTAGTTAGAAACCCATATCCAATCAGTTCCTTGCTGGGTAGCCTATTTTCAGATCTTATGCCTAAACTAGATGGTCAGCCCATGTCAGGCCAAGATGCCCAGGTGGAAGAAGTTAGAGTTTATGAGGGAAAAGAAGGCCTTCCTGCAGATCCAGATGTTAGAAGATATATAGACCAGTTTGGCCAAGAAAAAACCCAACCCCCTGCCCCAGGAGCAGTAGCCACTCCATACTATATAACTGAACTTCTAAAGAAAAAGTATCCTTACCTCCTTGAAGAAAAAGAAGAGTCAAAAACACCAGAAGATTTAGAAGAGTCTCCTACTCTTCCTGAAGCCTCTGCTACAACTGCAGCAACAACTGAAGAAATAACTGAACATAACTTAATTACTGAAGATTATACTAGTAAAGAGCCAGAGCCTCCAGCTATGTTTGGGGGTCGCCGCACAGTAGAATTAAAGGGAGAGTCAGGCGAAAGTCTCCGTTAA

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Large T-antigen

ATGGACCGTCTGCTGCAGAAAGAGGAGAAAGCTCTGCTTATTAAGCTTTTAGGCATAAGTCCTACCTCCTTTGGAAATATACCTTTAATGAGAGATGCTTATAAAAGGGCATCCAAAAAATATCATCCTGATAAAGGAGGAGAAGGAGTAGAAATGACCCTTTTAAATTCTCTCTGGCAAAGATTTCAGGAGGGGCTGCTTGAACTCAGAAATCCTGAGGTTTATTCTGAGGCTTATGGCTCGCCGGCCTTCAGAGAGAGATATAGAGAATGGTGCTCCACAGTATTTACCAATGAAGAATCTGAATTCAGAGGAGATTTACACTGTGATGAGTCCATTATCTCCAGTGAAGAAGAAGATGCACAGGAATTCACGCAAGAGTCTGGATATAACTCAGCATCCTTCTCTGCTACCTTTCCCAACACCCCCGATGAATCCCGGGCCTCCTCCACCTCTACCACCCAAAAGGATCAGGCGTTCAGTGAGTCTAAATCCTACTCCTCCTCCAAGGGTTCAACTCCTGGAAGACGAAGTGAGGGATTTGAAGGAGAAACTCCAAAAAAGAGACGAAGACCTGCTGAAAACCTGGATGAATCTCATTCAAGCTCGCAAGCTAGCTTTGCAAGCACACCGCCAAAAACAAAAAAGACAAGCACTGACTGTCCTGATGATATTCCTTCTGGTCTGTTTGATTTTGTCAGTCATGCTGTATTTTCTAATAAGACAGTGAATTGTTTTTTACTGTATTCTACCTTTGATAAAGCTTCTGCATTTTATGATAAAATTGAAAAATTTACTATAGAATTTAAAAGCTTACATTCTTATGAAGCTGCTGGTATATTATTTTTCTTAACTAACAAAAAGCACAGATTATCTGCAGTTAAGAATTTCTGTCAGTCATATTGCACTGTAAGTTTTCTAATATGTAGAACTGTTTTAAAACCTTTAGATTGTTTTAATTGTCTTTGTAAAACTCCTTTTAAATGTGTGAAATCAAATAAGCCAGGTTTGCACTCCTATGATTTTGATGACAAATCAGAAGAGGCCTGTAATTGGAACAAGGTTGCAGATTTTGCTGTTAAAGCTAATGTTGATGACCCACTCCTAATTTTAGCTCATTACCTTGATTTTGCTGCTCCATTTCCTTGTAAAAAATGTGCTAACCCAAAAACAAAAGCGCATGAATTTCATCAAGAGCATCATGCAAATGCTGTGTTGTTTGAAAATAGCAAAAGTCAGAGAGCAATCTGTCATCAAGCTAGTGACATTGTCTTGGCTAAAAGGAGACTTTTAGTTGCTGAGTGTACAAGGTCAGATCTTCTCACAACCTTTTTTGAAAAACAGCTAACAGTGCTAAAGTCATTAGATGAGGTGGACATAATAGACCATATGGCAGGGGTTGCCTGGTATGCATGTTTACTTGATGACATCGACAAAATTTTAGTAAAGATAATCACTCTAATTACTGAAAATGTTCCTAAACAAAGAAACATATTATTTAAAGGGCCTGTAAACACTGGGAAAACAACATTAGCAGTAGCAATTATGGATTTGCTAGAAGGTAAAAGTTTAAATGTTAACTGTCCTGCAGATAAGCTAAACTTTGAATTAGGATGTGCAATAGATAAATTTGCTGTGGTTTTTGAAGATGTCAAAGGTCAAAGTGGCTCTAAGCGGGGCCTACAACCAGGACAAGGTGTATCTAATCTTGACAATTTAAGAGATTATTTAGATGGAGCTGTGCAAGTTAATTTAGAAAGAAAACATGCTAATAAAAGGAGTCAAATCTTTCCGCCTTGTATTGTAACTATGAATGAGTATTTTATACCTGAGACATTATTTGTAAGATTTTCATTAAAGGTAGATTTTGAACATAAGCCTAATTTACACACTGCCTTGTCTAAAGCACCTATCTTACTAAAAAAGAGAGTGTTACAGAAAGGTGTGACACTGTTTATGCTTCTTATGTGGTATTTGCCTAACCAAAAATTTGCTGTATCTTTGCAAGAAGAAATTGCAAGTTGGAAATCTGTAATTGAGGCCTCAGTTTCATGGTCTAATTATTGTACAATGATTGAAAACATTGAAGTGGGGGAAAGTCCCTTAGAAGGTTTGTTGGAAGAAGTACCAGAAGACTCATAA

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Hypothetical Protein

ATGGCTCCCATTTCTATAAAAAAATTAAAAAGTACTTACATCTTTTGTGAGGATGGCCGGTCACCACCAGCTAAGTTGTGCTTGGCAGGTCACGCCGTGAGAATAATGCTGAGGGAGGAGTTTTACTTCCCTTACTTATTTCCTCTGCGCCGGAAATTTGGCTCATGGCCTGAATTGTTCATGAGTAATCAAAGGGAAGTTCACTGCCAAGGCACAGGTGGCTGCCTGCCAAATGTCTGGGCTACATGCCAGTTCTCTTATGTTCCTTATTTTTTTTAA

/translation="MAPISIKKLKSTYIFCEDGRSPPAKLCLAGHAVRIMLREEFYFPYLFPLRRKFGSWPELFMSNQREVHCQGTGGCLPNVWATCQFSYVPYFF"

776T protein

ATGGACCGTCTGCTGCAGAAAGAGGAGAAAGCTCTGCTTATTAAGCTTTTAGGCATAAGTCCTACCTCCTTTGGAAATATACCTTTAATGAGAGATGCTTATAAAAGGGCATCCAAAAAATATCATCCTGATAAAGGAGGAGAAGGAGTAGAAATGACCCTTTTAAATTCTCTCTGGCAAAGATTTCAGGAGGGGCTGCTTGAACTCAGAAATCCTGAGGTATGTGTAGCTTGGTTTTCTGATCTCTTAGACATTACGTTGATTGATGTTTGTGGCTACACAAAATTTAACAATCAATTTTTGAGAGTGCCTGCTTGCTTAATGCCGGGGCAATCAACGTGCTGCTGCATTACTAGTCAGCTTCTTACACAGCATGCCCTTGCAAAAAAATCAGGCCAGAGATGTCAGGTTTATTCTGAGGCTTATGGCTCGCCGGCCTTCAGAGAGAGATATAGAGAATGGTGCTCCACAGTATTTACCAATGAAGAATCTGAATTCAGAGGAGATTTACACTGTGATGAGTCCATTATCTCCAGTGAAGAAGAAGATGCACAGGAATTCACGCAAGAGTCTGGATATAACTCAGCATCCTTCTCTGCTACCTTTCCCAACACCCCCGATGAATCCCGGGCCTCCTCCACCTCTACCACCCAAAAGGATCAGGCGTTCAGTGAGTCTAAATCCTACTCCTCCTCCAAGGGTTCAACTCCTGGAAGACGAAGTGAGGGATTTGAAGGAGAAACTCCAAAAAAGAGACGAAGACCTGCTGAAAACCTGGATGAATCTCATTCAAGCTCGCAAGCTAGCTTTGCAAGCACACCGCCAAAAACAAAAAAGACAAGCACTGACTGTCCTGATGATATTCCTTCTGGTCTGTTTGATTTTGTCAGTCATGCTGTATTTTCTAATAAGACAGTGAATTGTTTTTTACTGTATTCTACCTTTGATAAAGCTTCTGCATTTTATGATAAAATTGAAAAATTTACTATAGAATTTAAAAGCTTACATTCTTATGAAGCTGCTGGTATATTATTTTTCTTAACTAACAAAAAGCACAGATTATCTGCAGTTAAGAATTTCTGTCAGTCATATTGCACTGTAAGTTTTCTAATATGTAGAACTGTTTTAAAACCTTTAGATTGTTTTAATTGTCTTTGTAAAACTCCTTTTAAATGTGTGAAATCAAATAAGCCAGGTTTGCACTCCTATGATTTTGATGACAAATCAGAAGAGGCCTGTAATTGGAACAAGGTTGCAGATTTTGCTGTTAAAGCTAATGTTGATGACCCACTCCTAATTTTAGCTCATTACCTTGATTTTGCTGCTCCATTTCCTTGTAAAAAATGTGCTAACCCAAAAACAAAAGCGCATGAATTTCATCAAGAGCATCATGCAAATGCTGTGTTGTTTGAAAATAGCAAAAGTCAGAGAGCAATCTGTCATCAAGCTAGTGACATTGTCTTGGCTAAAAGGAGACTTTTAGTTGCTGAGTGTACAAGGTCAGATCTTCTCACAACCTTTTTTGAAAAACAGCTAACAGTGCTAAAGTCATTAGATGAGGTGGACATAATAGACCATATGGCAGGGGTTGCCTGGTATGCATGTTTACTTGATGACATCGACAAAATTTTAGTAAAGATAATCACTCTAATTACTGAAAATGTTCCTAAACAAAGAAACATATTATTTAAAGGGCCTGTAAACACTGGGAAAACAACATTAGCAGTAGCAATTATGGATTTGCTAGAAGGTAAAAGTTTAAATGTTAACTGTCCTGCAGATAAGCTAAACTTTGAATTAGGATGTGCAATAGATAAATTTGCTGTGGTTTTTGAAGATGTCAAAGGTCAAAGTGGCTCTAAGCGGGGCCTACAACCAGGACAAGGTGTATCTAATCTTGACAATTTAAGAGATTATTTAGATGGAGCTGTGCAAGTTAATTTAGAAAGAAAACATGCTAATAAAAGGAGTCAAATCTTTCCGCCTTGTATTGTAACTATGAATGAGTATTTTATACCTGAGACATTATTTGTAAGATTTTCATTAAAGGTAGATTTTGAACATAAGCCTAATTTACACACTGCCTTGTCTAAAGCACCTATCTTACTAAAAAAGAGAGTGTTACAGAAAGGTGTGACACTGTTTATGCTTCTTATGTGGTATTTGCCTAACCAAAAATTTGCTGTATCTTTGCAAGAAGAAATTGCAAGTTGGAAATCTGTAATTGAGGCCTCAGTTTCATGGTCTAATTATTGTACAATGATTGAAAACATTGAAGTGGGGGAAAGTCCCTTAGAAGGTTTGTTGGAAGAAGTACCAGAAGACTCATAA

/translation="MDRLLQKEEKALLIKLLGISPTSFGNIPLMRDAYKRASKKYHPDKGGEGVEMTLLNSLWQRFQEGLLELRNPEVCVAWFSDLLDITLIDVCGYTKFNNQFLRVPACLMPGQSTCCCITSQLLTQHALAKKSGQRCQVYSEAYGSPAFRERYREWCSTVFTNEESEFRGDLHCDESIISSEEEDAQEFTQESGYNSASFSATFPNTPDESRASSTSTTQKDQAFSESKSYSSSKGSTPGRRSEGFEGETPKKRRRPAENLDESHSSSQASFASTPPKTKKTSTDCPDDIPSGLFDFVSHAVFSNKTVNCFLLYSTFDKASAFYDKIEKFTIEFKSLHSYEAAGILFFLTNKKHRLSAVKNFCQSYCTVSFLICRTVLKPLDCFNCLCKTPFKCVKSNKPGLHSYDFDDKSEEACNWNKVADFAVKANVDDPLLILAHYLDFAAPFPCKKCANPKTKAHEFHQEHHANAVLFENSKSQRAICHQASDIVLAKRRLLVAECTRSDLLTTFFEKQLTVLKSLDEVDIIDHMAGVAWYACLLDDIDKILVKIITLITENVPKQRNILFKGPVNTGKTTLAVAIMDLLEGKSLNVNCPADKLNFELGCAIDKFAVVFEDVKGQSGSKRGLQPGQGVSNLDNLRDYLDGAVQVNLERKHANKRSQIFPPCIVTMNEYFIPETLFVRFSLKVDFEHKPNLHTALSKAPILLKKRVLQKGVTLFMLLMWYLPNQKFAVSLQEEIASWKSVIEASVSWSNYCTMIENIEVGESPLEGLLEEVPEDS"

ALTO

ATGGCTCGCCGGCCTTCAGAGAGAGATATAGAGAATGGTGCTCCACAGTATTTACCAATGAAGAATCTGAATTCAGAGGAGATTTACACTGTGATGAGTCCATTATCTCCAGTGAAGAAGAAGATGCACAGGAATTCACGCAAGAGTCTGGATATAACTCAGCATCCTTCTCTGCTACCTTTCCCAACACCCCCGATGAATCCCGGGCCTCCTCCACCTCTACCACCCAAAAGGATCAGGCGTTCAGTGAGTCTAAATCCTACTCCTCCTCCAAGGGTTCAACTCCTGGAAGACGAAGTGAGGGATTTGAAGGAGAAACTCCAAAAAAGAGACGAAGACCTGCTGAAAACCTGGATGAATCTCATTCAAGCTCGCAAGCTAGCTTTGCAAGCACACCGCCAAAAACAAAAAAGACAAGCACTGACTGTCCTGATGATATTCCTTCTGGTCTGTTTGATTTTGTCAGTCATGCTGTATTTTCTAATAAGACAGTGA

/translation="MARRPSERDIENGAPQYLPMKNLNSEEIYTVMSPLSPVKKKMHRNSRKSLDITQHPSLLPFPTPPMNPGPPPPLPPKRIRRSVSLNPTPPPRVQLLEDEVRDLKEKLQKRDEDLLKTWMNLIQARKLALQAHRQKQKRQALTVLMIFLLVCLILSVMLYFLIRQ"

Small T-antigen

ATGGACCGTCTGCTGCAGAAAGAGGAGAAAGCTCTGCTTATTAAGCTTTTAGGCATAAGTCCTACCTCCTTTGGAAATATACCTTTAATGAGAGATGCTTATAAAAGGGCATCCAAAAAATATCATCCTGATAAAGGAGGAGAAGGAGTAGAAATGACCCTTTTAAATTCTCTCTGGCAAAGATTTCAGGAGGGGCTGCTTGAACTCAGAAATCCTGAGGTATGTGTAGCTTGGTTTTCTGATCTCTTAGACATTACGTTGATTGATGTTTGTGGCTACACAAAATTTAACAATCAATTTTTGAGAGTGCCTGCTTGCTTAATGCCGGGGCAATCAACGTGCTGCTGCATTACTAGTCAGCTTCTTACACAGCATGCCCTTGCAAAAAAATCAGGCCAGAGATGTCAGGTATGGGGTCAATGCTTTTGCTACTATTGCTTTTGCATTTGGTATGGTTTTAAACATTGCAATAATAGTATTGAGTGGTGGAAATTCACCGTTGGCAATACCTCAAACATGATTCTGAAAATACAAACAGGTTTATTCTGA

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Small T-antigen

ATGGACCGTCTGCTGCAGAAAGAGGAGAAAGCTCTGCTTATTAAGCTTTTAGGCATAAGTCCTACCTCCTTTGGAAATATACCTTTAATGAGAGATGCTTATAAAAGGGCATCCAAAAAATATCATCCTGATAAAGGAGGAGAAGGAGTAGAAATGACCCTTTTAAATTCTCTCTGGCAAAGATTTCAGGAGGGGCTGCTTGAACTCAGAAATCCTGAGGTATGTGTAGCTTGGTTTTCTGATCTCTTAGACATTACGTTGATTGATGTTTGTGGCTACACAAAATTTAACAATCAATTTTTGAGAGTGCCTGCTTGCTTAATGCCGGGGCAATCAACGTGCTGCTGCATTACTAGTCAGCTTCTTACACAGCATGCCCTTGCAAAAAAATCAGGCCAGAGATGTCAGGTATGGGGTCAATGCTTTTGCTACTATTGCTTTTGCATTTGGTATGGTTTTAAACATTGCAATAATAGTATTGAGTGGTGGAAATTCACCGTTGGCAATACCTCAAACATGATTCTGAAAATACAAACAGGTAAGTACCATTTGTTTAGATTAGGGTTATGTATCTACAAGATGATTAATCCATTTGTTTACATAGGTTTATTCTGA

/translation="MDRLLQKEEKALLIKLLGISPTSFGNIPLMRDAYKRASKKYHPDKGGEGVEMTLLNSLWQRFQEGLLELRNPEVCVAWFSDLLDITLIDVCGYTKFNNQFLRVPACLMPGQSTCCCITSQLLTQHALAKKSGQRCQVWGQCFCYYCFCIWYGFKHCNNSIEWWKFTVGNTSNMILKIQTGKYHLFRLGLCIYKMINPFVYIGLF"

Last Revision: 5/5/2021