Proposito y Guia del Usuario
Esta Ud. en un sitio Web dedicado a los conceptos y metodos de "Ecological Niche Modeling (ENM)" y su pariente cercano "Species Distribution Modeling (SDM)". Lo mas probable es que su interes sea el de modelar distribuciones de especies, intentando obtener un mapa que represente algo como la distribucion histórica, que llamaremos siempre el area ocupada (simbolo: Go), previa a los cambios intensos que se han dado en los últimos siglos por la presencia humana.
En esta pagina de Web presentamos recomendaciones practicas sobre el uso de algunos algoritmos principales, asi como los elementos teóricos necesarios para interpretar los resultados.
Las tres preguntas conceptuales clave en SDM y ENM son:
1) ¿Que objeto (área potencial, área invadible área ocupada), o sus corresponidentes ambientes (nicho fundamental, nicho fundamentalexistente, nicho realizado) se desea estimar?
2) ¿Con que clase de datos se cuenta (únicamente presencias, presencias y ausencias estrictas, presencias y pseudo-ausencias, o presencias y datos de fondo (background data)? y, finalmente
3) ¿Cual es el contexto ecologico y biogeografico del problema, o configuracion BAM (especies en una isla, especies en un continente, especies expandiendo su rango...)?
Las respuestas a estas preguntas determinan, primero, que metodo (Maxent, GARP, BIOCLIM, Metodos de Regresion...) es mas adecuado al problema, y segundo, cual es la interpretación adecuada para los resultados del ejercicio de modelacion.
Ademas, existen varias preguntas practicas muy importantes:
1) Respecto a la cantidad y tipo de de datos ¿Hay un numero mínimo de datos de presencias que se puede usar? ¿Es mejor usar cuantos mas puntos sea posible? Si tengo pseudoausencias, ¿cuantas se deben usar? Si se va a usar un metodo que genera ausencias de trasfondo ( backcground absences) ¿cuantas son adecuadas?
2) Respecto a las variables predictoras, ¿Conviene usar muchas o pocas? ¿Crudas, estandarizadas, transformadas, por ejemplo, usando PCA? ¿Categoricas o solamente numericas?
3) Respecto a la verificación. ¿Como se verifica un resultado? ¿Existe algun metodo universalmente aceptado?
4) Respecto a la extension del area de entrenamiento (el rango de valores de variables ambientales), y lo mismo para la "proyeccion". ¿Que tan amplio debe ser el rango de variables usado para entrenar, y que tanto es confiable salirse de dicho rango al transferir? ¿Es seguro extrapolar?
Los conceptos e ideas presentados aqui han sido casi enteramente publicados en revistas arbitradas o en el libro Ecological Niches and Areas of Distribution.
Los consejos prácticos son el resultado de mas de 15 años de experiencia que los autores tenemos modelando areas de distribucion y nichos, con un acumulado de varios cientos de publicaciones en el tema. En la seccion de Bibliografia se encuentran referencias y ligas a algunos de los articulos considerados clave.
El area Go de Rhynchopsitta terrisi
(area en ausencia de efectos antropogenicos),
segun Navarro y Peterson.
El diagrama BAM, ilustrando las tres áreas que se modelan en
SDM/ENM: A, GI y Go y las regiones auxiliares G y M. Los circulos cerrados representan datos de presencias y los abiertos diferentes clases de ausencias.