gnuplot - переносимая свободно распространяемая утилита для рисования двумерных и трехмерных графиков. Работает в режиме командной строки или пакетно. Есть для разных платформ и уже стоит на любом Линуксе. Позволяет рисовать графики в окне либо сохранять в различных форматах. Недостаток - ее нужно знать. Проблема всех консольных программ. Зато мощная! Впрочем, есть обертки - Octave или gplot.
Статья в Википедии, там же ссылочки, например эта.
Еще ссылки (из документации к gplot)
http://www.gnuplot.info/ http://www.ucc.ie/gnuplot/gnuplot.html http://www.duke.edu/~hpgavin/gnuplot.html