*. Уолл Л., Кристиансен Т., Орвант Дж. Программирование на Perl. 3 изд. СПб-Символ-Плюс, 2004.-1152 с. Книга автора Перла и его коллег, также тесно причастных к разработке языка. Исчерпывающее описание языка. Солидный объем говорит сам за себя, но вводная глава самодостаточна для знакомства с языком. Книга прекрасно написана и переведена, мягкий юмор превращает чтение в удовольствие.
*. Christiansen T., d Foy B., Wall L., Orwant J. - Programming Perl, 4th Edition - 2012 - Переиздание, в оригинале. Описание возможностей новейших версий Perl5/
*. Кристиансен Т., Торкингтон Н. Perl: библиотека программиста (в оригинале The Perl cookbook) - сборник рецептов и идиом языка.
*. Фридл Дж. Регулярные выражения. 3 изд. СПб-Символ-Плюс, 2008.-608 с. - Исчерпывающее изложение регулярных выражений. Солидная часть книги посвящена Perl, но далеко не вся книга - сначала описаны регэкспы вообще, а потом - специфика для Перла и других языков.
*. Lidie S., Walsh N. Mastring Perl/Tk. O'Reilly, 2002. - Книга о библиотеке Tk для Perl, позволяющей создавать годные оконные интерфейсы. Полезно для окошка с циферками, которые потом будут записаны в файл и скормлены расчетной программе на Фортране.
*. Schwartz R., Foy B., Phoenix T. - Learning Perl, 6th Edition - 2011 в трех форматах (pdf, epub и mobi) - учебник, а также упражения у нему - Foy B. - Learning Perl Student Workbook, 2nd Edition - 2012 в двух форматах (pdf и epub) - в одном архиве. Отличный учебник причастных к Перлу людей.
Это не все, далеко не все, но этого достаточно для начала. Теперь ссылки. Их много, но нет смысла ими делиться. google все равно знает больше. Я нахожу что-то интересное, сохраняю ссылку... а потом ищу снова, нахожу тот же или иной ресурс, сохраняю ссылку...ссылок море, а я все равно ищу - так быстрее. Отмечу только "наше все" CPAN - Comprehensive Perl Archive Network - громадная коллекция модулей Perl на все случаи жизни, прекрасно структурированная и с великолепным поиском. Модули прекрасно документированы (POD, а что вы хотели!) и проверены. В большинстве своем, во всяком случае. Как говорят, голый Перл может чему-то уступать, но Perl+CPAN не уступает ничему. Утрировано, но в целом - верно.