En función del análisis del proceso de aprobación y de los hallazgos obtenidos, se realiza un análisis de riesgos de corrupción que nos permite conocer cuál es la valoración de cada uno de ellos. Los elementos más importantes desprendidos de nuestro análisis en este municipio fueron los siguientes:

1. No se cuenta con información pública disponible para conocer el procedimiento para obtener los trámites de Régimen de Propiedad de Condominio, Licencia de Fraccionamiento, Licencia de Construcción y Constancia de Uso de Suelo, siendo este último uno de los más importantes para la aprobación de proyectos turísticos con impacto ambiental.

2. En el Reglamento de Conservación Ambiental para el Municipio de Puerto Morelos, se pide para los trámites que éste contiene, entregar los formatos debidamente llenados, sin embargo, no se cuenta con un manual o instructivo para llenarlos.