AWS CLIの使い方

AWSはAmazonのクラウドサービス (ファイル共有サービス) です。

個人的にはBGI社からのシーケンスデータがAWSで送られてくるので、そのときに使用しています。

シーケンスデータのfastqファイルはいくつかに分かれている場合が多いので、一つずつしかダウンロードできないS3のマネジメントコンソールは使用しづらいです。

そこでAWSのCUIバージョン (AWS CLI) を使用しています。

AWS CLIの使い方

1.  AWS CLIのインストール

AWS CLIをインストールしてください。

公式ドキュメント：https://docs.aws.amazon.com/ja_jp/cli/latest/userguide/getting-started-install.html

2. AWSのIDやパスワードなどの入力

aws configure

を実行するとAWS Access Key IDやAWS Secret Access Keyを入力するように求められるので、それにしたがって入力する。BGIからのデータの場合はDefault region nameとDefault output formatは入力しなくてOKです。

3. AWSからローカルにコピー

aws s3 cp s3://backetname/ /local/directory/ --recursive

s3://backetname/はリモートのバケットの名前 (BGIからのデータならS3 Bucketとかいてあります)、/local/directory/はダウンロードしたいローカルのディレクトリにしてください。

バージョン情報など

OS: Ubuntu 18.04.6 LTS

$ aws --version

aws-cli/2.11.10 Python/3.11.2 Linux/5.15.0-89-generic exe/x86_64.ubuntu.20 prompt/off

最終更新日：2023年12月28日