Rコマンダー 編
「改変Rコマンダー」について
ここで解説する統計ソフトウェアは、弘前大学の対馬栄輝先生によってプログラムされた「改変Rコマンダー」です。「改変Rコマンダー」は、フリーの統計解析ソフトウェア「R」のパッケージである「Rコマンダー」を生物統計向けに手を加え、必要な統計手法をRで計算し、結果を出力してくれる優れものです。
「改変Rコマンダー」は対馬先生のHP（https://personal.hs.hirosaki-u.ac.jp/pteiki/）から無償配布されています(最新バージョンは4.0くらい、決定木が可能になっています)。以下のURLからもダウンロードできます。
https://app.box.com/s/b9m73y09njaf7o36d8qsrhrpb42wihay
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「改変Rコマンダー」インストールと起動
使用するPC環境はWindows（MacではWindowsの仮想環境で利用可）です。PCにインストール、あるいはUSBなどにインストールしポータブルで使えます。R単体のインストールは必要ありません。
「改変Rコマンダー」の操作
Rguiをダブルクリックすると下図の右上のウインドウが起動する。使用するのは右のRコマンダー、左はRgui画面で、図などが出力される。
「改変Rコマンダー」のメニュー
主な操作は、下に示したメニューから行う。
データセットを「Rコマンダー」にのせる
① データセットをExcelなどの表計算ソフトから対象データをコピーする（エクセルデータの段階で欠損値は“NA”と入力しておく）
② ※データのヘッダー（項目名など）は重複がないようにする。日本語も使えるがアルファベットを推奨
③ Rコマンダーを起動して、メニューの“データ”→“データのインポート”→“テキストファイルまたはクリップボード,URLから…”を選択
④ この画面でデータセット名の名前（任意）を入力し、そのほかは変更しない
⑤ うまくデータがのれば、Rコマンダー画面下のメッセージに青文字で「データセットには〇行、△列あります。」と表示される（データに欠損値・ブランクを含む場合はエラーが出る）
データの確認
エクセルなどの表計算ソフトのコピーデータは、一人のデータは一行にまとめる（横方向へ並べる）。
データをRコマンダーにのせた後は、「データセットの編集」や「データセットの表示」で確認する（必要があれば編集する）。
カテゴリー変数（因子）を定義する
Rコマンダーにのせたデータのうち、名義尺度（カテゴリー変数）として取り扱う項目は数値を因子に変換する必要がある。
Rコマンダーの“データ”→“アクティブデータセット内の変数の管理”→“数値変数を因子に変換”を選択する（因子変数を数値に変換も可能）。
「数値変数を因子に変換」の新しい画面で該当する変数を選択（複数選択するときはコントロールキーを押しながら左クリック）してOKを押す。
主に使うメニュー：データ、統計量、グラフ
データ
データの読み込みや修正・加工などで使用
統計量
実際の解析で使用
グラフ
グラフの描画で使用
データ入力のルール
データはExcelなどの表計算ソフトで作成し、該当するデータ部分をコピーする。１行目はパラメタ（項目）名を入れる（日本語も使えるが、アルファベットを推奨）。１人のデータを１行に整理する。
統計量：数値による要約
「統計量」→「数値による要約」
「層別して要約」
「層別変数を選択」→「OK」
「変数を選択」→ 「OK」
統計量：数値による要約結果
尺度とデータの分布
パワーアナリシス
２標本（A群とB群）の差の検定（対応なし）
実施した検定は
「性別」による「腹筋力」に差があるかを検定
帰無仮説：差がない（この仮説を棄却できるかを検定する）
２変数（１群のみ）の差の検定（対応あり）
２標本の差の検定（対応なし）
３標本の差の検定（対応なし）
３標本の差の検定（対応なし）
級内相関係数
相関分析・相関行列
回帰分析 バイアス
重回帰分析
ロジスティック回帰分析
