エーテリアルノードには2種類あり、青い「不安定化エーテリアルノード」で進入する場合には「地脈安定器」を1つ消費します。
赤い「安定化エーテリアルノード」で進入する場合には「地脈安定器」は必要ありません。

オヴニ討伐後3分が経過する（バフの表示が6分になった直後）と、ヒュダトス各地に48個の青い不安定化エーテリアルノードが出現します。
正確な位置は毎回異なりますが、おおよその分布は下の地図の青いマークの位置のとおりです。この不安定化エーテリアルノードから進入するには地脈安定器の所持が必須となります。
更に3分が経過し、バフの残り時間が4分を切ると一度不安定化エーテリアルノード（以下、青ノード）が消え、赤い安定化エーテリアルノード（以下、赤ノード）が出現します。
出現位置の目安は青ノードと同じですが、何人かが既に青ノードで内部に進入していた場合は「残っていた青ノードの数」の赤ノードが「48ヶ所からランダム」な位置に出現します。
つまり、眼の前で青ノードが消えてもその場所に赤ノードが再出現するとは限らず、場合によっては進入で消えた青ノードの付近に赤ノードが再出現することもありえます。
島内のEL60のプレイヤーもしくはオヴニ討伐に参加したプレイヤーの数が48人以下であれば、確実にノードが余るのでその場合は全員が赤ノードで進入可能です。
NMとしてのオブニの討伐には興味があってもBAに参加しないプレーヤーもいるので島内人数が60人程度なら赤ノードで入れる可能性は高いと思います。
逆に、週末のコアタイムだったりすると島内人数が100人を超えていたりするので青ノードでの進入が必須となります。

地脈安定器はスタック可能な通常アイテムではありますが、使用するにあたってエーテリアルノードに向けてアイテムを使用するとかそういったアクションは不要です。
必要な準備は地脈安定器を所持品の中に入れておくことだけ。チョコボかばんやリテイナーに預けた状態では無効です。
あとはIDの宝箱を開けるような感覚でエーテリアルノードに近づき、クリック（パッドなら◯ボタンを押す）だけです。