水仙宮現為國家三級古蹟。草創於1683年,1715年(康熙54年)來台經商的泉漳諸商旅,為了祈求海上平安、貿易順利,不惜投下了重資,合力興建水仙宮。
臺南水仙宮主祀水仙尊王,簡稱「水仙王」,也就是海神,由於早期台灣與大陸之間的往來都靠船航行大海,對於自然現象的變化又無法預估或掌握,所以對於那些能化解海上危難的神明都敬之至誠,造成對「自然崇拜」的信仰,如山有山神、水育水神、風有風神等等。臺南的水仙宮就是除了主神大禹王以外,配祀的就是禹帝、奡王、楚王(項羽)、伍大夫(伍子胥)、屈大夫(屈原)等五位,俗稱「一帝二王二大夫」。
奡ㄠˋ王(或稱寒奡、寒澆)是中國神話與水仙尊王信仰中的海神之一,相傳為夏朝寒浞之子。他力大無窮,精通水戰,並被認為具備「陸地行舟」的神力,傳說他發明了船隻。因擅長水性且生前活躍於水上,死後被船員、漁夫奉為水仙尊王,護佑航海平安。
17世紀時期,水仙宮還位於當時台江內海的碼頭邊,當時廟前就有許多小吃攤販,甚為熱鬧,而後台江內海淤積成陸地,蒼海桑田現水仙宮前熱鬧依舊,取而代之的是熱鬧市場。