RとRcppの計算速度の比較

Code: LoopComparison.cpp Output: LoopComparison.out

• 比較する計算方法

1. Rによる計算 Code: test_RGibbs.R

2. Rcpp Code: test_RcppGibbs.cpp

3. Rcpp (+RcppAlmadillo) Code: test_RcppArmadilloGibbs.cpp

4. Rcpp (+RcppGSL) Code: test_RcppGslGibbs.cpp

5. Rcpp (+RcppAlmadillo+RcppGSL) Code: test_RcppArmadilloGslGibbs.cpp

• 計算方法の比較

Code: GibbsBenchmark.R Output: GibbsBenchmark.out