加藤 幸一郎 准教授
Associate Prof. Dr. Koichiro Kato
九州大学大学院応用化学部門 分子情報システム
分子システム科学センター(CMS)
情報基盤研究開発センター附属汎オミクス計測・計算科学センター
データ駆動イノベーション推進本部
Phone: 092-802-2922
E-mail: kato.koichiro.957[at]
部屋:West3号館 615号室
Curriculum vitae
2007年(平成19年) 東京工業大学理学部物理学科卒業
2008年(平成20年) 東京工業大学大学院理工学研究科物性物理学専攻 修士課程修了(指導教官 斎藤晋 教授)
2009年(平成21年) 日本学術振興会 特別研究員(DC1)
2011年(平成23年) 東京工業大学大学院理工学研究科物性物理学専攻 博士課程修了(指導教官 斎藤晋 教授)
2011年(平成23年) 日本学術振興会 特別研究員(PD)
2012年(平成24年) みずほ情報総研株式会社 入社
2020年(令和2年) 同上退社
2020年(令和2年) 九州大学大学院工学研究院 准教授(現職)
Research Fields
マテリアルズインフォマティクス、計算化学
Awards
2009年(平成21年) フラーレン・ナノチューブ・グラフェン学会 若手奨励賞
2011年(平成23年) フラーレン・ナノチューブ・グラフェン学会 飯島奨励賞
2012年(平成27年) 応用物理学会 講演奨励賞
2021年(令和3年) 第43回応用物理学会優秀論文賞
2024年(令和5年) CBI学会 若手奨励賞
Publication list
Y.K. Phua, N. Terasoba, M. Tanaka, T. Fujigaya, K. Kato, "Unsupervised Machine Learning-Derived Anion-Exchange Membrane Polymers Map: a Guideline for Polymers Exploration and Design", ChemElectroChem, 10.1002/celc.202400252 (2024)
Y. Niidome, H. Matsumoto, R. Hamano, K. Kato, T. Fujigaya, T. Shiraki, "Polymer Wrapping State Changes at Defect Sites of Locally Functionalized Single-Walled Carbon Nanotubes", J. Phys. Chem. C 128, 12, 5146–5155 (2024)
T. Miyano, Y. Ayukawa, T. Anada, I. Takahashi, H. Furuhashi, S. Tokunaga, A. Hirata, N. Nakashima, K. Kato, H. Fukuda “Association Between Reduced Posterior Occlusal Contact and Alzheimer’s Disease Onset in Older Japanese Adults: Results from the LIFE Study”, Journal of Alzheimer's Disease, 97, 871-881 (2024).
Y. K. Phua, K. Kato, T. Fujigaya, “Predicting the anion conductivities and alkaline stabilities of anion conducting membrane polymeric materials: development of explainable machine learning models”, STAM 24, 2261833 (2023).
N. Tanaka, A. Hamasuna, I. Yamaguchi, K. Kato, T. Fujigaya, “Pyridine-mediated B–B bond cleavage of tetrahydroxydiboron to synthesize n-doped SWCNTs with long-term air stability”, Scientific Reports 13, 21926 (2023).
R. Kanada, A. Tokuhisa, Y. Nagasaka, S. Okuno, K. Amemiya, S. Chiba, G.-J. Bekker, N. Kamiya, K. Kato, Y. Okuno “Enhanced Coarse-Grained Molecular Dynamics Simulation with a Smoothed Hybrid Potential Using a Neural Network Model”, Journal of Chemical Theory and Computation, 20, 7-17 (2023).
K. Kato*, A. Yamamoto, C. Watanabe, K. Fukuzawa “Application of Model Core Potentials to Zn-and Mg-containing Metalloproteins in the Fragment Molecular Orbital Method”, Chem-Bio Informatics Journal, 23, 14-25 (2023).
福澤 薫, 渡邉 千鶴, 加藤 幸一郎「フラグメント分子軌道計算による構造解析」日本結晶学会誌 2023 年 65 巻 1 号 p. 17-25
本間光貴,福澤 薫,加藤幸一郎「AIとFMO法を融合した医薬品設計と分子間相互作用解析」実験医学増刊 Vol.42 No.2「あなたのラボから薬を生み出す アカデミア創薬の実践 All JAPAN体制の先端技術支援を利用した創薬の最前線」善光龍哉,辻川和丈/編 2024年01月19日発行 羊土社
B. Yu, S. Naka, H. Aoki, K. Kato, D. Yamashita, S. Fujii, Y. Kato, T. Fujigaya, T. Shiraki, “ortho-Substituted Aryldiazonium Design for the Defect Configuration-Controlled Photoluminescent Functionalization of Chiral Single-Walled Carbon Nanotubes”, ACS. Nano 16, 21452-21461 (2022).
T. Miyano, R. Kaneko, T. Kimura, M. Maruoka, A. Kishimura, K. Kato, M. Furuta, Y. Yamashita “Dietary Problems Are Associated with Frailty Status in Older People with Fewer Teeth in Japan”, International Journal of Environmental Research and Public Health, 19 (23), 16260 (2022).
K. Fukuzawa, K. Kato, C. Watanabe, Y. Kawashima, Y. Handa, A. Yamamoto, K. Watanabe, T. Ohyama, K. Kamisaka, D. Takaya, T. Honma, "Special Features of COVID-19 in the FMODB: Fragment Molecular Orbital Calculations and Interaction Energy Analysis of SARS-CoV-2-Related Proteins", J. Chem. Inf. Model. 2021, 61, 9, 4594–4612.
K. Koiwai, K. Inaba, K. Morohashi, S. Enya, R. Arai, H. Kojima, T. Okabe, Y. Fujikawa, H. Inoue, R. Yoshino, T. Hirokawa, K. Kato, K. Fukuzawa, Y. Shimada-Niwa, A. Nakamura, F. Yumoto, T. Senda, R. Niwa, "An integrated approach to unravel a crucial structural property required for the function of the insect steroidogenic Halloween protein Noppera-bo", JBC. 2020, 295, 7154-7167.
K. Kato, Y. Maekawa, N. Watanabe, K. Sasaoka, T. Yamamoto, "Discovery of new microscopic structures in surface water on graphene using data science", Jpn. J. Appl. Phys. 2020, 59, 025001.
Y. Akinaga, K. Kato, T. Nakano, K. Fukuzawa, Y. Mochizuki, "Fragmentation at sp2 carbon atoms in fragment molecular orbital method", J. Comput. Chem. 2020, 41, 1416.
K. Kato, T. Masuda, C. Watanabe, N. Miyagawa, H. Mizouchi, S. Nagase, K. Kamisaka, K. Oshima, S. Ono, H. Ueda, A. Tokuhisa, R. Kanada, M. Ohta, M. Ikeguchi, Y. Okuno, K. Fukuzawa, T. Honma, "High-Precision Atomic Charge Prediction for Protein Systems Using Fragment Molecular Orbital Calculation and Machine Learning", J. Chem. Inf. Model. 2020, 60, 3361.
K. Kato, T. Honma, K. Fukuzawa, "Intermolecular interaction among Remdesivir, RNA and RNA-dependent RNA polymerase of SARS-CoV-2 analyzed by fragment molecular orbital calculation", J. Mol. Graph. Model. 2020, 100, 107695.
畑田崚、加藤幸一郎、奥脇弘次、福澤薫、望月祐志「カルサイト・ハイドロキシアパタイト結晶表面とペプチドのFMO相互作用解析」Journal of Computer Chemistry, Japan. 2019, 19, 1.
望月祐志、秋永宜伸、坂倉耕太、渡邊啓正、加藤幸一郎、渡辺尚貴、奥脇弘次、中野達也、福澤薫「ABINIT-MP Openシリーズの最新の開発状況について」 Journal of Computer Chemistry, Japan. 2019, 18, 129.
K. Kato, K. Fukuzawa, Y. Mochizuki, "Interaction between calcite and adsorptive peptide analyzed by fragment molecular orbital method", Jpn. J. Appl. Phys. 2019, 58, 120906.
K. Kato, "Modeling of nano-bio interfaces based on atomic scale simulations", 2017 6th International Conference on Informatics, Electronics and Vision & 2017 7th International Symposium in Computational Medical and Health Technology (ICIEV-ISCMHT)
M. Machida, K. Kato, M. Shiga, "Nuclear quantum effects of light and heavy water studied by all-electron first principles path integral simulations", J. Chem. Phys. 2018, 148, 102324.
加藤幸一郎、谷村直樹「材料開発の新潮流: マテリアルズインフォマティクス (材料科学からのイノベーション)」5, 2018, 1 ed. 4 p. (みずほ情報総研技報 = Technical report of Mizuho Information & Research Institute, Inc)
谷村直樹、加藤幸一郎「材料設計における原子・分子スケールシミュレーションの利用動向 (材料科学からのイノベーション)」5, 2018, 1 ed. 6 p. (みずほ情報総研技報 = Technical report of Mizuho Information & Research Institute, Inc)
望月祐志, 福澤薫, 田中成典, 坂倉耕太, 秋永宜伸, 加藤幸一郎, 渡邊啓正, 沖山佳生, 中野達也, 古明地勇人、奥沢明「FMOプログラムABINIT-MPの開発状況と機械学習との連携」 Journal of Computer Chemistry, Japan. 2017, 16, 119.
谷村直樹、加藤幸一郎「材料設計分野におけるシミュレーション解析の利用動向」2, 2017, 2 ed. 7 p. (ファインケミカル : 調査・資料・報道・抄録)
谷村直樹、加藤幸一郎、渡辺尚貴「材料物性解析システム (特集 多様化するニーズに貢献するシミュレーション技術)」9 2016, 1 ed. 4 p. (みずほ情報総研技報 = Technical report of Mizuho Information & Research Institute, Inc)
加藤幸一郎、福澤薫、望月祐志「生体親和材料とその表面を特異的に認識するペプチドの相互作用解析 (特集 多様化するニーズに貢献するシミュレーション技術)」9 2016, 1 ed. 4 p. (みずほ情報総研技報 = Technical report of Mizuho Information & Research Institute, Inc)
塚本貴志, 加藤幸一郎, 加藤昭史, 中野達也, 望月祐志、福澤薫「Implementation of Pair Interaction Energy DecompositionAnalysis and Its Applications to Protein-Ligand Systems」 Journal of Computer Chemistry, Japan. 2015, 14, 1.
K. Kato, K. Fukuzawa, Y. Mochizuki, "Modeling of hydroxyapatite-peptide interaction based on fragment molecular orbital method", Chem. Phys. Lett. 2015, 629, 58.
塚本貴志、加藤幸一郎、加藤昭史「バイオ分子相互作用シミュレータMIZUHO/BioStation 3.0: 相互作用エネルギーの詳細解析機能PIEDAの導入」3 2014, 1 ed. 7 p. (みずほ情報総研技報 = Technical report of Mizuho Information & Research Institute, Inc)
加藤幸一郎、塚本貴志、谷村直樹「基板上グラフェンの構造・電子状態・伝導特性の第一原理計算」3 2014, 1 ed. 5 p. (みずほ情報総研技報 = Technical report of Mizuho Information & Research Institute, Inc)
K. Kato, T. Koretsune, S. Saito, "Energetics and electronic properties of twisted single-walled carbon nanotubes", Condens. Matter. Phys. 2012, 85, 115448.
K. Kato, S. Saito, "Geometries, electronic structures and energetics of small-diameter single-walled carbon nanotubes", Physica E. 2011, 43, 669.
K. Kato, T. Koretsune, S. Saito, "Twisting effects on carbon nanotubes: A first-principles study with helical symmetry operations", J. Phys. Conf. Ser. 2011, 302, 012007.
K. Kato, S. Saito, "Systematic study of work functions of single-walled carbon nanotubes", Nanotubes and Related Nanostructures - 2009. p. 245-249 5 p. (Materials Research Society Symposium Proceedings; vol. 1204).
Y. Tanaka, Y. Hirana, Y. Niidome, K. Kato, S. Saito, N. Nakashima, "Experimentally determined redox potentials of individual (n,m) single-walled carbon nanotubes", Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 7655.