疾病的發生是否與生物時鐘的功能失調有關？茲舉數例，略作闡明：

（一）老化的發生，不論是自然的過程或是外在因素的促進，皆推測與生物體內部自由基及自由基清除者（例如很多抗氧化物）之間的平衡有關，已有研究報告顯示：生物體內的抗氧化物（如SOD ，Catalase）其活性功能是受到生物時鐘的調節，因此，若生物時鐘的功能失調，就會直接或間接打破生物體內自由基的平衡，而造成老化。

（二）季節性引起的情緒低落（憂鬱），常發生在居住於高緯度地區的人們（因冬天日照不足），也就是在這個季節裡，光線這個時間賦予者在這個地區的強度（或長度）不足所致，因此，照光療法（讓生物時鐘得到足夠的暗示，適時發揮其調控功能）遂為現代精神醫學所接受且認為是有效的生理療法。

（三）癌症的發生，其成因雖多，且因種類而異，然皆引起細胞分裂週期的不正常現象，許多研究報告也已證實：正常細胞的分裂週期為生物時鐘所調控，所以，當其調控受到外在因子（如毒素等致癌因子）的干擾而導致失靈的話，癌症就可能發生。

（四）時差問題，由於科學之昌明，工商的發達，朝處台北、夜宿巴黎的情形已司空見慣，但是其造成生理上的衝擊（生物時鐘因產生相位位移，而需重新調整與當地的時間賦予者趨於同步）是值得審慎留意的。

因此，奉勸諸君，如果想要維持健康、長壽，請依循大自然的生活節奏：日出而作、日落而息，如您一定要作空中飛人長途旅行的話，褪黑激素（Melatonin ）雖證實可調整動物的生物時鐘，但人體的服用方式及成效目前仍有疑慮，可多吃些富含抗氧化物的天然蔬果、食品，亦不彷好好考慮亞秀夫教授的建議：向自然界的侯鳥學習，只選擇南北向的航程（無時差）飛行。