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黃貞祥 教授
課程內容：
課程內容：
在本次課程中，介紹了幾種常見的鴨類品種，由學名可知，下列三種鴨屬於不同種，並且土番鴨為北京鴨與番鴨的混種，不具生殖能力，也證明北京鴨與番鴨為不同種生物，本次課程透過分析三種鴨類DNA，使用三種鴨共同具備的性狀基因，分析三種鴨的親緣關係。
台灣常見肉鴨簡介
台灣常見肉鴨簡介
北京鴨 Anas platyrhynchos domesticus
北京鴨 Anas platyrhynchos domesticus
Pekin duck
原產於華北地區，由農復會引進入台，引進美國後選育誠純白色羽毛。
好吃
番鴨 Cairina moschata
番鴨 Cairina moschata
Muscovy duck
原產自南美祕魯，面部有紅色肉疣，腳脛及蹼為黑色。薑母鴨材料。
很好吃
土番鴨 Cairina Anac
土番鴨 Cairina Anac
Mule duck
公正番鴨與褐色母菜鴨或改鴨之雜交體，因此不具生殖能力
肉質比北京鴨多、脂肪比北京鴨低
更好吃了
PCR聚合酶連鎖反應(擴增DNA樣本)
PCR聚合酶連鎖反應(擴增DNA樣本)
實驗材料:DNA(含需擴增DNA片段) DAN引子(22-28bp) DNA聚合酶(耐熱型) dNTP PCRTube Mix Buffer
(以實驗A為例)
混和加入電泳槽中的材料
混和加入電泳槽中的材料
2X Powerpol MasterMix: 150μl
madtermix 含有Mg2+ 可改變酵素活性；以及buffer 維持穩定(內含Tris維持酸鹼穩定)
ddH2O :300μl
避免PCR時餐入雜質
Duck DNA : Pekin,Mule,Muscivery 5μl each
1.5ml Eddendorf 2 個
八聯PCR管1個
引子:
5μl CHD primer (Foward)
5μl CHD primer (Reverse)
5μl CAUD006 primer (Foward)
5μl CAUD006 primer (Reverse)
▲ 加入Forward/Reverse primer 以完全複製DNA的兩條鍊
實驗步驟:(1)混和上述材料至PCRTube
(2)將Tube放入Thermal cycler (95-55-72度)
(3)重複(2)約25-40次
◀Thermal cycler反覆升降溫
(1)分離DNA雙股(94-97)
(2)連接引子(54)
(3)聚合酶反應(72)
DNA電泳(比較鴨子親緣關係)
DNA電泳(比較鴨子親緣關係)
實驗原理:運用電泳槽的電位差將不同長度的DNA分離開(長的跑得慢 短的跑得快)，再將跑好的電泳凝膠拿去照UV照相，方便觀察。
實驗步驟:(1)製作凝膠
(兩塊)
Agarose E 0.6g
TAE 40 ml
DNA safe stains
上面三種材料混和後微波至沸騰，倒入模具，靜置至凝固後取出。
(2)將凝膠放入電泳槽
(3)將buffer(緩衝液)倒入電泳槽並覆蓋凝膠
(4)插電(近DNA的地方為負電)
(5)將跑好的電泳凝膠拿去照UV照相
(以實驗A為例)
各物質的凝膠放置位置
各物質的凝膠放置位置
◀
照UV後的DNA跑膠情況
照UV後的DNA跑膠情況
由左至右數，前三行分別為Pekin duck,Muscovy duck,Mule duck的性染色體，有兩橫條的北京鴨與土番鴨性染色體，分別代表Z,W染色體，為雌性，而番鴨的性染色體，只有Z染色體，為雄性。
實驗心得
本次實驗透過DNA電泳分析樣本鴨DNA，得到性別與親緣關係等資訊，實驗過程中，主要與道的問題是最後的UV攝影畫面中，有DNA未顯示出來，有可能的原因有兩種，一種是注入DNA時用力過猛，刺破凝膠，導致DNA跑出凝膠，導致DNA在UV攝影照片中沒有顯示，二有可能是忘記加入DNA。
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