Embedded Files
Lecture 09: Analysis of Biological Networks
This lecture will include a short but concise introduction to the concept of biological networks. Starting from a presentation of the various types of biological networks, we will then go on to discuss the mathematical properties of graphs. After an overview of the quantitative characteristics of networks in general, we will focus our discussion in the differences between random and scale-free networks and show how most of the biological networks fall in the latter category.
Περίληψη
Το μάθημα αυτό ενσωματώνει στοιχεία από τα δύο αμέσως προηγούμενα και επικεντρώνεται στη μελέτη των βιολογικών δικτύων. Μετά από μια εισαγωγή των βασικών βιολογικών εννοιών που περιλαμβάνουν τα είδη των δικτύων (ρυθμιστικά, μεταβολικά κ.ά.) περνάει στο πραγματικό βιολογικό πρόβλημα που αφορά την εξαγωγή ενός δικτύου ρυθμιστικών αλληλεπιδράσεων πρωτεϊνών από δεδομένα γονιδιακής έκφρασης. Στο πλαίσιο της συζήτησης του προβλήματος θα εισαχθούν βασικές έννοιες από τη θεωρία δικτύων (τοπολογία, βαθμός, μέγεθος δικτύου κλπ) και στη συνέχεια θα αναλυθούν οι στατιστικές ιδιότητες των βιολογικών δικτύων με έμφαση στις δομές αυτο-οργάνωσης, τα ανεξάρτητα κλίμακας (scale-free) δίκτυα και τους νόμους δύναμης. Οι πρακτικές ασκήσεις θα περιλαμβάνουν την εξαγωγή δικτύων και την ανάλυση των στατιστικών τους ιδιοτήτων.
Στο τέλος του μαθήματος θα πρέπει να μπορείτε να:
- Να περιγράψετε βασικά είδη βιολογικών δικτύων.
- Να αναγνωρίσετε τα κυριότερα μοτίβα δικτύων και τις ιδιότητές τους.
- Να αναλύσετε ποσοτικά τα βασικότερα χαρακτηριστικά γράφων/δικτύων.
- Να διακρίνετε μεταξύ τυχαίων δικτύων και δικτύων ανεξάρτητων κλίμακας.
Διαβάστε το αντίστοιχο Κεφάλαιο
09. Μελέτη και Ανάλυση Βιολογικών Δικτύων
Και δείτε την αντίστοιχη Διάλεξη
09. Μελέτη και Ανάλυση Βιολογικών Δικτύων
Δείτε τα σχετικά βίντεο
Google Sites
Report abuse