Embedded Files
Lecture 00: Introduction to Computational Biology.
In this first lecture we will be discussing some basic notions regarding what Computational Biology is. We will set out the goals of this course and give some brief but intriguing previous of the biological problems we will be discussing during the semester. Finally we will provide the outline of both the methodological tools to be used throughout the course and the final goal which is to understand how computational methods may be used to integrate data and provide the framework for the acquisition of new knowledge.
Περίληψη
Στην πρώτη αυτή διάλεξη θα γίνει μια εισαγωγή στο χώρο της Υπολογιστικής Βιολογίας-Βιοπληροφορικής, με σκοπό να συζητηθούν οι βασικές της έννοιες αλλά κυρίως να αναδειχθούν το είδος και το εύρος των επιστημονικών προβλημάτων, για την επίλυση των οποίων χρησιμοποιούμε υπολογιστικές προσεγγίσεις. Ως διεπιστημονικό γνωστικό αντικείμενο, η Υπολογιστική Βιολογία είναι δύσκολο να οριστεί και ως εκ τούτου στο πλαίσιο αυτής της εισαγωγής θα την παρουσιάσουμε περισσότερο στο πλαίσιο των ερωτημάτων τα οποία αποπειράται να απαντήσει. Αφού γίνει μία σύντομη αναφορά στις βάσεις βιολογικών δεδομένων, θα συζητηθούν πιο αναλυτικά οι ολοένα αυξανόμενες ανάγκες για αποτελεσματική διαχείριση του όγκου και της πολυπλοκότητας των βιολογικών δεδομένων στην εποχή της επιστήμης μεγάλου όγκου δεδομένων (big data science). Στη συνέχεια, θα επικεντρωθούμε στην παράθεση μερικών από τα πιο σημαντικά βιολογικά προβλήματα, που καθιστούν απαραίτητη τη χρήση υπολογιστικών μεθοδολογιών, με έμφαση σε αυτά που σχετίζονται με την ανάλυση βιολογικών αλληλουχιών και λειτουργικών τους ιδιοτήτων. Τέλος, θα γίνει μια εισαγωγική αναφορά στις βασικές έννοιες μαθηματικών και στατιστικής που είναι απαραίτητες για την ποσοτικοποιημένη έκφραση των βιολογικών προβλημάτων και τέλος θα παρουσιαστούν συνοπτικά τα βασικότερα είδη υπολογιστικών αλγορίθμων που θα συζητηθούν σε επόμενα μαθήματα.
Στο τέλος του μαθήματος θα πρέπει να μπορείτε να:
- Να κατονομάσετε τις κυριότερες βάσεις βιολογικών δεδομένων και το είδος των δεδομένων που περιέχουν.
- Να γνωρίζετε τι είναι οι διεργασίες υψηλής-απόδοσης σε βιολογικά συστήματα και τι δεδομένα παράγουν.
- Να διατυπώσετε έναν απλό ορισμό για την έννοια του αλγορίθμου.
- Να διακρίνετε μεταξύ των διαφόρων ειδών αλγορίθμων.
Διαβάστε το αντίστοιχο Κεφάλαιο
00. Εισαγωγή στην Υπολογιστική Βιολογία
Και κατεβάστε τις διαφάνειες της διάλεξης
Google Sites
Report abuse