Publications
DBLP Bibliography index and coauthors
Patents
US 9430829 B2, Anant Madabhushi, Haibo Wang, Angel Cruz-Roa, Fabio Gonzalez. Automatic Detection Of Mitosis Using Handcrafted And Convolutional Neural Network Features [Google Patents] [USPTO] [Espacenet]
US 10049450 B2, Anant Madabhushi, Angel Alfonso Cruz-Roa, Fabio Gonzalez. High-throughput adaptive sampling for whole-slide histopathology image analysis [Google Patents] [USPTO] [Espacenet]
Journals
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Angélica V. Yantén, Angel Cruz-Roa, Francisco A. Sánchez. Traffic noise affects foraging behavior and echolocation in the Lesser Bulldog Bat, Noctilio albiventris (Chiroptera: Noctilionidae), Behavioural Processes, Volume 203, 2022, 104775, ISSN 0376-6357, https://doi.org/10.1016/j.beproc.2022.104775. [Publindex A1][SJR Q1][url][pdf]
Díaz-Celis, Cesar Augusto; Gutiérrez-Lesmes, Oscar; Cruz-Roa, Angel. Plataforma TI de vigilancia entomológica del Aedes aegypti con colaboración colectiva, Web GIS y mHealth.En: Entramado. Julio - Diciembre, 2022 vol. 18, no. 2, 1-19 e-8639 https://doi.org/10.18041/1900-3803/entramado.2.8639 (ISSN 1900-3803 / e-ISSN 2539-0279) [Publindex B][pdf]
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Ladino Martínez, L. ., Gutiérrez Lesmes, O. ., & Cruz Roa, Ángel A. . (2021). Un modelo matemático para el estudio y análisis de la dinámica de la COVID-19 en Colombia. Orinoquia, 25(1), 65–76. ISSN en Línea: 2011-2629, ISSN Impreso: 0121-3709 https://doi.org/10.22579/20112629.687 [pdf]
Angel Cruz-Roa, Hannah Gilmore, Ajay Basavanhally, Michael Feldman, Shridar Ganesan, Natalie Shih, John Tomaszewski, Anant Madabhushi, Fabio A. Gonz\'alez. High-throughput adaptive sampling for whole-slide histopathology image analysis (HASHI) via convolutional neural networks: Application to invasive breast cancer detection. PLoS ONE 13(5): e0196828. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0196828. 2018. ISSN:1932-6203 [Publindex A1][SJR Q1][url]
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Mitko Veta, Paul J. van Diest, Stefan M. Willems, Haibo Wang, Anant Madabhushi, Angel Cruz-Roa, Fabio Gonzalez, Anders B. L. Larsen, Jacob S. Vestergaard, Anders B. Dahl, Dan C. Cireșan, Jürgen Schmidhuber, Alessandro Giusti, Luca M. Gambardella, F. Boray Tek, Thomas Walter, Ching-Wei Wang, Satoshi Kondo, Bogdan J. Matuszewski, Frederic Precioso, Violet Snell, Josef Kittler, Teofilo E. de Campos, Adnan M. Khan, Nasir M. Rajpoot, Evdokia Arkoumani, Miangela M. Lacle, Max A. Viergever, Josien P.W. Pluim. Assessment of algorithms for mitosis detection in breast cancer histopathology images. Journal of Medical Image Analysis. Volume 20, Issue 1, Pages 237–248. 2015. ISSN:1361-8415. doi: 10.1016/j.media.2014.11.010 [url][arxiv][pdf] (Publindex A1)
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Peer Reviewed International Conferences
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Leonard Toro-Quitian, Juan Camilo Torres, Andrés Felipe Carrera-Pinzón, Ricardo Enrique Gutiérrez, Marcela Iregui Guerrero, Angel Cruz-Roa, Eduardo Romero. Automatic estimation of the ejection fraction in echocardiogram images by an adapted end-to-end U-Net neural network. 19th International Symposium on Medical Information Processing and Analysis (SIPAIM 2023). Fundación SIPAIM, Universidad Panamericana. Ciudad de México, México. 2023 [pdf][url]
Andrés Carrera-Pinzón, Leonard Toro-Quitian, Marcela Iregui-Guerrero, Angel Cruz-Roa, Ricardo Gutiérrez-Carvajal, Eduardo Romero, "Correlation of intraventricular blood patterns with the Ejection Fraction in ultrasound images," 2023 19th International Symposium on Medical Information Processing and Analysis (SIPAIM), Mexico City, Mexico, 2023, pp. 1-4, doi: 10.1109/SIPAIM56729.2023.10373543. [pdf][url]
Mauricio Caviedes, Fabian Cano, David Becerra, Angel Cruz-Roa, Eduardo Romero. An automatic classification of metaplasia in gastric histopathology images. 19th International Symposium on Medical Information Processing and Analysis (SIPAIM 2023). Fundación SIPAIM, Universidad Panamericana. Ciudad de México, México. 2023 [pdf][url]
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Fabian Cano, Charlems Alvarez Jimenez, Eduardo Romero, Angel Cruz-Roa. Ensemble of unsupervised learned image representations based on variational autoencoders for lung adenocarcinoma subtypes. The International Symposium of Biomedical Imaging, IEEE – ISBI 2023. 18 - 21 April 2023. Cartagena (Colombia). 2023
José Alejandro Torres Olarte, Andrés Fernando Jiménez, Angel Alfonso Cruz Roa. Agent-based simulation software platform for optimizing the distribution of water resources in the irrigation of agricultural crops based on geographic and environmental information. The 10th International Conference in Software Engineering Research and Innovation - CONISOFT 2022. IEEE Computer Society, IEEE, REDMIS, CONCYTEP, Universidad Tecnológica Bilingüe Internacional y Sustentable de Puebla. Puebla (México). 24-28 Octubre (2022). [URL]
Jonatan Quintero Gamez, Cesar Augusto Diaz Celis, Angel Alfonso Cruz Roa. Plataforma 3D WebGIS para la visualización de edificaciones y navegación del campus Barcelona de la Universidad de los Llanos. IV Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2022. Universidad de los Llanos, Villavicencio (Colombia). 19-21 Octubre (2022).
Jose Alejandro Olarte Torres, Andrés-F Jiménez López, Angel Alfonso Cruz Roa. Plataforma para la simulación de distribución del riego agrícola a múltiples campos con la misma fuente hídrica, basado en un Modelo de Difusión Sociológica. IV Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2022. Universidad de los Llanos, Villavicencio (Colombia). 19-21 Octubre (2022).
Libardo José Murillo Tovar, Brenda Enith Velasquez Mayorga, Jorge Alberto Jiménez Montoya, Angel Alfonso Cruz Roa. Aplicación Web para el diseño y gestión de rutas metabólicas: caso de uso glucólisis. IV Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2022. Universidad de los Llanos, Villavicencio (Colombia). 19-21 Octubre (2022).
Andrés Fernando Jiménez López, Nelson Baquero Álvarez, Angel Alfonso Cruz Roa, Fernando Quimbay Velasquez, Fabian Rolando Jiménez López. Sistema de adquisición de Ronchigramas para la medición de características de Componentes Ópticos. IV Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2022. Universidad de los Llanos, Villavicencio (Colombia). 19-21 Octubre (2022).
David Esteban Villalba Hernández, José Ariel Rodríguez Pulido, Angel Alfonso Cruz Roa. Caracterización morfométrica de ovocitos por estadio de maduración ovárica del híbrido Pseudoplatystoma metae x Leiarius maumarux a partir de patología digital. IV Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2022. Universidad de los Llanos, Villavicencio (Colombia). 19-21 Octubre (2022).
Jennifer Salguero L., Prateek Prasanna, Germán Corredor, Angel Cruz-Roa, David Becerra, and Eduardo Romero "Selecting training samples for ovarian cancer classification via a semi-supervised clustering approach", Proc. SPIE 12039, Medical Imaging 2022: Digital and Computational Pathology, 1203906 (4 April 2022); https://doi.org/10.1117/12.2612984
Fabian Cano, Charlens Alvarez-Jimenez, David Becerra, Andres Siabatto, Angel Cruz-Roa, and Eduardo Romero "A supervised subtype differentiation learning for building invariant features of non-small cell lung cancer in a latent space of a Variational Autoencoder", Proc. SPIE 12088, 17th International Symposium on Medical Information Processing and Analysis, 120880Y (10 December 2021); https://doi.org/10.1117/12.2606255
Mauricio Caviedes, Charlems Alvarez, Eduardo Romero, Angel Cruz-Roa. Método Computacional de Inteligencia Artificial de Aprendizaje Automático basado en Redes Neuronales Convolucionales para la clasificación del grado de riesgo de lesiones de cáncer de próstata a partir de imágenes multimodales de resonancia magnética multiparamétrica. XVII Encuentro Regional de la RedCOLSI Nodo Orinoquia “Retos de la investigación formativa para la transformación productiva y social de la Orinoquia”. 1-5 de Septiembre (2020). [póster]
Lilia Ladino-Martínez, Oscar Gutiérrez-Lesmes, Angel Cruz-Roa. Modelo matemático de la dinámica del Covid-19: Un estudio de caso en Villavicencio, Colombia. III Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2020. Villavicencio (Colombia). 11-13 Agosto (2020). ISSN: 2744-9599 (En línea). [pdf]
Mauricio Caviedes-Rojas, Charlems Alvarez-Jimenez, Eduardo Romero, Angel Cruz-Roa. Comparación de CNN para clasificación de grado de riesgo de lesiones de próstata a partir de imágenes de mpMRI. III Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2020. Villavicencio (Colombia). 11-13 Agosto (2020). ISSN: 2744-9599 (En línea). [pdf]
Angie Torres, Jesús Camacho, Jorge Torres, Angel Cruz-Roa. Análisis preliminar de detección de patologías en cultivos de palma aceitera usando Redes Neuronales Convolucionales. III Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2020. Villavicencio (Colombia). 11-13 Agosto (2020). ISSN: 2744-9599 (En línea). [pdf]
Fabian Cano and Angel Cruz-Roa "An exploratory study of one-shot learning using Siamese convolutional neural network for histopathology image classification in breast cancer from few data examples", Proc. SPIE 11330, 15th International Symposium on Medical Information Processing and Analysis. Medellín, Colombia. 6-8 Nov 2019, 113300A (3 January 2020); https://doi.org/10.1117/12.2546488 [url]
Mauricio Caviedes, Charlems Alvarez, Eduardo Romero, Angel Cruz-Roa. A preliminary analysis of convolutional neural networks approach for cancerous tissue classification in MRI prostate lesions. 15th International Symposium on Medical Information Processing and Analysis. Medellín, Colombia. 6-8 Nov 2019. (Poster)
Cristian González-Alba, Laura Cespedes-Bastos, Angel Cruz-Roa, Cesar Díaz. "Geographic Information System on the Web for recording georeferenced information transport system at the Universidad de los Llanos". The 7th International Conference in Software Engineering Research and Innovation - CONISOFT 2019. Facultad de Ingeniería, UNAM, CDMX (Mexico). 23 - 25 Oct 2019. pp. 164-172, doi: 10.1109/CONISOFT.2019.00032 [url]
Fabian Cano, Anant Madabhushi, Angel Cruz-Roa. A comparative analysis of sensitivity of convolutional neural networks for histopathology image classification in breast cancer. Proceedings Volume 10975, 14th International Symposium on Medical Information Processing and Analysis. Mazatlán, Mexico. 24-26 October 2018. 109750W (2018). https://doi.org/10.1117/12.2511647 [url]
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Fabian Cano and Angel Cruz-Roa. Entrenamiento de una Red Neuronal Convolucional con Jupyter y TensorFlow para la clasificación de tejido invasivo de cáncer de seno. II Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2018. Villavicencio (Colombia). 15-17 Agosto (2018). ISBN: 978-958-8927-45-9 [pdf]
Daniel Muñoz, Angel Cruz-Roa and Cesar Díaz. Aplicación Móvil de Colaboración Abierta Distribuida (Crowdsourcing) como Apoyo a la Vigilancia Entomológica de Aedes Aegypti. II Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2018. Villavicencio (Colombia). 15-17 Agosto (2018). ISBN: 978-958-8927-45-9 [pdf]
Jorge Goyeneche, Angel Cruz-Roa and Cesar Diaz. Sistema de Información Geográfica en la Web (WEBGIS) para el Apoyo a la Vigilancia Entomológica de Aedes Aegypti. II Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2018. Villavicencio (Colombia). 15-17 Agosto (2018). ISBN: 978-958-8927-45-9 [pdf]
Angie Torres-Galindo and Angel Cruz-Roa. Métodos de Aprendizaje de maquina utilizados en la clasificación y detección de características de imagen en plantas. II Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2018. Villavicencio (Colombia). 15-17 Agosto (2018). ISBN: 978-958-8927-45-9 [pdf]
Michael Colorado-Diaz, José Ariel Rodríguez-Pulido, Angel Cruz-Roa. Automatic detection of spermatocytes from histology digital images of hybrid fish for sexual maduration quantification. 11th International Symposium on Reproductive Physiology of Fish. Manaus, Brazil, 3-8 June 2018. [abstract][poster]
Yerson Porras, Roger Calderon, Angel Cruz-Roa. Computational Performance Analysis of Distributed Processing of a Bag of Words Implementation in Apache Spark. IEEE COLOMBIAN CONFERENCE ON COMMUNICATIONS AND COMPUTING (COLCOM 2018). Medellín, Colombia, on May 16th to 18th, 2018.doi:10.1109/ColComCon.2018.8466725 [slides][pdf][url]
Daniel Zapata, Angel Cruz-Roa, Andrés Jimenez. Automatic Classification of Optical Defects of Mirrors from Ronchigram Images using Bag of Visual Words and Support Vector Machines. (2018) Automatic Classification of Optical Defects of Mirrors from Ronchigram Images Using Bag of Visual Words and Support Vector Machines. In: Mendoza M., Velastín S. (eds) Progress in Pattern Recognition, Image Analysis, Computer Vision, and Applications. CIARP 2017. Lecture Notes in Computer Science, vol 10657. Springer, Cham. 22nd Iberoamerican Congress on Pattern Recognition. CIARP 2017. 7-10 November 2017, Valparaíso, Chile. ISBN: 978-3-319-75192-4. ISSN: 0302-9743. doi: https://doi.org/10.1007/978-3-319-75193-1_86 [url][pdf][poster]
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Arnol Suarez, Andrés Jiménez, Mauricio Castro Franco, Angel Cruz-Roa, Clasificación automática de cobertura y uso de suelo en imágenes de teledetección de parques nacionales naturales a partir de redes neuronales convolucionales. Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2016. Villavicencio (Colombia). 19-21 Octubre (2016). ISBN: 978-958-8927-23-7 [pdf]
Edwin Sandoval, Miguel Daza Salamanca, Smith Parrado, Angel Cruz-Roa, Aplicación de Métodos Numéricos en un Juego: Tiro Al Panda Con Cañon. Congreso Internacional de Ciencias Básicas e Ingeniería - CICI 2016. Villavicencio (Colombia). 19-21 Octubre (2016). ISBN: 978-958-8927-23-7 [poster]
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Sebastian Otálora, Angel Cruz-Roa, John Arevalo, Manfredo Atzori, Anant Madabhushi, Alexander R. Judkins, Fabio González, Henning Müller and Adrien Depeursinge .Combining Unsupervised Feature Learning and Riesz Wavelets for Histopathology Image Representation: Application to Identifying Anaplastic Medulloblastoma. MICCAI 2015, the 18th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention. Munich (Germany), October 5-9 2015. ISBN: 978-3-319-24552-2. ISSN: 0302-9743. DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-319-24553-9_71[url][pdf]
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Germán Sosa, Angel Cruz-Roa, Fabio González. Automatic detection of Wheezes by evaluation of multiple acoustic feature extraction methods and C-weighted SVM. Proc. SPIE 9287, Tenth International Symposium on Medical Information Processing and Analysis (SIPAIM 2014), Cartagena, Colombia. October 14-16, 2014. 928709 (January 28, 2015); ISSN 0277-786X. doi:10.1117/12.2073614 [pdf][url][slides]
Angel Cruz-Roa, Ajay Basavanhally, Fabio Gonzalez, Hannah Gilmore, Michael Feldman, Shridar Ganesan, Natalie Shih, John Tomaszewski and Anant Madabhushi. Automatic detection of invasive ductal carcinoma in whole slide images with Convolutional Neural Networks. Digital Pathology Conference. SPIE Medical Imaging 2014, 15 - 20 February 2014. Town & Country Resort and Convention Center, San Diego, California, USA. doi:10.1117/12.2043872 [url]
Haibo Wang, Angel Cruz-Roa, Ajay Basavanhally, Hannah Gilmore, Natalie Shih, Mike Feldman, John Tomaszewski, Fabio Gonzalez, and Anant Madabhushi. Cascaded Ensemble of Convolutional Neural Networks and Handcrafted Features for Mitosis Detection. Digital Pathology Conference. SPIE Medical Imaging 2014, 15 - 20 February 2014. Town & Country Resort and Convention Center, San Diego, California, USA. doi:10.1117/12.2043902 [url]
John Arevalo, Angel Cruz-Roa and Fabio A. González. Hybrid image representation learning model with invariant features for basal cell carcinoma detection. Proc. SPIE 8922, IX International Seminar on Medical Information Processing and Analysis - SIPAIM 2013, 89220M. Mexico D.F. (Mexico). 11-14 Noviembre (2013). doi:10.1117/12.2035530 [url]
A. Pastor López-Monroy, Manuel Montes-y-Gómez, Hugo Jair Escalante, Angel Cruz-Roa, Fabio A. González. Bag-of-Visual-Ngrams for Histopathology Image Classification. Proc. SPIE 8922, IX International Seminar on Medical Information Processing and Analysis - SIPAIM 2013, 89220P. Mexico D.F. (Mexico). 11-14 Noviembre (2013). doi:10.1117/12.2034113. [url]
Angel Cruz-Roa, John Arevalo, Anant Madabhushi, Fabio González. A Deep Learning Architecture for Image Representation, Visual Interpretability and Automated Basal-Cell Carcinoma Cancer Detection. MICCAI 2013, the 16th International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention. Nagoya (Japan), September 22-26 2013. Lectures Notes in Computer Sciences. Vol. 8150. pp 403-410. [poster][pdf][url] (Student Travel Award)
Angel Cruz Roa, Eduardo Romero Castro, Fabio González Osorio. An adaptive image representation learned from data for cervix cancer tumor detection. Digital Pathology Conference. SPIE Medical Imaging 2013, Volume 8676. 9 - 14 February 2013. Disney's Coronado Springs Resort, Lake Buena Vista (Orlando Area), Florida USA (Poster Award Cum Laude).[poster][url]
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Daniel Muñoz, Jorge Goyeneche, Angel Ricardo Márquez, Diana Lorena, Grajales, Oscar Alexander Gutierrez, Angel Cruz-Roa, César Díaz. Sistema de vigilancia entomológica de Aedes Aegypti basado en tecnologías mHealth, Web GIS y crowdsourcing. XIII Coloquio de investigación en Salud Pública, "Salud pública, educación y paz". Universidad de los Llanos, Sede Urbana. 23, 24 y 25 de Noviembre de 2017.
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Daniel Muñoz, Jorge Goyeneche, Angel Ricardo Márquez, Diana Lorena Grajales, Oscar Alexander Gutierrez, Angel Cruz-Roa, César Díaz. Diseño de un sistema de vigilancia entomológica de Aedes Aegypti basado en tecnologías m-Health, Web GIS y crowdsourcing. II Encuentro de Ciencia Tecnología e Innovación del Departamento del Meta "Innovando y construyendo territorio", Centro de Convenciones de la Universidad Santo Tomás, Campus Aguas Claras, Villavicencio, 27de Octubre de 2017.
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