Народознавчий центр виник у 1993 році з ініціативи доцента кафедри української та зарубіжної культури Мельничук Лідії Семенівни та при її безпосередній участі. Метою центру було прилучення майбутнього вчителя до пізнання, збереження та розбудови культурно-історичної спадщини свого народу і роду, активної краєзнавчої роботи. Центр розпочав свою роботу як спеціалізований кабінет українського народознавства, а з часом, за підтримки адміністрації навчального закладу, набув статусу загально університетського підрозділу. Лідія Семенівна розробила наукову концепцію створення народознавчого центру та етнографічного музею при ньому. Особисто вона разом зі студентами почала збирати матеріали, залучала викладачів та співробітників університету, народних майстрів Вінниччини, які допомагали порадами, консультаціями, збирали пам'ятки народної культури, передали в фонди чимало родинних реліквій.
У 1993-2005 рр. проведено понад 100 експедицій до відомих осередків народної культури Поділля.
На основі напрацьованих матеріалів в 1995-1999рр. було відкрито спеціалізації "українознавство" на музично-педагогічному та філологічному факультетах. Навчально-методична робота була спрямована на забезпечення кваліфікованого викладання курсу українського народознавства на всіх факультетах університету та циклу дисциплін спеціалізації. Вивчення предметів українознавчого циклу здійснюється з урахуванням специфіки факультетів та вимог до підготовки сучасного вчителя, який не тільки володіє своїм предметом, а й знає історію, культуру народу, є щирим патріотом України й розуміє суспільний характер своєї професії. У 2005 році було відкрито спеціалізацію "українознавство" в Інституті історії, етнології і права, а з 2007р. ця спеціалізація.
В 1995 році Мельничук Л.С. створила фольклорно-етнографічний колектив "Душі криниця" і була його першим керівником до 2000 року. В 1999 році колектив "Душі криниця" став дипломантом регіонального фестивалю "Перлинки Поділля" у Могилеві-Подільському. Сьогодні в основному складі фольклорно-етнографічного колективу "Душі криниця" майже 20 студентів університету - з Інституту історії, етнології і права, Інституту педагогіки і психології, Інституту філології й журналістики, музично-педагогічного факультету. Очолює колектив випускниця музично - педагогічного факультету спеціалізації "українознавство" працівник лабораторії Пірус К.Л.