公民館組織として、多くの団体が豊かな白保村の維持発展や伝統文化継承のために活動しています。

｜白保婦人会｜

満67歳までの女性で作る団体で100年以上の歴史があります。毎年選任される役員に加え、各班から2名の幹事が参加して社会教育・生活改善・環境保護・文化芸能などの面から社会貢献に取り組み、公民館活動に参加・協力して地域を支えています。石垣市女性連合会加盟団体。

｜白保老人クラブ｜

原則73歳以上の住民で作る団体です。お互いの親睦を図り健康・長寿を目指し、地域の知恵袋としてその経験や知識で公民館活動に貢献しています。石垣市老人クラブ連合会加盟団体。

｜白保青年会｜

白保在住の10代（高校生）から30代までの青年男女が中心となって作る団体です。白保最大の祭り“白保豊年祭”では旗頭の奉納を行います。公民館行事で地謡を務めるなど、文化・芸能をはじめ様々な公民館活動に参加・協力して地域を支えています。石垣市青年団協議会（石青協）加盟団体。

｜白保村ゆらてぃく憲章推進委員会｜

2006年に、白保村が次世代に守り伝えたいものを明確にし、村をあげてその保護、継承するための方針「白保村ゆらてぃく憲章」が白保公民館より制定されました。

そして憲章に定めた「村づくり七箇条」の実践活動を支援するとともに、地域社会の重要課題の解決に向けた事業を立案し、率先して行動することを目的とする団体として設立されました。

現在「白保村ゆらてぃく憲章推進委員会」には、白保方言を残す活動を担う「方言アヨウ部会」と、近年増加している観光客に対応し、白保地域の宿泊事業者が中心となって、白保における観光のあり方を考える「白保おやど部会」が活動しています。

｜しらほサンゴ村運営委員会｜

2000年4月WWFジャパン（公益財団法人世界自然保護基金ジャパン）が白保にサンゴ礁保護研究センター「しらほサンゴ村」を建設。南西諸島の自然を守る取り組みの一環として、貴重なサンゴ礁の保全活動に取り組んできました。そして、地域住民がより主体的に施設を運用しながら、さまざまな保全・地域活動を継続実施する体制へと移行することを目指して2021年4月に、「しらほサンゴ村」の施設を白保公民館に譲渡しました。現在は、白保公民館参加に置かれたしらほサンゴ村運営委員会と、委員会より委託を受けたNPO法人夏花によって、管理運営されています。

｜白保ハーリー組合｜

白保の漁業者の団体です。豊漁と航海安全のお礼とその祈願のために毎年旧暦の5月4日に行われる“白保海神祭”（白保ハーリー祭）を主催しています。

｜白保魚湧く海保全協議会｜

公式Facebookページ→白保魚湧く海保全協議会

2005年にサンゴ礁文化の保全・継承を目指して設立され、サンゴ礁の利用ルールの策定や赤土堆積調査などの多様な環境保全活動を行っています。

｜白保自主防災会｜

石垣市および市消防局と連携して、白保地域の防災・減災、緊急時の対応を担う住民組織です。公民館敷地内には発電機など緊急時に必要な備品が収納された防災倉庫が石垣市の補助で設置されており、これらの管理と使用を請け負っています。元消防局員も含まれ、万が一の時に地域を守る団体です。

｜白保棒術保存会｜

明治時代より村の若者が棒術の型を伝承、毎年旧暦8月15日に昔の役所“オーセ”（しらほサンゴ村の向かい）で奉納を行っています。白保の棒術は真剣な組手の“ケンカ棒”が特徴です。

｜白保獅子保存会｜