教員紹介

志賀  元紀 (Motoki Shiga)

所属・職位：
東北大学　未踏スケールデータアナリティクスセンター
データアナリティクス研究部門　教授
電子メール：motoki.shiga.b4（あっと）tohoku.ac.jp

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研究分野
統計的機械学習、データマイニング、バイオインフォマティクス、ケモインフォマティクス

所属学会
ISCB (International Society for Computational Biology),
 ACS (American Chemical Society) JSBi (Japanese Society for Bioinformatics),
 電子情報通信学会
人工知能学会 

職　　歴


常 勤

2023年4月〜現在 東北大学大学院　情報科学研究科 応用情報科学専攻　
 先端応用データ科学講座 （協力講座） 教授

2022年5月〜現在 東北大学　未踏スケールデータアナリティクスセンター　
 データアナリティクス部門 教授

2017年4月〜2022年4月 岐阜大学 工学部 電気電子・情報工学科 情報コース 准教授

2013年10月〜2017年3月 岐阜大学 工学部 電気電子・情報工学科 情報コース 助教（テニュアトラック）

2011年4月〜2013年9月 豊橋技術科学大学大学院 工学研究科 情報・知能工学系 知能情報学分野 助教

2008年4月〜2011年3月 京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンター
 生命情報マイニング先端研究プロジェクト（パスウェイ工学領域） 助教

2008年4月〜2011年3月 京都大学大学院 薬学研究科 医薬創成情報科学専攻 分子設計情報分野 助教

2006年4月〜2008年3月 京都大学 化学研究所 バイオインフォマティクスセンターパスウェイ工学領域 博士研究員


兼 任

2022年10月〜現在まで 大阪大学　超高圧電子顕微鏡センター 招へい教授

2022年7月〜現在まで 理化学研究所 革新知能統合研究センター 分子情報科学チーム 客員研究員

2022年7月〜現在まで 東京大学 生産技術研究所 リサーチフェロー

2022年4月〜2022年9月 大阪大学　超高圧電子顕微鏡センター 招へい准教授

2020年4月〜2022年4月 東海国立大学機構　航空宇宙研究教育拠点 研究開発部門 サイバー空間研究分野 准教授

2019年4月〜2022年4月 岐阜大学 研究推進・社会連携機構　人工知能研究推進センター 研究部門長

2018年5月〜2022年4月 理化学研究所 革新知能統合研究センター 分子情報科学チーム 客員研究員

2018年4月〜2022年4月 東京大学 生産技術研究所 リサーチフェロー

2016年10月〜2020年3月 科学技術振興機構 (JST) さきがけ研究者

2013年12月〜2015年3月 岐阜大学　研究推進・社会連携機構　人間医工学研究開発センター 助教


非常勤

2022年5月〜現在まで 岐阜大学 工学部、自然科学技術研究科　非常勤講師

2012年4月〜現在まで 京都大学大学院 薬学研究科 医薬創生情報科学専攻　非常勤講師

2012年4月〜2013年9月 岐阜大学 工学部　非常勤講師

学　　歴

2003年  4月〜2006年3月　　 岐阜大学大学院 工学研究科 電子情報システム工学専攻　　 博士後期課程・指導教官：横田康成 助教授（現在：教授）

2004年10月〜2005年2月 東京工業大学大学院 総合理工学研究科 知能システム科学専攻 研究指導委託（指導教官：渡辺澄夫 教授）

2001年4月〜2003年3月 岐阜大学大学院 工学研究科 応用情報学専攻 博士前期課程・指導教官：横田康成 助教授（現在：教授）

1997年4月〜2001年3月 岐阜大学 工学部 応用情報学科 卒業研究指導教官：横田康成 助教授（現在：教授）

1994年4月〜1997年3月 岐阜県立岐山高等学校 理数科

1991年4月〜1994年3月 岐阜市立岐北中学校

学会運営活動

委員等


査　読

Journal:

Advanced Structural and Chemical Imaging, Science and Technology of Advanced Materials (STAM), Journal of Computer Aided Chemistry, Journal of Machine Learning Research (JMLR), Scientific Reports, Ultramicroscopy, Science and Technology of Advanced Materials, Intelligent Data Analysis, Nano Letters, F1000Research, Pattern Recognition, Neurocomputing, BMC Bioinformatics, IEEE Access, IEEE Trans. on Knowledge and Data Engineering (TKDE), International Journal of Knowledge Discovery in Bioinformatics, BMC Systems Biology, 人工知能学会論文誌

Conference:

AAAI Conference on Airtificial Intelligence (AAAI) (2020), International Joint Conference on Artificial Intelligence and European Conference on Artificial Intelligence (IJCAI-ECAI) (2018-2019), International Conference on Artificial Intelligence and Statistics (AISTATS) (2014), European Conference on Machine Learning and Principles and Practice of Knowledge Discovery in Databases (ECML/PKDD) (2012) Neural Information Processing Systems (NIPS) (2012-2014, 2019), SIAM International Conference on Data Minig (SDM) (2011, 2013-2014), ACM SIGKDD Conference on Knowledge Discovery and Data Mining (KDD) (2013-2014), Pacific-Asia Conference on Knowledge Discovery and Data Mining (PAKDD) (2018-2019) Asia Pacific Bioinformatics Conference (2018), International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) (2011, 2014), International Workshop on Machine Learning in Systems Biology (MLSB) (2017), 

講義歴


２０１９年度

岐阜大学 工学部

①学部２年・確率統計応用（１コマ×１６回）

②学部３年・機械学習（１コマ×１６回）

③学部３年・情報工学セミナー（１コマ×１６回）



岐阜大学大学院 自然科学技術研究科

⑤修士課程１年・データマイニング特論（１コマ×８回）


岐阜大学大学院 工学研究科

⑥博士後期課程・統計的機械学習特論


京都大学大学院 薬学研究科（非常勤講師）

⑦創薬情報科学論

　５月２７日（月）「統計的機械学習I・II・Ⅲ」（3コマ）


２０１８年度

岐阜大学 工学部

①学部１年・初年次セミナー（全体取りまとめ及び「オリエンテーション」１コマ）

②学部２年・確率統計応用（１コマ×１６回）

③学部３年・機械学習（１コマ×１６回）

④学部３年・情報工学セミナー（１コマ×１６回）



岐阜大学大学院 自然科学技術研究科

⑤修士課程１年・データマイニング特論（１コマ×８回）


岐阜大学大学院 工学研究科

⑥博士後期課程・統計的機械学習特論


京都大学大学院 薬学研究科（非常勤講師）

⑦創薬情報科学論

　５月７日（月）「統計的機械学習I・II・Ⅲ」（3コマ）


２０１７年度

岐阜大学 工学部

①学部１年・初年次セミナー（「Python演習」１コマ、「研究紹介」１コマ）（１コマ×２回）

②学部２年・確率統計応用（１コマ×１６回）

③学部３年・情報工学セミナー（１コマ×１６回）



岐阜大学大学院 自然科学技術研究科

④修士課程１年・データマイニング特論（１コマ×８回）


京都大学大学院 薬学研究科（非常勤講師）

⑤創薬情報科学論

　５月８日（月）「統計的機械学習I・II」（2コマ）


２０１６年度

岐阜大学 工学部

①学部２年・確率統計応用（１コマ×１６回）

②学部３年・情報工学セミナー（１コマ×１６回）

③博士前期課程１年・データ解析特論（１コマ×１６回）



京都大学大学院 薬学研究科（非常勤講師）

④情報科学概論

　５月１７日（火）「機械学習概論」（１コマ×１回）

　

２０１５年度

岐阜大学 工学部

①学部１年・初年次セミナー「Pythonプログラミング」（１コマ×３回）

②学部１年・技術と技術者の倫理II「データ解析と研究論文作成における倫理」（１コマ×１回）

③学部２年・確率統計応用（１コマ×１６回）

④学部３年・情報工学セミナー（１コマ×１６回）

⑤博士前期課程１年・データ解析特論（１コマ×１６回）



京都大学大学院 薬学研究科（非常勤講師）

⑤情報科学概論

　５月１２日（火）「ネットワークマイニングⅢ」（１コマ×１回）

　

２０１４年度

岐阜大学 工学部

①学部１年・初年次セミナー「レポートの書き方」（１コマ×１回）

②学部２年・確率統計応用（１コマ×１６回）

③学部３年・応用情報セミナーII（１コマ×１６回）

④博士前期課程１年・データ解析特論（１コマ×１６回）



京都大学大学院 薬学研究科（非常勤講師）

⑤情報科学概論

　６月５日（木）「ネットワークマイニング」（１コマ×１回）

　

２０１３年度

豊橋技術科学大学 工学部　情報・知能工学系

①学部１年・前期　プログラミング演習Ⅰ（C言語の演習，１コマ×１５回）


②学部２年・前期　情報・知能工学基礎実験

　担当：PCの分解と組み立て（２コマ×２回）


京都大学大学院 薬学研究科（非常勤講師）

③情報科学概論／医薬創成ITビジネス特論

　５月７日（火）「ネットワークマイニング」（１コマ×１回）

　


岐阜大学 工学部

④学部１年・初年次セミナー

　６月１１日（火）「研究というお仕事」（１コマ×１回）

⑤学部３年・応用情報セミナーII（１コマ×１６回）

⑥博士前期課程１年・応用数理解析（１コマ×８回）



２０１２年度


豊橋技術科学大学 工学部　情報・知能工学系

①学部１年・前期　プログラミング演習Ⅰ（C言語の演習，１コマ×１５回）


②学部２年・前期　情報・知能工学基礎実験

　担当１：PCの分解と組み立て（２コマ×２回）

　担当２：論理回路Ⅰ（組み合わせ論理回路，２コマ×４回）

　担当３：論理回路Ⅱ（順序回路，２コマ×４回）


③学部３年・後期　情報・知能工学実験

　担当：PCM通信の基礎

（ハードウェアとMATLABによる実習，３コマ×８回＋２コマ×８回）


京都大学大学院 薬学研究科（非常勤講師）

④情報科学概論／医薬創成ITビジネス特論

　５月２９日（火）「ネットワークマイニング」（１コマ×１回）

　


岐阜大学 工学部（教養科目）（非常勤講師）

⑤現代テクノロジーの展開ⅠF

　６月５日（火）「研究というお仕事」（１コマ×１回）



２０１１年度

豊橋技術科学大学 工学部　情報・知能工学系

①学部２年前期　情報・知能工学基礎実験

（担当：論理回路Ⅰ・Ⅱ，２コマ×８回）


②学部３年後期　知能情報工学実験

（担当：分子情報工学コース，２コマ×１０回）



２００８〜２０１０年度

京都大学大学院 薬学研究科

情報科学概論

（医薬創成ITビジネス特論、バイオ情報技術概論、バイオインフォマティクス特論Ａ）

（担当：コンピュータ演習，１コマ×２回）