El tren Maya desde sus costrucciones se  a viston envuelto en muchos problemas como en el impacto economico, como el de biodiversidad, en la peninsula. El principal factor clave a este proyecto es el ex-precidinte de los Estados Unidos Mexicanos Andres López Obrador y la presidenta actual Claudia Sheinbaum Pardo. 

• 125 cenotes y barrenas afectadas

• Daños al ambiente de la península hasta eliminar el acuífero de la península, del que vive la fauna, la flora y los seres humanos

• Se dice que el Tren Maya se convirtió en un “elefante blanco”, proyectos que son onerosos para la sociedad y no tienen un beneficio que justifique el uso de recursos públicos para ello

• Desde hace 5 meses siguen las obras inconclusas, no hay tantas corridas

• Las comunidades por donde pasa el tren, los beneficios son nulos, los pobladores dicen que no es tren y no es maya, ya que para ellos no es para el pueblo maya y no cumple con el bienestar, ni la vida digna

• Se estima 5 décadas para ver el beneficio del tren