学術論文
Shinohara, M., Aoyama, C., Fujiwara, K., Watanabe, A., Ohmori, H., Uehara, Y., Takano M. (2011) Microbial mineralization of organic nitrogen into nitrate to allow the use of organic fertilizer in hydroponics. Soil Sci. and Plant Nutr. 57, 190-203.
Fujiwara, K., Aoyama, C., Takano, M., Shinohara, M. (2012) Suppression of Ralstonia solanacearum bacterial wilt disease by an organic hydroponic system. J. Gen. Plant Pathol. 78, 217-220.
Fujiwara, K., Iida, Y., Iwai, T., Aoyama, C., Inukai, R., Ando, A., Ogawa, J., Ohnishi, J., Terami, F., Takano, M., Shinohara, M. (2013) The rhizosphere microbial community in a multiple parallel mineralization system suppresses the pathogenic fungus Fusarium oxysporum. MicrobiologyOpen 2(6), 997-1009.
Kawamura-Aoyama, C., Fujiwara, K., Shinohara, M., Takano, M. (2014) Study on the Hydroponic Culture of Lettuce with Microbially Degraded Solid Food Waste as a Nitrate Source. JARQ 48(1), 71 – 76.
Yufita D. Chinta, Kazuki Kano, Ani Widiastuti, Masaru Fukahori, Shizuka Kawasaki, Yumi Eguchi, Hideyuki Misu, Hiromitsu Odani, Songying Zhou, Kazuhiko Narisawa, Kazuki Fujiwara, Makoto Shinohara, Tatsuo Sato (2014) Effect of corn steep liquor on lettuce root rot (Fusarium oxysporum f.sp lactucae) in hydroponic cultures. J. Sci. Food Agricul. 94(11) 2317-2323.
Yufita D. Chinta, Yumi Eguchi, Ani Widiastuti, Makoto Shinohara, Tatsuo Sato (2015) Organic hydroponics induces systemic resistance against the air-borne pathogen, Botrytis cinerea (gray mould). J. Plant Interactions, 10(1), 243-251.
Fujiwara, K., Iida, Y., Someya, N., Takano, M., Ohnishi, J., Terami, F., Shinohara, M. (2016) Emergence of antagonism against the pathogenic fungus Fusarium oxysporum by interplay among non-antagonistic bacteria in a hydroponics using multiple parallel mineralization. J. Phytopathol. 164, 853-862
Sakuntala Saijai, Akinori Ando, Ryuya Inukai, Makoto Shinohara, Jun Ogawa (2016) Analysis of microbial community and nitrogen transition with enriched nitrifying soil microbes for organic hydroponics. Biosci. Biotechnol. Biochem., 80(11) 2247-2254.
日本語文献
有機質肥料活用型養液栽培マニュアル 農研機構（２０１４）
土壌を創る 有機質肥料活用型養液栽培から誕生した技術 野菜茶業研究所ニュース（２０１５）
「渾沌（カオス）」の制御法…複合培養系を制御するコツ 生物工学会誌（２０１４）
有機質肥料活用型養液栽培の現状 ハイドロポニックス（２０１４）
有機質肥料活用型養液栽培が根の病害を抑えるしくみ 現代農業（２０１３）
硝酸発酵…土壌というカオスの解体 生物工学会誌（２０１３）
土を使わず有機質肥料だけで栽培できる新養液栽培技術 JST（２０１１）
有機肥料で養液栽培・・・可視化する「根」 化学と生物（２００８）
養液栽培における有機物を活用した根部病害抑止技術 植物防疫（２００７）