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Pasteur, Nrf Gallimard, 2022.
The Black Box of Biology: A History of the Molecular Revolution, Harvard University Press, 2020.
Une histoire de la biologie, Le seuil, 2016.
La Vie, l’Evolution et l’Histoire, Odile Jacob, 2011.
À quoi sert l'histoire des sciences ?, Quae, 2008.
Les secrets du vivant : Contre la pensée unique en biologie, La Découverte, 2005.
La vie expliquée ? 50 ans après la double hélice, Odile Jacob, 2003.
La Part des gènes, Odile Jacob,. 1998.
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L’Institut Pasteur : Contributions à son histoire, ed. M. Morange, La Découverte, 1991.
Une lecture du vivant: Histoire et épistémologie de la biologie moléculaire, Ciaco, 1986.
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Théories de l'évolution et hérédité dans Raison Présente Réduction et émergence dans les sciences, n° 191, 2014, p.41-48.
Ignorance de leur passé et mauvaise compréhension de leurs méthodes: le talon d'Achille des scientifiques contemporains dans Raison Présente La culture de l'ignorance, n°204, 2017, p.23-31.
Une nouvelle connaissance du vivant François Jacob, André Lwoff et Jacques Monod; sous la direction de Claude Debru, Michel Morange et Frédéric Worms Avant-propos de Pierre Nora; Éditions Rue d'Ulm/ presses de l'École normale supérieure; 2012
L'invention de la régulation génétique; Les Nobel 1965 (Jacob, Lwoff, Monod) et le modèle de l'opéron dans l'histoire de la biologie; sous la direction de Laurent Loison et Michel Morange, Éditions Rue d'Ulm/presses de l'École normale supérieure; 2017.