ในการด้านการดำเนินงาน ทางสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน วิทยาลัยการอาชีพกาญจนาภิเษกหนองจอก ได้ทำการแบ่งการทำงานออกเป็น 5 องค์ประกอบด้วยกัน