Beberapa lokasi terutama pada bagian dalam teluk didominasi oleh alga Sargassum yang sangat berlimpah dan hampir tidak ada lagi substrat karang hidup. Jumlah genera karang keras yang ditemukan adalah 26 genera, genus yang mendominasi adalah Porites dan Montipora. Dengan kondisi Proporsi tutupan alga ditemukan cukup tinggi sedangkan Nilai rata-rata tutupan karang sebesar 38%.

 
Keragaman jenis ikan karang ditemukan sebanyak 180 spesies, dari 78 Genus dan 30 Famili, dengan jenis famili paling banyak ditemui yaitu famili Pomacentridae dengan kondisi rata-rata kelimpahan ikan karang <5000 no.ha-1 , serta rata-rata nilai biomass ikan karang sebesar <300 kg.ha-1

terdapat 4 jenis mangrove yaitu Rhizophora mucronata, Rhizophora apiculata, Ceriops tagal, dan Sonneratia alba.